MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp25

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017409	TTAT	2	8	81	88	25 %	75 %	0 %	0 %	387826518
2	NC_017409	CTTT	2	8	105	112	0 %	75 %	0 %	25 %	387826518
3	NC_017409	TCCT	2	8	974	981	0 %	50 %	0 %	50 %	387826518
4	NC_017409	TTAA	2	8	1170	1177	50 %	50 %	0 %	0 %	387826518
5	NC_017409	TAAA	2	8	1336	1343	75 %	25 %	0 %	0 %	387826518
6	NC_017409	CTTT	2	8	1602	1609	0 %	75 %	0 %	25 %	387826518
7	NC_017409	TAAA	3	12	2640	2651	75 %	25 %	0 %	0 %	387826518
8	NC_017409	TAAG	2	8	2890	2897	50 %	25 %	25 %	0 %	387826518
9	NC_017409	TTAT	2	8	3281	3288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017409	ATTT	2	8	3390	3397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017409	AAAG	2	8	3419	3426	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017409	AATT	2	8	3471	3478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017409	TAAA	2	8	3503	3510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017409	ATAG	2	8	3523	3530	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017409	ATTT	2	8	3685	3692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017409	AATT	2	8	3862	3869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017409	ATTA	2	8	3892	3899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017409	TTGT	2	8	4022	4029	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017409	AGAA	2	8	4183	4190	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017409	ATTA	2	8	4408	4415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017409	TACT	2	8	4550	4557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017409	ATTT	2	8	4947	4954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017409	TTTA	2	8	5260	5267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017409	AGAA	2	8	5552	5559	75 %	0 %	25 %	0 %	387826519
25	NC_017409	CCAA	2	8	5825	5832	50 %	0 %	0 %	50 %	387826519
26	NC_017409	AAAT	2	8	6073	6080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017409	TATT	2	8	6363	6370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017409	TCAT	2	8	6883	6890	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017409	TTTA	2	8	6986	6993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017409	AAAT	2	8	7132	7139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017409	TTTA	2	8	7146	7153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017409	TATT	2	8	7367	7374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017409	ATTG	2	8	8849	8856	25 %	50 %	25 %	0 %	387826522
34	NC_017409	TTAT	2	8	8913	8920	25 %	75 %	0 %	0 %	387826522
35	NC_017409	AATA	2	8	9156	9163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017409	TATG	2	8	9426	9433	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017409	TTAA	2	8	9536	9543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017409	CTTT	2	8	10117	10124	0 %	75 %	0 %	25 %	387826523
39	NC_017409	AATT	2	8	10160	10167	50 %	50 %	0 %	0 %	387826523
40	NC_017409	TTTA	2	8	10333	10340	25 %	75 %	0 %	0 %	387826524
41	NC_017409	ATTT	2	8	11018	11025	25 %	75 %	0 %	0 %	387826524
42	NC_017409	TTGA	2	8	11355	11362	25 %	50 %	25 %	0 %	387826525
43	NC_017409	TGTT	2	8	11683	11690	0 %	75 %	25 %	0 %	387826526
44	NC_017409	TATT	2	8	11857	11864	25 %	75 %	0 %	0 %	387826526
45	NC_017409	TCTT	2	8	12210	12217	0 %	75 %	0 %	25 %	387826526
46	NC_017409	ATTT	2	8	12276	12283	25 %	75 %	0 %	0 %	387826526
47	NC_017409	ATTG	2	8	13435	13442	25 %	50 %	25 %	0 %	387826527
48	NC_017409	GTTT	2	8	13472	13479	0 %	75 %	25 %	0 %	387826527
49	NC_017409	GTTG	2	8	13713	13720	0 %	50 %	50 %	0 %	387826527
50	NC_017409	ATTA	2	8	14126	14133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017409	TATG	2	8	14192	14199	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017409	GAAA	2	8	14653	14660	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017409	TAAA	2	8	14823	14830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017409	TAAG	2	8	14903	14910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017409	CATA	2	8	15376	15383	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017409	TTTA	2	8	15597	15604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017409	ATTT	2	8	16155	16162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017409	TAAT	2	8	16507	16514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017409	AAGA	2	8	16699	16706	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017409	AGTA	2	8	17173	17180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017409	ATCA	2	8	17195	17202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017409	GTAG	2	8	17528	17535	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017409	AAAT	2	8	17646	17653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017409	CAGT	2	8	18197	18204	25 %	25 %	25 %	25 %	387826528
65	NC_017409	TTGA	2	8	18302	18309	25 %	50 %	25 %	0 %	387826528
66	NC_017409	TGTT	3	12	18560	18571	0 %	75 %	25 %	0 %	387826528
67	NC_017409	AAAT	2	8	18659	18666	75 %	25 %	0 %	0 %	387826528
68	NC_017409	AAGA	2	8	19346	19353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017409	AGTA	2	8	19822	19829	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017409	ATCA	2	8	19844	19851	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017409	TAGA	2	8	20178	20185	50 %	25 %	25 %	0 %	387826529
72	NC_017409	TTTA	2	8	21238	21245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017409	CTAT	2	8	21349	21356	25 %	50 %	0 %	25 %	387826531
74	NC_017409	ATCT	2	8	21769	21776	25 %	50 %	0 %	25 %	387826531
75	NC_017409	GATA	2	8	21778	21785	50 %	25 %	25 %	0 %	387826531
76	NC_017409	ATTT	2	8	21871	21878	25 %	75 %	0 %	0 %	387826531
77	NC_017409	ATTT	2	8	22223	22230	25 %	75 %	0 %	0 %	387826531
78	NC_017409	CTTT	2	8	22477	22484	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017409	ATCA	2	8	22545	22552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017409	ATTT	2	8	22610	22617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017409	TAAT	2	8	22742	22749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.