MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp36

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017411	TATAA	2	10	419	428	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017411	TAATA	2	10	432	441	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017411	ATTGA	2	10	1322	1331	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017411	TAAAC	2	10	1334	1343	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017411	TAAGC	2	10	5176	5185	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017411	ATTTA	2	10	9341	9350	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017411	ATTTT	2	10	9637	9646	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017411	ATTAA	2	10	9734	9743	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017411	AATAA	2	10	10410	10419	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017411	AGAAT	2	10	13117	13126	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017411	TTTAT	2	10	14512	14521	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017411	TTAGT	2	10	15201	15210	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017411	AGAAA	2	10	16849	16858	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017411	ATTAT	2	10	17516	17525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017411	AATAT	2	10	18646	18655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017411	ATATT	2	10	19155	19164	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017411	TCTTT	2	10	19715	19724	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.