MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp36

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017411	A	6	6	66	71	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017411	A	6	6	140	145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017411	A	6	6	161	166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017411	A	7	7	388	394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017411	A	7	7	398	404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017411	A	6	6	495	500	100 %	0 %	0 %	0 %	387826841
7	NC_017411	A	7	7	695	701	100 %	0 %	0 %	0 %	387826841
8	NC_017411	T	7	7	1181	1187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017411	A	6	6	1264	1269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017411	A	6	6	1414	1419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017411	A	8	8	1433	1440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017411	T	6	6	1481	1486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017411	T	6	6	1572	1577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017411	T	7	7	1723	1729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017411	A	7	7	1804	1810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017411	T	6	6	1975	1980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017411	A	11	11	2151	2161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017411	A	7	7	2320	2326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017411	T	8	8	2347	2354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017411	T	6	6	2533	2538	0 %	100 %	0 %	0 %	387826842
21	NC_017411	T	6	6	2853	2858	0 %	100 %	0 %	0 %	387826842
22	NC_017411	T	7	7	2930	2936	0 %	100 %	0 %	0 %	387826842
23	NC_017411	T	6	6	2950	2955	0 %	100 %	0 %	0 %	387826842
24	NC_017411	T	6	6	3024	3029	0 %	100 %	0 %	0 %	387826842
25	NC_017411	T	7	7	3300	3306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017411	T	6	6	3330	3335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017411	T	7	7	3361	3367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017411	T	6	6	3372	3377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017411	T	6	6	3392	3397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017411	T	7	7	3413	3419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017411	T	7	7	3421	3427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017411	A	6	6	3661	3666	100 %	0 %	0 %	0 %	387826843
33	NC_017411	T	8	8	3669	3676	0 %	100 %	0 %	0 %	387826843
34	NC_017411	T	6	6	3778	3783	0 %	100 %	0 %	0 %	387826843
35	NC_017411	T	7	7	3815	3821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017411	T	6	6	3897	3902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017411	T	6	6	3904	3909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017411	A	6	6	3955	3960	100 %	0 %	0 %	0 %	387826844
39	NC_017411	A	6	6	4644	4649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017411	A	6	6	4718	4723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017411	A	7	7	4737	4743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017411	A	6	6	4815	4820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017411	A	6	6	5067	5072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017411	A	6	6	5158	5163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017411	A	6	6	5296	5301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017411	T	8	8	5357	5364	0 %	100 %	0 %	0 %	387826845
47	NC_017411	C	6	6	5559	5564	0 %	0 %	0 %	100 %	387826845
48	NC_017411	T	7	7	5608	5614	0 %	100 %	0 %	0 %	387826845
49	NC_017411	T	6	6	5638	5643	0 %	100 %	0 %	0 %	387826845
50	NC_017411	A	9	9	5758	5766	100 %	0 %	0 %	0 %	387826845
51	NC_017411	T	6	6	5926	5931	0 %	100 %	0 %	0 %	387826845
52	NC_017411	A	6	6	6148	6153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017411	A	7	7	6287	6293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017411	A	8	8	6406	6413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017411	T	7	7	6433	6439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017411	A	6	6	6501	6506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017411	A	6	6	6516	6521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017411	A	9	9	6888	6896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017411	T	6	6	6954	6959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017411	T	6	6	7254	7259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017411	T	6	6	7267	7272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017411	A	6	6	7288	7293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017411	T	6	6	7339	7344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017411	A	6	6	7554	7559	100 %	0 %	0 %	0 %	387826846
65	NC_017411	A	7	7	7754	7760	100 %	0 %	0 %	0 %	387826846
66	NC_017411	T	9	9	7772	7780	0 %	100 %	0 %	0 %	387826846
67	NC_017411	A	6	6	8174	8179	100 %	0 %	0 %	0 %	387826846
68	NC_017411	T	6	6	8285	8290	0 %	100 %	0 %	0 %	387826846
69	NC_017411	A	6	6	8507	8512	100 %	0 %	0 %	0 %	387826846
70	NC_017411	A	6	6	8716	8721	100 %	0 %	0 %	0 %	387826846
71	NC_017411	G	6	6	8842	8847	0 %	0 %	100 %	0 %	387826846
72	NC_017411	A	6	6	8868	8873	100 %	0 %	0 %	0 %	387826846
73	NC_017411	A	7	7	9123	9129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017411	A	6	6	9134	9139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017411	T	6	6	9173	9178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017411	T	6	6	9223	9228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017411	C	6	6	9404	9409	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_017411	T	8	8	9512	9519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017411	A	6	6	9548	9553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017411	T	6	6	9616	9621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017411	A	7	7	9647	9653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017411	A	6	6	9699	9704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017411	A	6	6	9758	9763	100 %	0 %	0 %	0 %	387826847
84	NC_017411	T	6	6	9810	9815	0 %	100 %	0 %	0 %	387826847
85	NC_017411	A	6	6	10022	10027	100 %	0 %	0 %	0 %	387826847
86	NC_017411	A	6	6	10085	10090	100 %	0 %	0 %	0 %	387826847
87	NC_017411	A	7	7	10102	10108	100 %	0 %	0 %	0 %	387826847
88	NC_017411	A	6	6	10175	10180	100 %	0 %	0 %	0 %	387826847
89	NC_017411	A	6	6	10199	10204	100 %	0 %	0 %	0 %	387826847
90	NC_017411	T	6	6	10562	10567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017411	T	6	6	10587	10592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017411	T	6	6	10740	10745	0 %	100 %	0 %	0 %	387826848
93	NC_017411	T	6	6	11369	11374	0 %	100 %	0 %	0 %	387826848
94	NC_017411	A	6	6	11398	11403	100 %	0 %	0 %	0 %	387826848
95	NC_017411	T	8	8	11465	11472	0 %	100 %	0 %	0 %	387826848
96	NC_017411	C	7	7	11490	11496	0 %	0 %	0 %	100 %	387826849
97	NC_017411	T	6	6	11506	11511	0 %	100 %	0 %	0 %	387826849
98	NC_017411	T	8	8	11530	11537	0 %	100 %	0 %	0 %	387826849
99	NC_017411	T	7	7	11541	11547	0 %	100 %	0 %	0 %	387826849
100	NC_017411	T	6	6	11591	11596	0 %	100 %	0 %	0 %	387826849
101	NC_017411	T	6	6	11672	11677	0 %	100 %	0 %	0 %	387826849
102	NC_017411	T	6	6	11701	11706	0 %	100 %	0 %	0 %	387826849
103	NC_017411	A	6	6	11710	11715	100 %	0 %	0 %	0 %	387826849
104	NC_017411	T	6	6	11943	11948	0 %	100 %	0 %	0 %	387826849
105	NC_017411	T	7	7	11958	11964	0 %	100 %	0 %	0 %	387826849
106	NC_017411	T	6	6	12276	12281	0 %	100 %	0 %	0 %	387826850
107	NC_017411	T	6	6	12297	12302	0 %	100 %	0 %	0 %	387826850
108	NC_017411	T	8	8	12325	12332	0 %	100 %	0 %	0 %	387826850
109	NC_017411	A	6	6	12333	12338	100 %	0 %	0 %	0 %	387826850
110	NC_017411	T	7	7	12466	12472	0 %	100 %	0 %	0 %	387826850
111	NC_017411	T	6	6	12595	12600	0 %	100 %	0 %	0 %	387826850
112	NC_017411	T	6	6	12662	12667	0 %	100 %	0 %	0 %	387826850
113	NC_017411	T	8	8	12782	12789	0 %	100 %	0 %	0 %	387826850
114	NC_017411	T	7	7	12826	12832	0 %	100 %	0 %	0 %	387826850
115	NC_017411	T	6	6	12913	12918	0 %	100 %	0 %	0 %	387826850
116	NC_017411	T	6	6	13051	13056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017411	A	7	7	13166	13172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017411	T	6	6	13361	13366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017411	A	6	6	13457	13462	100 %	0 %	0 %	0 %	387826851
120	NC_017411	A	7	7	13638	13644	100 %	0 %	0 %	0 %	387826851
121	NC_017411	T	7	7	14147	14153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017411	T	6	6	14197	14202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017411	T	6	6	14453	14458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017411	T	6	6	14710	14715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017411	A	6	6	14857	14862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017411	T	6	6	15056	15061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017411	T	6	6	15081	15086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017411	A	6	6	15331	15336	100 %	0 %	0 %	0 %	387826852
129	NC_017411	T	6	6	15597	15602	0 %	100 %	0 %	0 %	387826852
130	NC_017411	A	7	7	15605	15611	100 %	0 %	0 %	0 %	387826852
131	NC_017411	A	6	6	15677	15682	100 %	0 %	0 %	0 %	387826852
132	NC_017411	A	7	7	16136	16142	100 %	0 %	0 %	0 %	387826852
133	NC_017411	T	7	7	16399	16405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017411	A	6	6	16477	16482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017411	T	6	6	16708	16713	0 %	100 %	0 %	0 %	387826853
136	NC_017411	T	6	6	16895	16900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017411	T	6	6	17430	17435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017411	A	6	6	17445	17450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017411	A	9	9	17454	17462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017411	A	6	6	17598	17603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017411	A	6	6	17639	17644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017411	A	6	6	17812	17817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017411	A	7	7	18113	18119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017411	A	6	6	18154	18159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017411	T	6	6	18363	18368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017411	A	8	8	18723	18730	100 %	0 %	0 %	0 %	387826856
147	NC_017411	A	6	6	18804	18809	100 %	0 %	0 %	0 %	387826856
148	NC_017411	T	7	7	18927	18933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017411	A	7	7	19019	19025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017411	A	6	6	19219	19224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017411	A	6	6	19308	19313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017411	A	6	6	19327	19332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017411	A	6	6	19350	19355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017411	T	6	6	19796	19801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017411	T	6	6	19819	19824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017411	T	6	6	19838	19843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017411	T	6	6	19927	19932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017411	T	7	7	20126	20132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017411	A	7	7	20218	20224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017411	T	6	6	20342	20347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017411	T	8	8	20421	20428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017411	T	6	6	20480	20485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017411	T	8	8	21021	21028	0 %	100 %	0 %	0 %	387826857
164	NC_017411	T	8	8	21206	21213	0 %	100 %	0 %	0 %	387826857
165	NC_017411	A	7	7	21311	21317	100 %	0 %	0 %	0 %	387826857
166	NC_017411	A	6	6	21337	21342	100 %	0 %	0 %	0 %	387826857
167	NC_017411	T	6	6	21896	21901	0 %	100 %	0 %	0 %	387826858
168	NC_017411	T	6	6	22040	22045	0 %	100 %	0 %	0 %	387826858
169	NC_017411	A	7	7	22153	22159	100 %	0 %	0 %	0 %	387826858
170	NC_017411	A	6	6	22500	22505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017411	A	6	6	22508	22513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017411	A	6	6	22533	22538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017411	T	6	6	22784	22789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.