MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp17

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017410	TAAT	2	8	72	79	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017410	AAGA	2	8	481	488	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017410	ATTT	2	8	564	571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017410	ATTT	3	12	694	705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017410	ATTT	2	8	782	789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017410	ATAA	2	8	874	881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017410	AATT	2	8	1010	1017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017410	TAAA	2	8	1302	1309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017410	TAAA	2	8	1394	1401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017410	TTCT	2	8	1413	1420	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017410	CTAA	2	8	1744	1751	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017410	ATAA	2	8	1848	1855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017410	ATAA	2	8	2143	2150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017410	TAAA	2	8	2341	2348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017410	GAAG	2	8	2520	2527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017410	ATAA	2	8	3707	3714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017410	ATTA	2	8	3742	3749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017410	CTTA	2	8	3933	3940	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017410	ACTT	2	8	4279	4286	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017410	TCTT	2	8	4362	4369	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017410	TAAT	2	8	4938	4945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017410	ATTA	2	8	4951	4958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017410	ACAA	2	8	4993	5000	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017410	CATT	2	8	5070	5077	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017410	TTTA	2	8	5184	5191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017410	ATAA	3	12	5386	5397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017410	ATTA	2	8	6068	6075	50 %	50 %	0 %	0 %	387826737
28	NC_017410	TCTA	2	8	6081	6088	25 %	50 %	0 %	25 %	387826737
29	NC_017410	AATC	2	8	6145	6152	50 %	25 %	0 %	25 %	387826737
30	NC_017410	AATG	2	8	6215	6222	50 %	25 %	25 %	0 %	387826737
31	NC_017410	CAAT	2	8	6330	6337	50 %	25 %	0 %	25 %	387826737
32	NC_017410	TTTA	2	8	6732	6739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017410	CTAA	2	8	7137	7144	50 %	25 %	0 %	25 %	387826738
34	NC_017410	AAAT	2	8	7330	7337	75 %	25 %	0 %	0 %	387826738
35	NC_017410	TATT	2	8	7373	7380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017410	TAAT	2	8	7419	7426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017410	TACT	2	8	7604	7611	25 %	50 %	0 %	25 %	387826739
38	NC_017410	CAAA	2	8	7686	7693	75 %	0 %	0 %	25 %	387826739
39	NC_017410	AGAA	2	8	8336	8343	75 %	0 %	25 %	0 %	387826739
40	NC_017410	GAAA	2	8	8899	8906	75 %	0 %	25 %	0 %	387826740
41	NC_017410	ACAA	2	8	9362	9369	75 %	0 %	0 %	25 %	387826741
42	NC_017410	ATCA	2	8	9459	9466	50 %	25 %	0 %	25 %	387826741
43	NC_017410	ATAA	2	8	9781	9788	75 %	25 %	0 %	0 %	387826741
44	NC_017410	ATAA	2	8	9823	9830	75 %	25 %	0 %	0 %	387826741
45	NC_017410	TAAA	2	8	10130	10137	75 %	25 %	0 %	0 %	387826741
46	NC_017410	AATT	2	8	10270	10277	50 %	50 %	0 %	0 %	387826741
47	NC_017410	ACCA	2	8	10420	10427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017410	ATCA	2	8	10486	10493	50 %	25 %	0 %	25 %	387826742
49	NC_017410	TTAT	2	8	10701	10708	25 %	75 %	0 %	0 %	387826742
50	NC_017410	TTTC	2	8	10787	10794	0 %	75 %	0 %	25 %	387826742
51	NC_017410	ATTT	2	8	10897	10904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017410	TTAT	2	8	11182	11189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017410	TAAG	2	8	11221	11228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017410	AAAT	2	8	11285	11292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017410	ATTT	2	8	12192	12199	25 %	75 %	0 %	0 %	387826743
56	NC_017410	AAAG	2	8	12234	12241	75 %	0 %	25 %	0 %	387826743
57	NC_017410	TAAA	2	8	12377	12384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017410	AAAT	2	8	12540	12547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017410	ATTT	2	8	12576	12583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017410	AATT	2	8	12669	12676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017410	GTAA	2	8	12693	12700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017410	ACCA	2	8	12840	12847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017410	AGAT	2	8	12914	12921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017410	AAAT	2	8	12962	12969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017410	ATAA	2	8	12970	12977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017410	AAGC	2	8	13118	13125	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017410	TTAT	2	8	13301	13308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017410	TAAT	2	8	13804	13811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017410	TAAT	2	8	13825	13832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017410	TAAT	2	8	13846	13853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017410	TAAT	2	8	13867	13874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017410	TAAT	2	8	13888	13895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017410	TAAT	2	8	13909	13916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017410	TAAT	2	8	13930	13937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017410	TAAT	2	8	13951	13958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017410	TTAT	2	8	14067	14074	25 %	75 %	0 %	0 %	387826744
77	NC_017410	AGCA	2	8	14114	14121	50 %	0 %	25 %	25 %	387826744
78	NC_017410	GATG	2	8	14190	14197	25 %	25 %	50 %	0 %	387826744
79	NC_017410	TTTG	2	8	14318	14325	0 %	75 %	25 %	0 %	387826744
80	NC_017410	GTCT	2	8	14691	14698	0 %	50 %	25 %	25 %	387826744
81	NC_017410	ATTT	2	8	15095	15102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017410	ATAA	2	8	15201	15208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017410	AAAT	2	8	15673	15680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017410	GATT	2	8	15727	15734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017410	AATT	2	8	16248	16255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017410	CTTT	2	8	16331	16338	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017410	CAAT	2	8	16527	16534	50 %	25 %	0 %	25 %	387826746
88	NC_017410	ATTG	2	8	16555	16562	25 %	50 %	25 %	0 %	387826747
89	NC_017410	TAAT	2	8	16611	16618	50 %	50 %	0 %	0 %	387826747
90	NC_017410	TTTA	2	8	17057	17064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017410	TAAA	2	8	17071	17078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.