MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp25

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017409	CTTTAT	2	12	2962	2973	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387826518
2	NC_017409	AATTTT	2	12	4636	4647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017409	ATAATG	2	12	6051	6062	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017409	TCTTTA	2	12	10039	10050	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387826523
5	NC_017409	ATTAAA	2	12	11983	11994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826526
6	NC_017409	AGTTTA	2	12	12172	12183	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387826526
7	NC_017409	TTTGTA	2	12	12623	12634	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387826526
8	NC_017409	TAAAAA	2	12	12740	12751	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017409	TAAAAA	2	12	14625	14636	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017409	TTAATT	2	12	14999	15010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017409	TAAAGA	2	12	15114	15125	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017409	TAAAGA	2	12	15434	15445	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017409	ATAAAA	2	12	19025	19036	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017409	ATTTAT	2	12	19108	19119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017409	AATTTA	2	12	20501	20512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017409	ATTAAT	2	12	21149	21160	50 %	50 %	0 %	0 %	387826530
17	NC_017409	ATATTA	2	12	21176	21187	50 %	50 %	0 %	0 %	387826530

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.