MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp17

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017410	TAAAT	2	10	661	670	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017410	TAATT	2	10	1505	1514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017410	TTCTT	2	10	2025	2034	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017410	TTAAT	2	10	2647	2656	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017410	CAAGC	2	10	4103	4112	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017410	AATAA	2	10	4530	4539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017410	ATATT	2	10	4745	4754	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017410	GTATG	2	10	5199	5208	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017410	ACAGA	2	10	5538	5547	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017410	AGATT	2	10	7514	7523	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017410	ATTTT	2	10	11566	11575	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017410	TAATA	2	10	12321	12330	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017410	ATATT	2	10	15942	15951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017410	TAAAT	2	10	16159	16168	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017410	AAAGA	2	10	16171	16180	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017410	ATTTG	2	10	17472	17481	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.