MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp36

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017411	AGTT	2	8	247	254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017411	ATGG	2	8	457	464	25 %	25 %	50 %	0 %	387826841
3	NC_017411	AAAT	2	8	1049	1056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017411	CAAA	2	8	1119	1126	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017411	TATT	2	8	1396	1403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017411	GATT	2	8	1717	1724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017411	ATTC	2	8	1967	1974	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017411	TATT	2	8	2009	2016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017411	CAAA	2	8	2179	2186	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017411	CTCA	2	8	2494	2501	25 %	25 %	0 %	50 %	387826842
11	NC_017411	ATTA	2	8	2824	2831	50 %	50 %	0 %	0 %	387826842
12	NC_017411	TAAT	2	8	3793	3800	50 %	50 %	0 %	0 %	387826843
13	NC_017411	TAAG	2	8	3926	3933	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017411	TATT	2	8	4033	4040	25 %	75 %	0 %	0 %	387826844
15	NC_017411	TAAA	2	8	4067	4074	75 %	25 %	0 %	0 %	387826844
16	NC_017411	TAAT	2	8	4842	4849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017411	TAAT	2	8	5573	5580	50 %	50 %	0 %	0 %	387826845
18	NC_017411	ATTT	2	8	6058	6065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017411	TTTA	2	8	6396	6403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017411	ATTT	2	8	6440	6447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017411	TAAA	2	8	6466	6473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017411	ATAA	2	8	6558	6565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017411	TAAA	2	8	7064	7071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017411	GCTA	2	8	7246	7253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017411	TATT	2	8	7274	7281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017411	ATAA	2	8	7447	7454	75 %	25 %	0 %	0 %	387826846
27	NC_017411	ATTT	2	8	7458	7465	25 %	75 %	0 %	0 %	387826846
28	NC_017411	ATAA	2	8	7742	7749	75 %	25 %	0 %	0 %	387826846
29	NC_017411	TAAA	2	8	7941	7948	75 %	25 %	0 %	0 %	387826846
30	NC_017411	GAAG	2	8	8117	8124	50 %	0 %	50 %	0 %	387826846
31	NC_017411	GCAT	2	8	8306	8313	25 %	25 %	25 %	25 %	387826846
32	NC_017411	ATAA	2	8	8408	8415	75 %	25 %	0 %	0 %	387826846
33	NC_017411	TGAT	2	8	8601	8608	25 %	50 %	25 %	0 %	387826846
34	NC_017411	ATAA	2	8	9302	9309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017411	AATA	2	8	9387	9394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017411	TTGT	2	8	9425	9432	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017411	ATTA	2	8	9457	9464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017411	AAAT	2	8	9536	9543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017411	ATTA	2	8	9661	9668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017411	TAAA	2	8	9720	9727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017411	TAGA	2	8	10311	10318	50 %	25 %	25 %	0 %	387826847
42	NC_017411	TAAT	2	8	10624	10631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017411	TTTC	2	8	10774	10781	0 %	75 %	0 %	25 %	387826848
44	NC_017411	AAAT	2	8	11221	11228	75 %	25 %	0 %	0 %	387826848
45	NC_017411	ATCA	2	8	11354	11361	50 %	25 %	0 %	25 %	387826848
46	NC_017411	ATTT	2	8	11478	11485	25 %	75 %	0 %	0 %	387826848
47	NC_017411	AAAT	2	8	11779	11786	75 %	25 %	0 %	0 %	387826849
48	NC_017411	AAGT	2	8	11826	11833	50 %	25 %	25 %	0 %	387826849
49	NC_017411	TTTG	2	8	11848	11855	0 %	75 %	25 %	0 %	387826849
50	NC_017411	ACTA	2	8	11866	11873	50 %	25 %	0 %	25 %	387826849
51	NC_017411	CTTT	2	8	12430	12437	0 %	75 %	0 %	25 %	387826850
52	NC_017411	TCTT	2	8	12456	12463	0 %	75 %	0 %	25 %	387826850
53	NC_017411	TTTA	2	8	12797	12804	25 %	75 %	0 %	0 %	387826850
54	NC_017411	AATA	2	8	13127	13134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017411	GAAA	2	8	13435	13442	75 %	0 %	25 %	0 %	387826851
56	NC_017411	AAAT	2	8	13833	13840	75 %	25 %	0 %	0 %	387826851
57	NC_017411	ACAA	2	8	13856	13863	75 %	0 %	0 %	25 %	387826851
58	NC_017411	AATA	2	8	14030	14037	75 %	25 %	0 %	0 %	387826851
59	NC_017411	TTAA	2	8	14066	14073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017411	TAAT	2	8	14231	14238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017411	TTTA	2	8	14246	14253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017411	ACTC	2	8	14290	14297	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017411	TCCT	2	8	14632	14639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017411	TTTA	2	8	15066	15073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017411	AAAG	2	8	15159	15166	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017411	ATAA	2	8	15184	15191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017411	AGAA	2	8	15517	15524	75 %	0 %	25 %	0 %	387826852
68	NC_017411	AAGT	2	8	16169	16176	50 %	25 %	25 %	0 %	387826852
69	NC_017411	ATTT	2	8	16680	16687	25 %	75 %	0 %	0 %	387826853
70	NC_017411	AATA	2	8	17587	17594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017411	TATT	2	8	17735	17742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017411	CTCC	2	8	18282	18289	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_017411	AAGA	2	8	18788	18795	75 %	0 %	25 %	0 %	387826856
74	NC_017411	AGTA	2	8	19263	19270	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017411	ACAT	2	8	19497	19504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017411	TAGA	2	8	19541	19548	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017411	AATA	2	8	19844	19851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017411	TACT	2	8	19881	19888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017411	GATA	2	8	20319	20326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017411	TCTT	2	8	20356	20363	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017411	TATT	2	8	20793	20800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017411	TCAT	2	8	20849	20856	25 %	50 %	0 %	25 %	387826857
83	NC_017411	AATT	2	8	21121	21128	50 %	50 %	0 %	0 %	387826857
84	NC_017411	TATT	2	8	21193	21200	25 %	75 %	0 %	0 %	387826857
85	NC_017411	AAAG	2	8	21498	21505	75 %	0 %	25 %	0 %	387826857
86	NC_017411	TTTC	2	8	21719	21726	0 %	75 %	0 %	25 %	387826858
87	NC_017411	CCAA	2	8	22232	22239	50 %	0 %	0 %	50 %	387826858
88	NC_017411	TACC	2	8	22259	22266	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017411	AGAT	2	8	22343	22350	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017411	TTGT	2	8	22572	22579	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017411	GTTT	2	8	22740	22747	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.