MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp36

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017411	ATTTTG	2	12	2055	2066	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017411	TTCTTT	2	12	3986	3997	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387826844
3	NC_017411	TTAATA	2	12	6077	6088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017411	CATATA	2	12	7607	7618	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387826846
5	NC_017411	TCTTAA	2	12	9438	9449	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017411	GTTTAT	2	12	9780	9791	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387826847
7	NC_017411	AAAAGA	2	12	9934	9945	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387826847
8	NC_017411	CAAGAG	2	12	10295	10306	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387826847
9	NC_017411	AATCAA	2	12	11107	11118	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387826848
10	NC_017411	TAAAAA	2	12	13966	13977	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826851
11	NC_017411	TCAAAA	2	12	14849	14860	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017411	AAAGGT	2	12	15496	15507	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387826852
13	NC_017411	AGAGGA	2	12	15873	15884	50 %	0 %	50 %	0 %	387826852
14	NC_017411	AATTTA	2	12	16738	16749	50 %	50 %	0 %	0 %	387826853
15	NC_017411	TATTAC	2	12	18197	18208	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.