MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp17

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017410	TCC	2	6	58	63	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017410	CTG	2	6	114	119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017410	ATT	2	6	288	293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017410	ATT	2	6	306	311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017410	AGA	2	6	351	356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017410	TGA	2	6	450	455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017410	AAT	2	6	529	534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017410	ATA	2	6	537	542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017410	TAG	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017410	GAT	2	6	640	645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017410	CAA	2	6	676	681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017410	TTA	2	6	727	732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017410	TTA	2	6	769	774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017410	TAA	2	6	832	837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017410	TAA	3	9	894	902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017410	AGA	2	6	955	960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017410	AAG	2	6	1043	1048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017410	TAA	2	6	1054	1059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017410	AAT	2	6	1105	1110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017410	TTG	2	6	1115	1120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017410	TTA	2	6	1145	1150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017410	AAC	2	6	1207	1212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017410	ATT	2	6	1234	1239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017410	TAA	2	6	1255	1260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017410	ATT	2	6	1296	1301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017410	ATT	2	6	1376	1381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017410	ATT	2	6	1480	1485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017410	ATT	2	6	1596	1601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017410	CTG	2	6	1644	1649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017410	TAT	2	6	1819	1824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017410	AGA	2	6	1840	1845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017410	TAA	2	6	1896	1901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017410	CTT	2	6	2188	2193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017410	TGA	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017410	TAA	2	6	2369	2374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017410	GTT	2	6	2376	2381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017410	GTC	2	6	2402	2407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017410	AGA	2	6	2471	2476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017410	ATA	2	6	2508	2513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017410	TGA	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017410	CTG	2	6	2770	2775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017410	ATG	2	6	2848	2853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017410	TAA	2	6	2872	2877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017410	ATT	2	6	2985	2990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017410	TAA	2	6	3075	3080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017410	AAG	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017410	TTG	2	6	3189	3194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017410	ATG	2	6	3201	3206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017410	ATC	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017410	ATA	3	9	3281	3289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017410	GAA	2	6	3329	3334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017410	TGA	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017410	GGT	2	6	3433	3438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017410	ATT	2	6	3498	3503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017410	ATT	2	6	3512	3517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017410	TTA	2	6	3588	3593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017410	TAT	2	6	3607	3612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017410	AGT	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017410	AAT	2	6	3723	3728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017410	ATA	2	6	3810	3815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017410	CAT	2	6	3953	3958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017410	GAT	2	6	4025	4030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017410	TGA	2	6	4036	4041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017410	TTA	2	6	4497	4502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017410	TAT	2	6	4565	4570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017410	ATT	2	6	4770	4775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017410	TCT	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017410	TTA	2	6	4822	4827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017410	AAG	2	6	4920	4925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017410	TAA	2	6	4963	4968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017410	TAA	2	6	4978	4983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017410	TAA	2	6	5043	5048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017410	TAT	2	6	5078	5083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017410	TCA	2	6	5117	5122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017410	TAA	2	6	5152	5157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017410	ATA	2	6	5221	5226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017410	ATT	2	6	5267	5272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017410	AAT	2	6	5278	5283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017410	AGA	2	6	5335	5340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017410	ATT	2	6	5347	5352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017410	AAT	2	6	5362	5367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017410	TGA	2	6	5443	5448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017410	TAA	3	9	5480	5488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017410	TTA	2	6	5517	5522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017410	TAT	2	6	5556	5561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017410	ATT	2	6	5789	5794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017410	CAA	2	6	5844	5849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017410	ACT	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017410	ATT	2	6	5915	5920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017410	ATA	2	6	5936	5941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017410	TAA	2	6	6664	6669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017410	ATT	2	6	6754	6759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017410	ATA	2	6	7413	7418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017410	TAT	3	9	7475	7483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017410	GTT	2	6	7489	7494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017410	TAA	2	6	8578	8583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017410	ATT	2	6	9060	9065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017410	AAT	2	6	9103	9108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017410	CAA	2	6	9129	9134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017410	GTA	2	6	10881	10886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017410	ATA	2	6	10911	10916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017410	ATT	2	6	11056	11061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017410	AAT	2	6	11074	11079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017410	ATT	2	6	11430	11435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017410	ATT	2	6	11591	11596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017410	TAA	4	12	11597	11608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017410	TGT	2	6	12417	12422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017410	TAA	2	6	12502	12507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017410	AAT	2	6	12510	12515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017410	GAA	2	6	12516	12521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017410	ATT	2	6	12663	12668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017410	TAT	2	6	12787	12792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017410	TTA	2	6	12949	12954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017410	TAA	3	9	13135	13143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017410	TTA	2	6	13330	13335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017410	TAA	2	6	13368	13373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017410	TCA	2	6	13459	13464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017410	GTG	2	6	13513	13518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017410	TAA	2	6	13544	13549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017410	TTA	2	6	13682	13687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017410	TAG	2	6	13719	13724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017410	ATA	2	6	13971	13976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017410	TAA	2	6	15029	15034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017410	AGT	2	6	15163	15168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017410	TGA	2	6	15234	15239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017410	ATT	2	6	15254	15259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017410	AGA	2	6	15269	15274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017410	TAT	2	6	15347	15352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017410	TCA	2	6	15374	15379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017410	ATT	2	6	15443	15448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017410	ATT	2	6	15481	15486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017410	ATA	2	6	15492	15497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017410	ATA	2	6	15747	15752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017410	TAA	3	9	15892	15900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017410	TTA	2	6	15903	15908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017410	TAG	3	9	15915	15923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017410	ATA	2	6	15935	15940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017410	AGT	3	9	15954	15962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017410	TTC	2	6	15992	15997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017410	ATT	2	6	16071	16076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017410	TTA	2	6	16199	16204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017410	TGT	2	6	16869	16874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017410	CTT	2	6	17007	17012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017410	ATA	2	6	17031	17036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017410	TAT	2	6	17041	17046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017410	ATA	2	6	17130	17135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017410	ATT	2	6	17152	17157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017410	GTT	3	9	17248	17256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017410	AAT	2	6	17374	17379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017410	GTA	2	6	17449	17454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017410	TAT	2	6	17461	17466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.