MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-7

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017412	T	6	6	46	51	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017412	A	6	6	66	71	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017412	T	6	6	164	169	0 %	100 %	0 %	0 %	387826749
4	NC_017412	A	6	6	233	238	100 %	0 %	0 %	0 %	387826749
5	NC_017412	A	6	6	240	245	100 %	0 %	0 %	0 %	387826749
6	NC_017412	A	6	6	251	256	100 %	0 %	0 %	0 %	387826749
7	NC_017412	T	6	6	399	404	0 %	100 %	0 %	0 %	387826749
8	NC_017412	A	6	6	454	459	100 %	0 %	0 %	0 %	387826749
9	NC_017412	T	7	7	540	546	0 %	100 %	0 %	0 %	387826749
10	NC_017412	T	7	7	642	648	0 %	100 %	0 %	0 %	387826749
11	NC_017412	T	6	6	923	928	0 %	100 %	0 %	0 %	387826750
12	NC_017412	A	7	7	959	965	100 %	0 %	0 %	0 %	387826750
13	NC_017412	A	6	6	1026	1031	100 %	0 %	0 %	0 %	387826750
14	NC_017412	T	8	8	1074	1081	0 %	100 %	0 %	0 %	387826750
15	NC_017412	T	6	6	1145	1150	0 %	100 %	0 %	0 %	387826750
16	NC_017412	T	8	8	1156	1163	0 %	100 %	0 %	0 %	387826750
17	NC_017412	T	7	7	1227	1233	0 %	100 %	0 %	0 %	387826750
18	NC_017412	T	6	6	1462	1467	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
19	NC_017412	A	6	6	1817	1822	100 %	0 %	0 %	0 %	387826751
20	NC_017412	T	6	6	1861	1866	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
21	NC_017412	A	6	6	2092	2097	100 %	0 %	0 %	0 %	387826751
22	NC_017412	T	6	6	2523	2528	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
23	NC_017412	T	7	7	2762	2768	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
24	NC_017412	T	6	6	2851	2856	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
25	NC_017412	A	6	6	2977	2982	100 %	0 %	0 %	0 %	387826751
26	NC_017412	T	6	6	3001	3006	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
27	NC_017412	T	6	6	3009	3014	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
28	NC_017412	T	6	6	3018	3023	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
29	NC_017412	T	6	6	3252	3257	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
30	NC_017412	T	6	6	3296	3301	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
31	NC_017412	T	6	6	3562	3567	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
32	NC_017412	T	8	8	3606	3613	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
33	NC_017412	T	8	8	3807	3814	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
34	NC_017412	T	6	6	4033	4038	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
35	NC_017412	A	6	6	4178	4183	100 %	0 %	0 %	0 %	387826751
36	NC_017412	T	7	7	4221	4227	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
37	NC_017412	T	6	6	4241	4246	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
38	NC_017412	A	8	8	4260	4267	100 %	0 %	0 %	0 %	387826751
39	NC_017412	A	6	6	4351	4356	100 %	0 %	0 %	0 %	387826751
40	NC_017412	T	6	6	4454	4459	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
41	NC_017412	T	6	6	4515	4520	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
42	NC_017412	A	9	9	4636	4644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017412	A	8	8	4660	4667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017412	A	7	7	4752	4758	100 %	0 %	0 %	0 %	387826752
45	NC_017412	A	6	6	4882	4887	100 %	0 %	0 %	0 %	387826752
46	NC_017412	T	8	8	5112	5119	0 %	100 %	0 %	0 %	387826753
47	NC_017412	T	8	8	5148	5155	0 %	100 %	0 %	0 %	387826753
48	NC_017412	A	6	6	5175	5180	100 %	0 %	0 %	0 %	387826753
49	NC_017412	T	6	6	5482	5487	0 %	100 %	0 %	0 %	387826753
50	NC_017412	T	6	6	5489	5494	0 %	100 %	0 %	0 %	387826753
51	NC_017412	T	6	6	5552	5557	0 %	100 %	0 %	0 %	387826753
52	NC_017412	A	6	6	5670	5675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63	NC_017412	A	7	7	6910	6916	100 %	0 %	0 %	0 %	387826755
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67	NC_017412	T	7	7	7182	7188	0 %	100 %	0 %	0 %	387826756
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70	NC_017412	T	6	6	7279	7284	0 %	100 %	0 %	0 %	387826756
71	NC_017412	T	6	6	7286	7291	0 %	100 %	0 %	0 %	387826756
72	NC_017412	T	6	6	7319	7324	0 %	100 %	0 %	0 %	387826756
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88	NC_017412	T	6	6	9886	9891	0 %	100 %	0 %	0 %	387826757
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91	NC_017412	T	9	9	11392	11400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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93	NC_017412	T	8	8	11599	11606	0 %	100 %	0 %	0 %	387826758
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99	NC_017412	T	6	6	14558	14563	0 %	100 %	0 %	0 %	387826763
100	NC_017412	T	7	7	14715	14721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_017412	T	6	6	16485	16490	0 %	100 %	0 %	0 %	387826766
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.