MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp36

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017411	ATT	2	6	57	62	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017411	CAA	2	6	132	137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017411	ATA	2	6	179	184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017411	TAT	2	6	218	223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017411	ATT	2	6	277	282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017411	TAC	3	9	316	324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017411	TAT	2	6	897	902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017411	AAT	2	6	1013	1018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017411	TAA	2	6	1093	1098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017411	ATT	3	9	1101	1109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017411	AGA	2	6	1175	1180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017411	TAA	2	6	1202	1207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017411	TCT	2	6	1246	1251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017411	AGA	2	6	1256	1261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017411	TAA	3	9	1372	1380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017411	AAT	2	6	1498	1503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017411	AAT	2	6	1508	1513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017411	TAA	2	6	1835	1840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017411	ATA	2	6	1933	1938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017411	TAA	2	6	1941	1946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017411	AGG	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017411	ATT	2	6	2237	2242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017411	AAT	2	6	2269	2274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017411	TTA	2	6	2406	2411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017411	CCT	2	6	3199	3204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017411	CTT	2	6	3352	3357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017411	TTA	2	6	3845	3850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017411	CTG	2	6	4142	4147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017411	TGT	2	6	4213	4218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017411	TAG	2	6	4232	4237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017411	TAT	2	6	4285	4290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017411	TCT	2	6	4394	4399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017411	ACC	2	6	4463	4468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017411	TAA	2	6	4518	4523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017411	TGA	2	6	4555	4560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017411	CTC	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017411	TCA	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017411	GAA	2	6	4888	4893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017411	ATG	2	6	5143	5148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017411	CAA	2	6	5189	5194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017411	CCT	2	6	6019	6024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017411	AAT	2	6	6031	6036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017411	TAG	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017411	CAT	2	6	6204	6209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017411	AAG	2	6	6221	6226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017411	ATT	2	6	6262	6267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017411	TAT	2	6	6341	6346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017411	TAT	2	6	6354	6359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017411	ATT	2	6	6419	6424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017411	TAA	3	9	6578	6586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017411	AGA	2	6	6698	6703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017411	AAG	2	6	6804	6809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017411	TAA	2	6	6815	6820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017411	AAT	2	6	6866	6871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017411	TTA	2	6	6907	6912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017411	AAC	2	6	6969	6974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017411	ATT	2	6	6996	7001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017411	ATT	2	6	7058	7063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017411	ATT	2	6	7138	7143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017411	CGA	2	6	7327	7332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017411	TAT	2	6	7418	7423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017411	ATT	2	6	9107	9112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017411	TTA	2	6	9184	9189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017411	ATT	2	6	9200	9205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017411	AGT	2	6	9266	9271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017411	TAA	2	6	9317	9322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017411	TCT	2	6	9380	9385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017411	ATT	2	6	9679	9684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017411	TAA	2	6	9695	9700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017411	TAC	2	6	10399	10404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017411	CTT	2	6	10441	10446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017411	ATA	2	6	12971	12976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017411	TCT	2	6	12985	12990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017411	TAT	2	6	13073	13078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017411	TAA	2	6	13102	13107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017411	AAT	2	6	13149	13154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017411	AAT	2	6	13258	13263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017411	AAT	2	6	13290	13295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017411	TAT	2	6	13322	13327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017411	TTA	2	6	13344	13349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017411	GTT	2	6	14103	14108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017411	TTA	2	6	14341	14346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017411	CAA	2	6	14362	14367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017411	CAC	2	6	14392	14397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017411	TTA	2	6	14431	14436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017411	ATA	2	6	14481	14486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017411	TCT	2	6	14541	14546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017411	GAA	2	6	14568	14573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017411	TAG	2	6	14679	14684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017411	TAA	2	6	15106	15111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017411	ATT	2	6	15211	15216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017411	TAA	2	6	15230	15235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017411	TAA	2	6	15249	15254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017411	TTA	2	6	15262	15267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017411	ATA	2	6	16423	16428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017411	AAT	2	6	16456	16461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017411	AGA	2	6	16961	16966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017411	AAT	2	6	17184	17189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017411	TAC	2	6	17303	17308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017411	TAT	2	6	17322	17327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017411	ATT	3	9	17356	17364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017411	ATA	2	6	17405	17410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017411	TAA	2	6	17510	17515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017411	TAA	2	6	17553	17558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017411	TTA	2	6	17667	17672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017411	TTG	2	6	17698	17703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017411	CTA	2	6	17713	17718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017411	ATT	2	6	17778	17783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017411	ATT	2	6	17829	17834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017411	AAT	2	6	17884	17889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017411	ATA	2	6	18138	18143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017411	TTC	2	6	18263	18268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017411	CTT	2	6	18309	18314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017411	ATT	2	6	18398	18403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017411	TAA	2	6	18443	18448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017411	TAT	2	6	18459	18464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017411	AAT	2	6	18531	18536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017411	ATT	2	6	18609	18614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017411	ATA	2	6	18662	18667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017411	TAA	2	6	19011	19016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017411	TTA	2	6	19115	19120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017411	GTA	3	9	19126	19134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017411	TGA	2	6	19146	19151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017411	ATC	2	6	19289	19294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017411	CAT	2	6	19414	19419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017411	GTT	2	6	19425	19430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017411	ACT	2	6	19434	19439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017411	ACT	2	6	19491	19496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017411	TAA	2	6	19691	19696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017411	GAT	2	6	19857	19862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017411	ATA	2	6	19990	19995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017411	ATC	2	6	19999	20004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017411	CTA	3	9	20016	20024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017411	TAA	2	6	20031	20036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017411	ATT	2	6	20134	20139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017411	TTC	2	6	20299	20304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017411	ATA	2	6	20349	20354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017411	TTA	2	6	20464	20469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017411	ATT	2	6	20476	20481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017411	AAG	2	6	20682	20687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017411	TAC	2	6	22268	22273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017411	TGT	2	6	22284	22289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017411	TTA	2	6	22318	22323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017411	ATT	2	6	22397	22402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017411	TAT	3	9	22429	22437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017411	TAA	2	6	22529	22534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017411	TAA	2	6	22588	22593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.