MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp25

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017409	A	6	6	128	133	100 %	0 %	0 %	0 %	387826518
2	NC_017409	T	6	6	242	247	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
3	NC_017409	T	7	7	795	801	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
4	NC_017409	T	6	6	937	942	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
5	NC_017409	T	6	6	1051	1056	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
6	NC_017409	T	6	6	1285	1290	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
7	NC_017409	T	6	6	1365	1370	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
8	NC_017409	A	6	6	1379	1384	100 %	0 %	0 %	0 %	387826518
9	NC_017409	T	7	7	1640	1646	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
10	NC_017409	A	6	6	1710	1715	100 %	0 %	0 %	0 %	387826518
11	NC_017409	T	7	7	1840	1846	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
12	NC_017409	T	7	7	2082	2088	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
13	NC_017409	A	6	6	2093	2098	100 %	0 %	0 %	0 %	387826518
14	NC_017409	T	7	7	2254	2260	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
15	NC_017409	T	6	6	2274	2279	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
16	NC_017409	A	8	8	2293	2300	100 %	0 %	0 %	0 %	387826518
17	NC_017409	A	6	6	2384	2389	100 %	0 %	0 %	0 %	387826518
18	NC_017409	T	6	6	2487	2492	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
19	NC_017409	T	6	6	2548	2553	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
20	NC_017409	T	6	6	2719	2724	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
21	NC_017409	T	8	8	2925	2932	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
22	NC_017409	T	6	6	3129	3134	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
23	NC_017409	A	7	7	3135	3141	100 %	0 %	0 %	0 %	387826518
24	NC_017409	A	6	6	3143	3148	100 %	0 %	0 %	0 %	387826518
25	NC_017409	T	6	6	3150	3155	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
26	NC_017409	T	7	7	3173	3179	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
27	NC_017409	T	6	6	3338	3343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017409	A	6	6	3604	3609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017409	A	10	10	3617	3626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017409	T	9	9	3631	3639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017409	T	7	7	3757	3763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017409	A	7	7	3996	4002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017409	T	6	6	4097	4102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017409	A	6	6	4189	4194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017409	A	6	6	4270	4275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017409	A	7	7	4286	4292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017409	A	6	6	4348	4353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017409	A	6	6	4398	4403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017409	T	8	8	4974	4981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017409	A	6	6	5070	5075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017409	T	6	6	5165	5170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017409	T	6	6	5495	5500	0 %	100 %	0 %	0 %	387826519
43	NC_017409	T	6	6	5639	5644	0 %	100 %	0 %	0 %	387826519
44	NC_017409	A	7	7	5749	5755	100 %	0 %	0 %	0 %	387826519
45	NC_017409	T	6	6	6151	6156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017409	A	7	7	6380	6386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017409	A	6	6	6401	6406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017409	T	6	6	6447	6452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017409	T	6	6	6538	6543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017409	A	6	6	6634	6639	100 %	0 %	0 %	0 %	387826520
51	NC_017409	T	6	6	6689	6694	0 %	100 %	0 %	0 %	387826520
52	NC_017409	T	6	6	6856	6861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017409	A	6	6	7278	7283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017409	A	6	6	7572	7577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017409	A	6	6	7579	7584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017409	A	6	6	7599	7604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017409	A	6	6	7615	7620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017409	A	7	7	7643	7649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017409	A	6	6	7685	7690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017409	A	6	6	7715	7720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017409	A	6	6	7877	7882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017409	A	6	6	8004	8009	100 %	0 %	0 %	0 %	387826521
63	NC_017409	T	6	6	8075	8080	0 %	100 %	0 %	0 %	387826521
64	NC_017409	A	6	6	8090	8095	100 %	0 %	0 %	0 %	387826521
65	NC_017409	T	6	6	8124	8129	0 %	100 %	0 %	0 %	387826521
66	NC_017409	A	6	6	8153	8158	100 %	0 %	0 %	0 %	387826521
67	NC_017409	A	7	7	8545	8551	100 %	0 %	0 %	0 %	387826521
68	NC_017409	A	7	7	8559	8565	100 %	0 %	0 %	0 %	387826521
69	NC_017409	A	6	6	8585	8590	100 %	0 %	0 %	0 %	387826521
70	NC_017409	T	9	9	8690	8698	0 %	100 %	0 %	0 %	387826522
71	NC_017409	T	6	6	8776	8781	0 %	100 %	0 %	0 %	387826522
72	NC_017409	A	6	6	9070	9075	100 %	0 %	0 %	0 %	387826522
73	NC_017409	A	6	6	9096	9101	100 %	0 %	0 %	0 %	387826522
74	NC_017409	A	7	7	9166	9172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017409	T	6	6	9260	9265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017409	T	6	6	9609	9614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017409	T	6	6	9672	9677	0 %	100 %	0 %	0 %	387826523
78	NC_017409	A	6	6	9745	9750	100 %	0 %	0 %	0 %	387826523
79	NC_017409	T	6	6	9840	9845	0 %	100 %	0 %	0 %	387826523
80	NC_017409	C	6	6	9852	9857	0 %	0 %	0 %	100 %	387826523
81	NC_017409	A	8	8	9871	9878	100 %	0 %	0 %	0 %	387826523
82	NC_017409	T	7	7	10276	10282	0 %	100 %	0 %	0 %	387826524
83	NC_017409	A	6	6	10291	10296	100 %	0 %	0 %	0 %	387826524
84	NC_017409	A	6	6	10403	10408	100 %	0 %	0 %	0 %	387826524
85	NC_017409	A	6	6	10716	10721	100 %	0 %	0 %	0 %	387826524
86	NC_017409	T	8	8	10790	10797	0 %	100 %	0 %	0 %	387826524
87	NC_017409	T	6	6	10918	10923	0 %	100 %	0 %	0 %	387826524
88	NC_017409	T	8	8	11070	11077	0 %	100 %	0 %	0 %	387826525
89	NC_017409	T	6	6	11126	11131	0 %	100 %	0 %	0 %	387826525
90	NC_017409	T	6	6	11133	11138	0 %	100 %	0 %	0 %	387826525
91	NC_017409	T	6	6	11181	11186	0 %	100 %	0 %	0 %	387826525
92	NC_017409	T	6	6	11266	11271	0 %	100 %	0 %	0 %	387826525
93	NC_017409	T	8	8	11392	11399	0 %	100 %	0 %	0 %	387826525
94	NC_017409	T	8	8	11504	11511	0 %	100 %	0 %	0 %	387826525
95	NC_017409	T	9	9	11520	11528	0 %	100 %	0 %	0 %	387826525
96	NC_017409	T	7	7	11660	11666	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
97	NC_017409	T	6	6	11830	11835	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
98	NC_017409	T	8	8	11932	11939	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
99	NC_017409	T	7	7	11962	11968	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
100	NC_017409	T	7	7	11999	12005	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
101	NC_017409	T	6	6	12042	12047	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
102	NC_017409	T	7	7	12099	12105	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
103	NC_017409	T	7	7	12165	12171	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
104	NC_017409	T	9	9	12190	12198	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
105	NC_017409	T	6	6	12219	12224	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
106	NC_017409	T	6	6	12250	12255	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
107	NC_017409	T	7	7	12320	12326	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
108	NC_017409	T	6	6	12363	12368	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
109	NC_017409	T	9	9	12555	12563	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
110	NC_017409	A	6	6	12734	12739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017409	T	6	6	12752	12757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017409	T	6	6	12921	12926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017409	T	9	9	13477	13485	0 %	100 %	0 %	0 %	387826527
114	NC_017409	A	7	7	13541	13547	100 %	0 %	0 %	0 %	387826527
115	NC_017409	T	7	7	13549	13555	0 %	100 %	0 %	0 %	387826527
116	NC_017409	T	8	8	13557	13564	0 %	100 %	0 %	0 %	387826527
117	NC_017409	T	6	6	13601	13606	0 %	100 %	0 %	0 %	387826527
118	NC_017409	A	6	6	13772	13777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017409	A	6	6	14040	14045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017409	T	6	6	14207	14212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017409	A	7	7	14320	14326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017409	A	6	6	14429	14434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017409	T	6	6	14469	14474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017409	T	6	6	14480	14485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017409	A	7	7	14582	14588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017409	A	6	6	14639	14644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017409	A	6	6	14658	14663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017409	A	7	7	14684	14690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017409	A	7	7	14696	14702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017409	T	6	6	14755	14760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017409	A	6	6	14948	14953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017409	T	8	8	15286	15293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017409	G	6	6	15307	15312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017409	A	6	6	15319	15324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017409	T	6	6	15413	15418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017409	A	6	6	15468	15473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017409	A	6	6	15486	15491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017409	A	7	7	15634	15640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017409	T	7	7	15793	15799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017409	A	7	7	15886	15892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017409	T	9	9	16279	16287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017409	A	8	8	16634	16641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017409	A	6	6	16715	16720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017409	T	6	6	16838	16843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017409	A	7	7	16929	16935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017409	A	6	6	17129	17134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017409	A	6	6	17218	17223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017409	A	6	6	17237	17242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017409	A	6	6	17260	17265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017409	T	6	6	17915	17920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017409	T	8	8	18017	18024	0 %	100 %	0 %	0 %	387826528
152	NC_017409	T	6	6	18181	18186	0 %	100 %	0 %	0 %	387826528
153	NC_017409	T	6	6	18219	18224	0 %	100 %	0 %	0 %	387826528
154	NC_017409	T	6	6	18293	18298	0 %	100 %	0 %	0 %	387826528
155	NC_017409	T	8	8	18489	18496	0 %	100 %	0 %	0 %	387826528
156	NC_017409	T	7	7	18501	18507	0 %	100 %	0 %	0 %	387826528
157	NC_017409	T	6	6	18535	18540	0 %	100 %	0 %	0 %	387826528
158	NC_017409	T	6	6	18581	18586	0 %	100 %	0 %	0 %	387826528
159	NC_017409	T	6	6	18600	18605	0 %	100 %	0 %	0 %	387826528
160	NC_017409	A	7	7	18962	18968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017409	A	8	8	18984	18991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017409	A	6	6	19069	19074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017409	A	6	6	19224	19229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017409	A	8	8	19281	19288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017409	T	6	6	19417	19422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017409	T	7	7	19486	19492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017409	A	6	6	19502	19507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017409	A	7	7	19578	19584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017409	A	6	6	19778	19783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017409	A	6	6	19867	19872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017409	A	6	6	19886	19891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017409	A	6	6	19909	19914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017409	T	6	6	20682	20687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017409	T	7	7	20759	20765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017409	T	7	7	21168	21174	0 %	100 %	0 %	0 %	387826530
176	NC_017409	T	8	8	21356	21363	0 %	100 %	0 %	0 %	387826531
177	NC_017409	T	6	6	21557	21562	0 %	100 %	0 %	0 %	387826531
178	NC_017409	A	6	6	21565	21570	100 %	0 %	0 %	0 %	387826531
179	NC_017409	T	6	6	21836	21841	0 %	100 %	0 %	0 %	387826531
180	NC_017409	T	6	6	21890	21895	0 %	100 %	0 %	0 %	387826531
181	NC_017409	C	6	6	22099	22104	0 %	0 %	0 %	100 %	387826531
182	NC_017409	A	8	8	22175	22182	100 %	0 %	0 %	0 %	387826531
183	NC_017409	T	6	6	22275	22280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017409	T	7	7	22328	22334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017409	A	6	6	22506	22511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017409	T	7	7	22658	22664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.