MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp36

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017411	ATT	2	6	567	572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826841
2	NC_017411	TAA	2	6	605	610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826841
3	NC_017411	TGT	2	6	721	726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826841
4	NC_017411	AGA	2	6	783	788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826841
5	NC_017411	TTG	2	6	789	794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826841
6	NC_017411	ATT	2	6	2440	2445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826842
7	NC_017411	TGC	2	6	2467	2472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826842
8	NC_017411	GTC	2	6	2527	2532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826842
9	NC_017411	TAC	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826842
10	NC_017411	TTC	2	6	2780	2785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826842
11	NC_017411	TGA	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826842
12	NC_017411	GAG	2	6	2889	2894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826842
13	NC_017411	ATC	2	6	2968	2973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826842
14	NC_017411	TCA	2	6	3113	3118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826842
15	NC_017411	ATT	2	6	3149	3154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826842
16	NC_017411	AAT	2	6	3604	3609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826843
17	NC_017411	ATT	2	6	3980	3985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826844
18	NC_017411	ATA	2	6	5325	5330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826845
19	NC_017411	GAA	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826845
20	NC_017411	CTG	2	6	5615	5620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826845
21	NC_017411	ATT	2	6	5790	5795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826845
22	NC_017411	TTA	2	6	5800	5805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826845
23	NC_017411	AGA	2	6	5853	5858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826845
24	NC_017411	TGA	2	6	5952	5957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826845
25	NC_017411	TAA	2	6	7495	7500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826846
26	NC_017411	TGC	2	6	7584	7589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826846
27	NC_017411	TAG	2	6	7656	7661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826846
28	NC_017411	CTT	2	6	7788	7793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826846
29	NC_017411	TGA	2	6	7863	7868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826846
30	NC_017411	GAT	2	6	7874	7879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826846
31	NC_017411	TAA	2	6	7969	7974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826846
32	NC_017411	GTT	2	6	7976	7981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826846
33	NC_017411	AGA	2	6	8068	8073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826846
34	NC_017411	TGA	2	6	8206	8211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826846
35	NC_017411	GTT	2	6	8347	8352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826846
36	NC_017411	CTG	2	6	8367	8372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826846
37	NC_017411	ATG	2	6	8445	8450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826846
38	NC_017411	TAA	2	6	8469	8474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826846
39	NC_017411	GAT	2	6	8548	8553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826846
40	NC_017411	ATT	2	6	8582	8587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826846
41	NC_017411	TAA	2	6	8670	8675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826846
42	NC_017411	CAT	2	6	8776	8781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826846
43	NC_017411	TTG	2	6	8784	8789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826846
44	NC_017411	ATG	2	6	8796	8801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826846
45	NC_017411	ATC	2	6	8828	8833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826846
46	NC_017411	TAA	2	6	8877	8882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826846
47	NC_017411	TGA	2	6	8989	8994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826846
48	NC_017411	ATT	2	6	9093	9098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826846
49	NC_017411	TAT	2	6	9766	9771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826847
50	NC_017411	TAA	2	6	9973	9978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826847
51	NC_017411	AGA	2	6	10007	10012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826847
52	NC_017411	CTT	2	6	10034	10039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826847
53	NC_017411	AAT	3	9	10076	10084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826847
54	NC_017411	TTA	2	6	10124	10129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826847
55	NC_017411	ATA	2	6	10140	10145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826847
56	NC_017411	GCG	2	6	10230	10235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387826847
57	NC_017411	GAT	2	6	10253	10258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826847
58	NC_017411	GAA	2	6	10334	10339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826847
59	NC_017411	GAA	2	6	10343	10348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826847
60	NC_017411	AGA	3	9	10351	10359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826847
61	NC_017411	TAA	2	6	10767	10772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826848
62	NC_017411	AAG	2	6	10783	10788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826848
63	NC_017411	CTT	2	6	10876	10881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826848
64	NC_017411	TAA	2	6	10909	10914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826848
65	NC_017411	ATT	2	6	10967	10972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826848
66	NC_017411	CTA	2	6	11079	11084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826848
67	NC_017411	TAT	2	6	11096	11101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826848
68	NC_017411	AAT	2	6	11153	11158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826848
69	NC_017411	ATC	2	6	11174	11179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826848
70	NC_017411	TTA	2	6	11316	11321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826848
71	NC_017411	AAG	2	6	11326	11331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826848
72	NC_017411	CTC	2	6	11428	11433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826848
73	NC_017411	GGT	2	6	11578	11583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826849
74	NC_017411	TAT	2	6	11691	11696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826849
75	NC_017411	GAA	2	6	11788	11793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826849
76	NC_017411	TTA	2	6	11810	11815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826849
77	NC_017411	CTA	2	6	11906	11911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826849
78	NC_017411	TTC	2	6	11917	11922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826849
79	NC_017411	ATT	2	6	12029	12034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826850
80	NC_017411	TAG	2	6	12088	12093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826850
81	NC_017411	AAT	2	6	12241	12246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826850
82	NC_017411	TAA	2	6	12266	12271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826850
83	NC_017411	TTA	2	6	12357	12362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826850
84	NC_017411	TGT	2	6	12375	12380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826850
85	NC_017411	TTA	2	6	12381	12386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826850
86	NC_017411	TGA	3	9	12714	12722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826850
87	NC_017411	ATA	2	6	12810	12815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826850
88	NC_017411	ATT	2	6	12822	12827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826850
89	NC_017411	TTA	2	6	12858	12863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826850
90	NC_017411	ATA	2	6	13518	13523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826851
91	NC_017411	TAA	2	6	13539	13544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826851
92	NC_017411	GAT	2	6	13586	13591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826851
93	NC_017411	ATG	2	6	13656	13661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826851
94	NC_017411	AAG	2	6	13842	13847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826851
95	NC_017411	TAA	2	6	13890	13895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826851
96	NC_017411	TAA	2	6	15585	15590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826852
97	NC_017411	GAA	2	6	15625	15630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826852
98	NC_017411	ATT	2	6	15645	15650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826852
99	NC_017411	ACA	2	6	15690	15695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826852
100	NC_017411	GTG	2	6	15749	15754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826852
101	NC_017411	GGA	2	6	15759	15764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826852
102	NC_017411	TGA	2	6	15864	15869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826852
103	NC_017411	TAT	2	6	15895	15900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826852
104	NC_017411	ATG	2	6	15911	15916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826852
105	NC_017411	CAA	2	6	16040	16045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826852
106	NC_017411	AGA	2	6	16101	16106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826852
107	NC_017411	AGA	2	6	16125	16130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826852
108	NC_017411	TTA	2	6	16153	16158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826852
109	NC_017411	GCA	2	6	16186	16191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826852
110	NC_017411	TTA	2	6	16327	16332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826852
111	NC_017411	AAG	2	6	16349	16354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826852
112	NC_017411	GAA	2	6	16620	16625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826853
113	NC_017411	TAA	2	6	16667	16672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826853
114	NC_017411	ATT	2	6	17140	17145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826854
115	NC_017411	GAT	2	6	17905	17910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826855
116	NC_017411	ATA	2	6	18011	18016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826855
117	NC_017411	TTC	2	6	18033	18038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826855
118	NC_017411	TAA	2	6	18066	18071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826855
119	NC_017411	TAA	2	6	18682	18687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826856
120	NC_017411	TTA	2	6	18796	18801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826856
121	NC_017411	TTA	2	6	18821	18826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826856
122	NC_017411	AGA	2	6	18846	18851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826856
123	NC_017411	TTA	2	6	20898	20903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826857
124	NC_017411	TAA	2	6	20906	20911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826857
125	NC_017411	AAT	2	6	21043	21048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826857
126	NC_017411	TTC	2	6	21170	21175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826857
127	NC_017411	TAT	2	6	21239	21244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826857
128	NC_017411	ACC	2	6	21437	21442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826857
129	NC_017411	TTG	2	6	21751	21756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826858
130	NC_017411	TAT	2	6	21882	21887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826858
131	NC_017411	AAC	2	6	21911	21916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826858
132	NC_017411	TTA	2	6	21962	21967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826858
133	NC_017411	CTC	2	6	21973	21978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826858
134	NC_017411	ACT	2	6	22132	22137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826858
135	NC_017411	TTC	2	6	22138	22143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826858
136	NC_017411	AAC	2	6	22194	22199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826858
137	NC_017411	TGC	2	6	22213	22218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826858
138	NC_017411	TAT	2	6	22219	22224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826858

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.