MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp36

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017411	ATGG	2	8	457	464	25 %	25 %	50 %	0 %	387826841
2	NC_017411	CTCA	2	8	2494	2501	25 %	25 %	0 %	50 %	387826842
3	NC_017411	ATTA	2	8	2824	2831	50 %	50 %	0 %	0 %	387826842
4	NC_017411	TAAT	2	8	3793	3800	50 %	50 %	0 %	0 %	387826843
5	NC_017411	TATT	2	8	4033	4040	25 %	75 %	0 %	0 %	387826844
6	NC_017411	TAAA	2	8	4067	4074	75 %	25 %	0 %	0 %	387826844
7	NC_017411	TAAT	2	8	5573	5580	50 %	50 %	0 %	0 %	387826845
8	NC_017411	ATAA	2	8	7447	7454	75 %	25 %	0 %	0 %	387826846
9	NC_017411	ATTT	2	8	7458	7465	25 %	75 %	0 %	0 %	387826846
10	NC_017411	ATAA	2	8	7742	7749	75 %	25 %	0 %	0 %	387826846
11	NC_017411	TAAA	2	8	7941	7948	75 %	25 %	0 %	0 %	387826846
12	NC_017411	GAAG	2	8	8117	8124	50 %	0 %	50 %	0 %	387826846
13	NC_017411	GCAT	2	8	8306	8313	25 %	25 %	25 %	25 %	387826846
14	NC_017411	ATAA	2	8	8408	8415	75 %	25 %	0 %	0 %	387826846
15	NC_017411	TGAT	2	8	8601	8608	25 %	50 %	25 %	0 %	387826846
16	NC_017411	TAGA	2	8	10311	10318	50 %	25 %	25 %	0 %	387826847
17	NC_017411	TTTC	2	8	10774	10781	0 %	75 %	0 %	25 %	387826848
18	NC_017411	AAAT	2	8	11221	11228	75 %	25 %	0 %	0 %	387826848
19	NC_017411	ATCA	2	8	11354	11361	50 %	25 %	0 %	25 %	387826848
20	NC_017411	ATTT	2	8	11478	11485	25 %	75 %	0 %	0 %	387826848
21	NC_017411	AAAT	2	8	11779	11786	75 %	25 %	0 %	0 %	387826849
22	NC_017411	AAGT	2	8	11826	11833	50 %	25 %	25 %	0 %	387826849
23	NC_017411	TTTG	2	8	11848	11855	0 %	75 %	25 %	0 %	387826849
24	NC_017411	ACTA	2	8	11866	11873	50 %	25 %	0 %	25 %	387826849
25	NC_017411	CTTT	2	8	12430	12437	0 %	75 %	0 %	25 %	387826850
26	NC_017411	TCTT	2	8	12456	12463	0 %	75 %	0 %	25 %	387826850
27	NC_017411	TTTA	2	8	12797	12804	25 %	75 %	0 %	0 %	387826850
28	NC_017411	GAAA	2	8	13435	13442	75 %	0 %	25 %	0 %	387826851
29	NC_017411	AAAT	2	8	13833	13840	75 %	25 %	0 %	0 %	387826851
30	NC_017411	ACAA	2	8	13856	13863	75 %	0 %	0 %	25 %	387826851
31	NC_017411	AATA	2	8	14030	14037	75 %	25 %	0 %	0 %	387826851
32	NC_017411	AGAA	2	8	15517	15524	75 %	0 %	25 %	0 %	387826852
33	NC_017411	AAGT	2	8	16169	16176	50 %	25 %	25 %	0 %	387826852
34	NC_017411	ATTT	2	8	16680	16687	25 %	75 %	0 %	0 %	387826853
35	NC_017411	AAGA	2	8	18788	18795	75 %	0 %	25 %	0 %	387826856
36	NC_017411	TCAT	2	8	20849	20856	25 %	50 %	0 %	25 %	387826857
37	NC_017411	AATT	2	8	21121	21128	50 %	50 %	0 %	0 %	387826857
38	NC_017411	TATT	2	8	21193	21200	25 %	75 %	0 %	0 %	387826857
39	NC_017411	AAAG	2	8	21498	21505	75 %	0 %	25 %	0 %	387826857
40	NC_017411	TTTC	2	8	21719	21726	0 %	75 %	0 %	25 %	387826858
41	NC_017411	CCAA	2	8	22232	22239	50 %	0 %	0 %	50 %	387826858

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.