MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp25

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017409	TA	3	6	19	24	50 %	50 %	0 %	0 %	387826518
2	NC_017409	AT	3	6	604	609	50 %	50 %	0 %	0 %	387826518
3	NC_017409	TA	3	6	1202	1207	50 %	50 %	0 %	0 %	387826518
4	NC_017409	AG	3	6	1405	1410	50 %	0 %	50 %	0 %	387826518
5	NC_017409	AT	3	6	2373	2378	50 %	50 %	0 %	0 %	387826518
6	NC_017409	AT	4	8	2480	2487	50 %	50 %	0 %	0 %	387826518
7	NC_017409	TC	3	6	2536	2541	0 %	50 %	0 %	50 %	387826518
8	NC_017409	TC	3	6	2621	2626	0 %	50 %	0 %	50 %	387826518
9	NC_017409	AT	3	6	2712	2717	50 %	50 %	0 %	0 %	387826518
10	NC_017409	TA	3	6	2815	2820	50 %	50 %	0 %	0 %	387826518
11	NC_017409	AT	3	6	2989	2994	50 %	50 %	0 %	0 %	387826518
12	NC_017409	AT	3	6	3320	3325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017409	AT	3	6	5840	5845	50 %	50 %	0 %	0 %	387826519
14	NC_017409	AT	3	6	6123	6128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017409	TA	3	6	6242	6247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017409	TA	3	6	6998	7003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017409	GA	3	6	7258	7263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017409	AT	3	6	7656	7661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017409	TA	3	6	7666	7671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017409	AC	3	6	7955	7960	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017409	AC	3	6	8112	8117	50 %	0 %	0 %	50 %	387826521
22	NC_017409	CA	3	6	9638	9643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017409	AT	3	6	9777	9782	50 %	50 %	0 %	0 %	387826523
24	NC_017409	TA	3	6	10255	10260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017409	TA	3	6	10324	10329	50 %	50 %	0 %	0 %	387826524
26	NC_017409	AT	3	6	10574	10579	50 %	50 %	0 %	0 %	387826524
27	NC_017409	AT	4	8	10729	10736	50 %	50 %	0 %	0 %	387826524
28	NC_017409	AC	3	6	11171	11176	50 %	0 %	0 %	50 %	387826525
29	NC_017409	TA	3	6	11199	11204	50 %	50 %	0 %	0 %	387826525
30	NC_017409	TA	3	6	11574	11579	50 %	50 %	0 %	0 %	387826526
31	NC_017409	TA	3	6	13142	13147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017409	TA	3	6	13223	13228	50 %	50 %	0 %	0 %	387826527
33	NC_017409	TG	3	6	14164	14169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017409	TA	3	6	14239	14244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017409	AT	3	6	14600	14605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017409	TA	3	6	14834	14839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017409	AT	3	6	14936	14941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017409	CT	3	6	15029	15034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017409	AT	3	6	15800	15805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017409	AT	3	6	16419	16424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017409	AT	3	6	16581	16586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017409	AT	3	6	16615	16620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017409	TA	3	6	16958	16963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017409	TA	3	6	18090	18095	50 %	50 %	0 %	0 %	387826528
45	NC_017409	GA	3	6	18892	18897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017409	AT	3	6	19262	19267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017409	TA	3	6	19607	19612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017409	AG	3	6	20614	20619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017409	CT	3	6	21898	21903	0 %	50 %	0 %	50 %	387826531
50	NC_017409	TA	3	6	21926	21931	50 %	50 %	0 %	0 %	387826531
51	NC_017409	CT	3	6	22456	22461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.