MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp36

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017411	A	6	6	495	500	100 %	0 %	0 %	0 %	387826841
2	NC_017411	A	7	7	695	701	100 %	0 %	0 %	0 %	387826841
3	NC_017411	T	6	6	2533	2538	0 %	100 %	0 %	0 %	387826842
4	NC_017411	T	6	6	2853	2858	0 %	100 %	0 %	0 %	387826842
5	NC_017411	T	7	7	2930	2936	0 %	100 %	0 %	0 %	387826842
6	NC_017411	T	6	6	2950	2955	0 %	100 %	0 %	0 %	387826842
7	NC_017411	T	6	6	3024	3029	0 %	100 %	0 %	0 %	387826842
8	NC_017411	A	6	6	3661	3666	100 %	0 %	0 %	0 %	387826843
9	NC_017411	T	8	8	3669	3676	0 %	100 %	0 %	0 %	387826843
10	NC_017411	T	6	6	3778	3783	0 %	100 %	0 %	0 %	387826843
11	NC_017411	A	6	6	3955	3960	100 %	0 %	0 %	0 %	387826844
12	NC_017411	T	8	8	5357	5364	0 %	100 %	0 %	0 %	387826845
13	NC_017411	C	6	6	5559	5564	0 %	0 %	0 %	100 %	387826845
14	NC_017411	T	7	7	5608	5614	0 %	100 %	0 %	0 %	387826845
15	NC_017411	T	6	6	5638	5643	0 %	100 %	0 %	0 %	387826845
16	NC_017411	A	9	9	5758	5766	100 %	0 %	0 %	0 %	387826845
17	NC_017411	T	6	6	5926	5931	0 %	100 %	0 %	0 %	387826845
18	NC_017411	A	6	6	7554	7559	100 %	0 %	0 %	0 %	387826846
19	NC_017411	A	7	7	7754	7760	100 %	0 %	0 %	0 %	387826846
20	NC_017411	T	9	9	7772	7780	0 %	100 %	0 %	0 %	387826846
21	NC_017411	A	6	6	8174	8179	100 %	0 %	0 %	0 %	387826846
22	NC_017411	T	6	6	8285	8290	0 %	100 %	0 %	0 %	387826846
23	NC_017411	A	6	6	8507	8512	100 %	0 %	0 %	0 %	387826846
24	NC_017411	A	6	6	8716	8721	100 %	0 %	0 %	0 %	387826846
25	NC_017411	G	6	6	8842	8847	0 %	0 %	100 %	0 %	387826846
26	NC_017411	A	6	6	8868	8873	100 %	0 %	0 %	0 %	387826846
27	NC_017411	A	6	6	9758	9763	100 %	0 %	0 %	0 %	387826847
28	NC_017411	T	6	6	9810	9815	0 %	100 %	0 %	0 %	387826847
29	NC_017411	A	6	6	10022	10027	100 %	0 %	0 %	0 %	387826847
30	NC_017411	A	6	6	10085	10090	100 %	0 %	0 %	0 %	387826847
31	NC_017411	A	7	7	10102	10108	100 %	0 %	0 %	0 %	387826847
32	NC_017411	A	6	6	10175	10180	100 %	0 %	0 %	0 %	387826847
33	NC_017411	A	6	6	10199	10204	100 %	0 %	0 %	0 %	387826847
34	NC_017411	T	6	6	10740	10745	0 %	100 %	0 %	0 %	387826848
35	NC_017411	T	6	6	11369	11374	0 %	100 %	0 %	0 %	387826848
36	NC_017411	A	6	6	11398	11403	100 %	0 %	0 %	0 %	387826848
37	NC_017411	T	8	8	11465	11472	0 %	100 %	0 %	0 %	387826848
38	NC_017411	C	7	7	11490	11496	0 %	0 %	0 %	100 %	387826849
39	NC_017411	T	6	6	11506	11511	0 %	100 %	0 %	0 %	387826849
40	NC_017411	T	8	8	11530	11537	0 %	100 %	0 %	0 %	387826849
41	NC_017411	T	7	7	11541	11547	0 %	100 %	0 %	0 %	387826849
42	NC_017411	T	6	6	11591	11596	0 %	100 %	0 %	0 %	387826849
43	NC_017411	T	6	6	11672	11677	0 %	100 %	0 %	0 %	387826849
44	NC_017411	T	6	6	11701	11706	0 %	100 %	0 %	0 %	387826849
45	NC_017411	A	6	6	11710	11715	100 %	0 %	0 %	0 %	387826849
46	NC_017411	T	6	6	11943	11948	0 %	100 %	0 %	0 %	387826849
47	NC_017411	T	7	7	11958	11964	0 %	100 %	0 %	0 %	387826849
48	NC_017411	T	6	6	12276	12281	0 %	100 %	0 %	0 %	387826850
49	NC_017411	T	6	6	12297	12302	0 %	100 %	0 %	0 %	387826850
50	NC_017411	T	8	8	12325	12332	0 %	100 %	0 %	0 %	387826850
51	NC_017411	A	6	6	12333	12338	100 %	0 %	0 %	0 %	387826850
52	NC_017411	T	7	7	12466	12472	0 %	100 %	0 %	0 %	387826850
53	NC_017411	T	6	6	12595	12600	0 %	100 %	0 %	0 %	387826850
54	NC_017411	T	6	6	12662	12667	0 %	100 %	0 %	0 %	387826850
55	NC_017411	T	8	8	12782	12789	0 %	100 %	0 %	0 %	387826850
56	NC_017411	T	7	7	12826	12832	0 %	100 %	0 %	0 %	387826850
57	NC_017411	T	6	6	12913	12918	0 %	100 %	0 %	0 %	387826850
58	NC_017411	A	6	6	13457	13462	100 %	0 %	0 %	0 %	387826851
59	NC_017411	A	7	7	13638	13644	100 %	0 %	0 %	0 %	387826851
60	NC_017411	A	6	6	15331	15336	100 %	0 %	0 %	0 %	387826852
61	NC_017411	T	6	6	15597	15602	0 %	100 %	0 %	0 %	387826852
62	NC_017411	A	7	7	15605	15611	100 %	0 %	0 %	0 %	387826852
63	NC_017411	A	6	6	15677	15682	100 %	0 %	0 %	0 %	387826852
64	NC_017411	A	7	7	16136	16142	100 %	0 %	0 %	0 %	387826852
65	NC_017411	T	6	6	16708	16713	0 %	100 %	0 %	0 %	387826853
66	NC_017411	A	8	8	18723	18730	100 %	0 %	0 %	0 %	387826856
67	NC_017411	A	6	6	18804	18809	100 %	0 %	0 %	0 %	387826856
68	NC_017411	T	8	8	21021	21028	0 %	100 %	0 %	0 %	387826857
69	NC_017411	T	8	8	21206	21213	0 %	100 %	0 %	0 %	387826857
70	NC_017411	A	7	7	21311	21317	100 %	0 %	0 %	0 %	387826857
71	NC_017411	A	6	6	21337	21342	100 %	0 %	0 %	0 %	387826857
72	NC_017411	T	6	6	21896	21901	0 %	100 %	0 %	0 %	387826858
73	NC_017411	T	6	6	22040	22045	0 %	100 %	0 %	0 %	387826858
74	NC_017411	A	7	7	22153	22159	100 %	0 %	0 %	0 %	387826858

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.