MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp17

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017410	T	7	7	107	113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017410	T	6	6	137	142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017410	A	7	7	257	263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017410	T	6	6	424	429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017410	A	7	7	847	853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017410	A	8	8	1127	1134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017410	T	8	8	1420	1427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017410	T	9	9	1441	1449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017410	T	7	7	1473	1479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017410	T	6	6	1654	1659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017410	T	7	7	1667	1673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017410	A	6	6	1687	1692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017410	A	6	6	1955	1960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017410	A	7	7	2155	2161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017410	T	8	8	2173	2180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017410	A	6	6	2577	2582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017410	T	6	6	2688	2693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017410	A	6	6	3121	3126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017410	G	6	6	3247	3252	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017410	A	6	6	3273	3278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017410	T	6	6	3490	3495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017410	A	6	6	3528	3533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017410	A	6	6	3539	3544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017410	T	6	6	3628	3633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017410	T	6	6	4123	4128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017410	T	6	6	4399	4404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017410	T	8	8	4413	4420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017410	T	6	6	4587	4592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017410	A	6	6	4847	4852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017410	A	6	6	5242	5247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017410	T	9	9	5309	5317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017410	T	6	6	5402	5407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017410	A	7	7	5568	5574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017410	A	6	6	5898	5903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017410	A	7	7	6164	6170	100 %	0 %	0 %	0 %	387826737
36	NC_017410	T	7	7	6372	6378	0 %	100 %	0 %	0 %	387826737
37	NC_017410	T	7	7	6966	6972	0 %	100 %	0 %	0 %	387826738
38	NC_017410	A	8	8	7302	7309	100 %	0 %	0 %	0 %	387826738
39	NC_017410	C	6	6	7354	7359	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_017410	A	8	8	7383	7390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017410	A	6	6	7468	7473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017410	A	6	6	7616	7621	100 %	0 %	0 %	0 %	387826739
43	NC_017410	A	7	7	7623	7629	100 %	0 %	0 %	0 %	387826739
44	NC_017410	A	6	6	7675	7680	100 %	0 %	0 %	0 %	387826739
45	NC_017410	A	6	6	7985	7990	100 %	0 %	0 %	0 %	387826739
46	NC_017410	A	6	6	8260	8265	100 %	0 %	0 %	0 %	387826739
47	NC_017410	T	6	6	8348	8353	0 %	100 %	0 %	0 %	387826739
48	NC_017410	A	8	8	8464	8471	100 %	0 %	0 %	0 %	387826739
49	NC_017410	T	9	9	8529	8537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017410	A	6	6	8780	8785	100 %	0 %	0 %	0 %	387826740
51	NC_017410	A	8	8	8932	8939	100 %	0 %	0 %	0 %	387826740
52	NC_017410	A	6	6	8983	8988	100 %	0 %	0 %	0 %	387826740
53	NC_017410	A	6	6	9177	9182	100 %	0 %	0 %	0 %	387826741
54	NC_017410	A	7	7	9242	9248	100 %	0 %	0 %	0 %	387826741
55	NC_017410	A	7	7	9304	9310	100 %	0 %	0 %	0 %	387826741
56	NC_017410	A	7	7	9451	9457	100 %	0 %	0 %	0 %	387826741
57	NC_017410	A	7	7	9649	9655	100 %	0 %	0 %	0 %	387826741
58	NC_017410	A	6	6	9708	9713	100 %	0 %	0 %	0 %	387826741
59	NC_017410	A	7	7	9806	9812	100 %	0 %	0 %	0 %	387826741
60	NC_017410	A	6	6	9926	9931	100 %	0 %	0 %	0 %	387826741
61	NC_017410	A	7	7	10045	10051	100 %	0 %	0 %	0 %	387826741
62	NC_017410	A	6	6	10106	10111	100 %	0 %	0 %	0 %	387826741
63	NC_017410	A	7	7	10117	10123	100 %	0 %	0 %	0 %	387826741
64	NC_017410	A	7	7	10143	10149	100 %	0 %	0 %	0 %	387826741
65	NC_017410	A	6	6	10199	10204	100 %	0 %	0 %	0 %	387826741
66	NC_017410	T	6	6	10217	10222	0 %	100 %	0 %	0 %	387826741
67	NC_017410	T	7	7	10329	10335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017410	T	6	6	10436	10441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017410	T	7	7	10494	10500	0 %	100 %	0 %	0 %	387826742
70	NC_017410	T	6	6	10619	10624	0 %	100 %	0 %	0 %	387826742
71	NC_017410	A	6	6	10734	10739	100 %	0 %	0 %	0 %	387826742
72	NC_017410	T	6	6	10983	10988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017410	T	6	6	11395	11400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017410	T	7	7	11465	11471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017410	A	6	6	11472	11477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017410	T	7	7	11572	11578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017410	T	6	6	11648	11653	0 %	100 %	0 %	0 %	387826743
78	NC_017410	T	6	6	11673	11678	0 %	100 %	0 %	0 %	387826743
79	NC_017410	T	9	9	11770	11778	0 %	100 %	0 %	0 %	387826743
80	NC_017410	T	6	6	11865	11870	0 %	100 %	0 %	0 %	387826743
81	NC_017410	T	6	6	11981	11986	0 %	100 %	0 %	0 %	387826743
82	NC_017410	T	6	6	12144	12149	0 %	100 %	0 %	0 %	387826743
83	NC_017410	A	6	6	12171	12176	100 %	0 %	0 %	0 %	387826743
84	NC_017410	A	7	7	12382	12388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017410	T	8	8	12403	12410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017410	G	6	6	12554	12559	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017410	T	7	7	12742	12748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017410	T	6	6	12760	12765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017410	A	9	9	12929	12937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017410	A	7	7	12992	12998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017410	A	7	7	13142	13148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017410	A	6	6	13175	13180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017410	A	7	7	13186	13192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017410	A	6	6	13194	13199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017410	A	6	6	13263	13268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017410	T	6	6	13286	13291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017410	A	6	6	13763	13768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017410	A	7	7	13999	14005	100 %	0 %	0 %	0 %	387826744
99	NC_017410	A	7	7	14082	14088	100 %	0 %	0 %	0 %	387826744
100	NC_017410	A	7	7	14222	14228	100 %	0 %	0 %	0 %	387826744
101	NC_017410	A	6	6	14508	14513	100 %	0 %	0 %	0 %	387826744
102	NC_017410	A	6	6	14988	14993	100 %	0 %	0 %	0 %	387826745
103	NC_017410	A	7	7	15022	15028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017410	T	6	6	15118	15123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017410	T	6	6	15217	15222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017410	G	10	10	15409	15418	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017410	A	7	7	15553	15559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017410	A	8	8	15629	15636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017410	T	6	6	15714	15719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017410	T	6	6	15754	15759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017410	A	6	6	15924	15929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017410	T	6	6	16019	16024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017410	T	7	7	16045	16051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017410	T	6	6	16065	16070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017410	T	8	8	16075	16082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017410	A	6	6	16350	16355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017410	A	6	6	16421	16426	100 %	0 %	0 %	0 %	387826746
118	NC_017410	A	6	6	16623	16628	100 %	0 %	0 %	0 %	387826747
119	NC_017410	A	7	7	16655	16661	100 %	0 %	0 %	0 %	387826747
120	NC_017410	T	6	6	16672	16677	0 %	100 %	0 %	0 %	387826747
121	NC_017410	A	6	6	16817	16822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017410	T	7	7	16922	16928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017410	T	6	6	16950	16955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017410	T	6	6	16964	16969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017410	T	6	6	16999	17004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017410	T	7	7	17112	17118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017410	T	6	6	17255	17260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017410	T	6	6	17291	17296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017410	T	6	6	17354	17359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.