MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp17

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017410	ATTA	2	8	6068	6075	50 %	50 %	0 %	0 %	387826737
2	NC_017410	TCTA	2	8	6081	6088	25 %	50 %	0 %	25 %	387826737
3	NC_017410	AATC	2	8	6145	6152	50 %	25 %	0 %	25 %	387826737
4	NC_017410	AATG	2	8	6215	6222	50 %	25 %	25 %	0 %	387826737
5	NC_017410	CAAT	2	8	6330	6337	50 %	25 %	0 %	25 %	387826737
6	NC_017410	CTAA	2	8	7137	7144	50 %	25 %	0 %	25 %	387826738
7	NC_017410	AAAT	2	8	7330	7337	75 %	25 %	0 %	0 %	387826738
8	NC_017410	TACT	2	8	7604	7611	25 %	50 %	0 %	25 %	387826739
9	NC_017410	CAAA	2	8	7686	7693	75 %	0 %	0 %	25 %	387826739
10	NC_017410	AGAA	2	8	8336	8343	75 %	0 %	25 %	0 %	387826739
11	NC_017410	GAAA	2	8	8899	8906	75 %	0 %	25 %	0 %	387826740
12	NC_017410	ACAA	2	8	9362	9369	75 %	0 %	0 %	25 %	387826741
13	NC_017410	ATCA	2	8	9459	9466	50 %	25 %	0 %	25 %	387826741
14	NC_017410	ATAA	2	8	9781	9788	75 %	25 %	0 %	0 %	387826741
15	NC_017410	ATAA	2	8	9823	9830	75 %	25 %	0 %	0 %	387826741
16	NC_017410	TAAA	2	8	10130	10137	75 %	25 %	0 %	0 %	387826741
17	NC_017410	AATT	2	8	10270	10277	50 %	50 %	0 %	0 %	387826741
18	NC_017410	ATCA	2	8	10486	10493	50 %	25 %	0 %	25 %	387826742
19	NC_017410	TTAT	2	8	10701	10708	25 %	75 %	0 %	0 %	387826742
20	NC_017410	TTTC	2	8	10787	10794	0 %	75 %	0 %	25 %	387826742
21	NC_017410	ATTT	2	8	12192	12199	25 %	75 %	0 %	0 %	387826743
22	NC_017410	AAAG	2	8	12234	12241	75 %	0 %	25 %	0 %	387826743
23	NC_017410	TTAT	2	8	14067	14074	25 %	75 %	0 %	0 %	387826744
24	NC_017410	AGCA	2	8	14114	14121	50 %	0 %	25 %	25 %	387826744
25	NC_017410	GATG	2	8	14190	14197	25 %	25 %	50 %	0 %	387826744
26	NC_017410	TTTG	2	8	14318	14325	0 %	75 %	25 %	0 %	387826744
27	NC_017410	GTCT	2	8	14691	14698	0 %	50 %	25 %	25 %	387826744
28	NC_017410	CAAT	2	8	16527	16534	50 %	25 %	0 %	25 %	387826746
29	NC_017410	ATTG	2	8	16555	16562	25 %	50 %	25 %	0 %	387826747
30	NC_017410	TAAT	2	8	16611	16618	50 %	50 %	0 %	0 %	387826747

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.