MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp25

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017409	TAAAT	2	10	695	704	60 %	40 %	0 %	0 %	387826518
2	NC_017409	TTTAT	2	10	855	864	20 %	80 %	0 %	0 %	387826518
3	NC_017409	TATCT	2	10	2423	2432	20 %	60 %	0 %	20 %	387826518
4	NC_017409	ATTTT	2	10	3123	3132	20 %	80 %	0 %	0 %	387826518
5	NC_017409	AAATA	2	10	3568	3577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017409	TAAAT	2	10	4907	4916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017409	GATTG	2	10	6288	6297	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017409	TAAAC	2	10	6301	6310	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017409	ACAAA	2	10	7120	7129	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017409	CTTAG	2	10	7554	7563	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017409	TTAAA	2	10	7980	7989	60 %	40 %	0 %	0 %	387826521
12	NC_017409	TTATT	2	10	8764	8773	20 %	80 %	0 %	0 %	387826522
13	NC_017409	TTTAA	2	10	8994	9003	40 %	60 %	0 %	0 %	387826522
14	NC_017409	TCATT	2	10	10241	10250	20 %	60 %	0 %	20 %	387826523
15	NC_017409	TGTTT	2	10	10818	10827	0 %	80 %	20 %	0 %	387826524
16	NC_017409	TTTCT	2	10	11471	11480	0 %	80 %	0 %	20 %	387826525
17	NC_017409	GAATT	2	10	12788	12797	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017409	TTAAT	2	10	13099	13108	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017409	TTTAA	2	10	14272	14281	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017409	TAAAA	2	10	15650	15659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017409	TCAAA	2	10	17330	17339	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017409	TTAAA	2	10	19125	19134	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017409	ATATT	2	10	19714	19723	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017409	TCAAA	2	10	19979	19988	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017409	TATAA	2	10	20516	20525	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017409	TAAGT	2	10	21447	21456	40 %	40 %	20 %	0 %	387826531
27	NC_017409	ATAGT	2	10	21483	21492	40 %	40 %	20 %	0 %	387826531
28	NC_017409	GTTTT	2	10	21587	21596	0 %	80 %	20 %	0 %	387826531
29	NC_017409	ATTTA	2	10	22205	22214	40 %	60 %	0 %	0 %	387826531

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.