MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp17

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017410	AT	4	8	159	166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017410	TA	3	6	793	798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017410	AG	3	6	1217	1222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017410	TA	3	6	1712	1717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017410	AT	4	8	2231	2238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017410	AT	3	6	3346	3351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017410	TA	3	6	3897	3902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017410	AT	3	6	4154	4159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017410	TG	3	6	4187	4192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017410	AT	3	6	4907	4912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017410	TA	3	6	7540	7545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017410	AT	3	6	8650	8655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017410	AT	3	6	10287	10292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017410	TA	4	8	10305	10312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017410	AT	3	6	10352	10357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017410	AT	4	8	10371	10378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017410	TA	3	6	10885	10890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017410	TA	3	6	11010	11015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017410	AT	3	6	11557	11562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017410	AT	3	6	12315	12320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017410	TA	3	6	12354	12359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017410	AG	3	6	12470	12475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017410	AT	3	6	12828	12833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017410	TA	3	6	12889	12894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017410	TA	4	8	13042	13049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017410	TA	3	6	13449	13454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017410	AT	3	6	13810	13815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017410	AT	3	6	13831	13836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017410	AT	3	6	13852	13857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017410	AT	3	6	13873	13878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017410	AT	3	6	13894	13899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017410	AT	3	6	13915	13920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017410	AT	3	6	13936	13941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017410	AT	3	6	13957	13962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017410	TC	3	6	15142	15147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017410	AT	3	6	15431	15436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017410	TA	3	6	15466	15471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017410	TA	3	6	15501	15506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017410	AT	3	6	15534	15539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017410	TA	3	6	16857	16862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017410	CA	3	6	16939	16944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017410	TA	3	6	17048	17053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017410	TA	3	6	17165	17170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017410	TA	3	6	17409	17414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017410	TA	3	6	17424	17429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.