MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp25

Total Repeats: 355

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017409	TTC	2	6	13	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826518
2	NC_017409	TCT	2	6	75	80	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826518
3	NC_017409	AAC	2	6	93	98	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826518
4	NC_017409	TGA	2	6	147	152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826518
5	NC_017409	ATT	2	6	188	193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826518
6	NC_017409	TAA	2	6	298	303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826518
7	NC_017409	TTA	2	6	315	320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826518
8	NC_017409	ATC	2	6	401	406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826518
9	NC_017409	TAA	2	6	439	444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826518
10	NC_017409	ATC	2	6	449	454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826518
11	NC_017409	TCT	2	6	554	559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826518
12	NC_017409	TTA	2	6	685	690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826518
13	NC_017409	CAC	3	9	733	741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826518
14	NC_017409	GAT	2	6	826	831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826518
15	NC_017409	TCT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826518
16	NC_017409	GAA	2	6	911	916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826518
17	NC_017409	TGG	2	6	947	952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826518
18	NC_017409	ATT	2	6	1185	1190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826518
19	NC_017409	TCT	2	6	1254	1259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826518
20	NC_017409	TAG	2	6	1261	1266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826518
21	NC_017409	TCT	2	6	1299	1304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826518
22	NC_017409	CAT	2	6	1588	1593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826518
23	NC_017409	TTC	2	6	1595	1600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826518
24	NC_017409	AGT	2	6	1690	1695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826518
25	NC_017409	TTC	2	6	1778	1783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826518
26	NC_017409	TAG	2	6	1887	1892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826518
27	NC_017409	CTT	2	6	1927	1932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826518
28	NC_017409	CAA	2	6	1960	1965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826518
29	NC_017409	GTA	2	6	1977	1982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826518
30	NC_017409	TTC	2	6	2117	2122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826518
31	NC_017409	ATT	2	6	2150	2155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826518
32	NC_017409	TCT	2	6	2172	2177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826518
33	NC_017409	TCC	2	6	2186	2191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826518
34	NC_017409	TTA	2	6	2248	2253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826518
35	NC_017409	TCA	2	6	2286	2291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826518
36	NC_017409	AGA	2	6	2315	2320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826518
37	NC_017409	TTC	2	6	2336	2341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826518
38	NC_017409	CTC	2	6	2414	2419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826518
39	NC_017409	TTC	2	6	2675	2680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826518
40	NC_017409	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826518
41	NC_017409	CTT	2	6	2833	2838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826518
42	NC_017409	CTA	2	6	2884	2889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826518
43	NC_017409	ATT	2	6	2921	2926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826518
44	NC_017409	CTT	2	6	2935	2940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826518
45	NC_017409	TGT	2	6	3033	3038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826518
46	NC_017409	TTC	2	6	3056	3061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826518
47	NC_017409	ATC	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826518
48	NC_017409	ATT	2	6	3252	3257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826518
49	NC_017409	ATG	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017409	TCT	2	6	3555	3560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017409	CTA	2	6	3664	3669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017409	TTA	2	6	3795	3800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017409	CCT	2	6	3804	3809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017409	CAC	2	6	3920	3925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017409	TAG	2	6	3953	3958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017409	GAA	2	6	4010	4015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017409	ATT	2	6	4048	4053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017409	ATT	2	6	4093	4098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017409	ATT	2	6	4117	4122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017409	ATA	2	6	4145	4150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017409	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017409	TTA	2	6	4207	4212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017409	TTA	2	6	4281	4286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017409	AAT	2	6	4308	4313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017409	AAG	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017409	GAA	2	6	4326	4331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017409	TTA	2	6	4465	4470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017409	ATA	2	6	4475	4480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017409	AAT	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017409	ATA	2	6	4613	4618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017409	TAC	2	6	4675	4680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017409	CTA	3	9	4716	4724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017409	TAT	2	6	4751	4756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017409	CAA	2	6	4795	4800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017409	ATT	3	9	4810	4818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017409	ATT	2	6	4921	4926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017409	TAA	2	6	4931	4936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017409	ATT	2	6	4939	4944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017409	TTA	2	6	5033	5038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017409	TTA	2	6	5057	5062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017409	TAA	2	6	5066	5071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017409	ATC	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017409	AAT	2	6	5135	5140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017409	ATT	2	6	5145	5150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017409	TGT	2	6	5234	5239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017409	TCA	2	6	5269	5274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017409	TTG	2	6	5347	5352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826519
88	NC_017409	CCT	2	6	5365	5370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826519
89	NC_017409	CTT	2	6	5397	5402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826519
90	NC_017409	CTC	2	6	5434	5439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826519
91	NC_017409	TAT	2	6	5478	5483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826519
92	NC_017409	ATA	2	6	5504	5509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826519
93	NC_017409	AAC	2	6	5510	5515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826519
94	NC_017409	TTA	2	6	5561	5566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826519
95	NC_017409	CTC	2	6	5572	5577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826519
96	NC_017409	ACT	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826519
97	NC_017409	AAC	2	6	5790	5795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826519
98	NC_017409	TAT	2	6	5812	5817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826519
99	NC_017409	AAT	2	6	5881	5886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017409	CTA	2	6	5923	5928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017409	ACA	2	6	5961	5966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017409	TAA	2	6	6067	6072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017409	AGA	2	6	6145	6150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017409	TAA	2	6	6195	6200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017409	TCT	2	6	6213	6218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017409	AGA	2	6	6223	6228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017409	TAA	3	9	6339	6347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017409	AAT	2	6	6464	6469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017409	AAT	2	6	6474	6479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017409	AAT	2	6	6581	6586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017409	TTC	2	6	6761	6766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826520
112	NC_017409	TAA	2	6	6800	6805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826520
113	NC_017409	ATA	2	6	6898	6903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017409	CAA	2	6	7023	7028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017409	ATT	2	6	7048	7053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017409	TAA	2	6	7069	7074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017409	ATT	2	6	7107	7112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017409	TAA	2	6	7163	7168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017409	CTT	2	6	7341	7346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017409	TGA	2	6	7519	7524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017409	TAA	2	6	7639	7644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017409	TAC	2	6	7733	7738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017409	AAC	2	6	7754	7759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017409	TAT	2	6	7769	7774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017409	TTA	2	6	7797	7802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017409	AAT	2	6	7827	7832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017409	AGA	2	6	7835	7840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017409	TTA	2	6	7851	7856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017409	ATG	2	6	7918	7923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017409	CCT	2	6	7929	7934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017409	AAT	2	6	8054	8059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826521
132	NC_017409	TGC	2	6	8202	8207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826521
133	NC_017409	ATT	2	6	8225	8230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826521
134	NC_017409	TCA	2	6	8374	8379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826521
135	NC_017409	TCA	2	6	8472	8477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826521
136	NC_017409	ATC	2	6	8489	8494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826521
137	NC_017409	CAA	2	6	8503	8508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826521
138	NC_017409	TAT	2	6	8512	8517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826521
139	NC_017409	ATA	2	6	8520	8525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826521
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.