MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp25

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017409	T	6	6	3338	3343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017409	A	6	6	3604	3609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017409	A	10	10	3617	3626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017409	T	9	9	3631	3639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017409	T	7	7	3757	3763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017409	A	7	7	3996	4002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017409	T	6	6	4097	4102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017409	A	6	6	4189	4194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017409	A	6	6	4270	4275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017409	A	7	7	4286	4292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017409	A	6	6	4348	4353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017409	A	6	6	4398	4403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017409	T	8	8	4974	4981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017409	A	6	6	5070	5075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017409	T	6	6	5165	5170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017409	T	6	6	6151	6156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017409	A	7	7	6380	6386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017409	A	6	6	6401	6406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017409	T	6	6	6447	6452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017409	T	6	6	6538	6543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017409	T	6	6	6856	6861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017409	A	6	6	7278	7283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017409	A	6	6	7572	7577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017409	A	6	6	7579	7584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017409	A	6	6	7599	7604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017409	A	6	6	7615	7620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017409	A	7	7	7643	7649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017409	A	6	6	7685	7690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017409	A	6	6	7715	7720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017409	A	6	6	7877	7882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017409	A	7	7	9166	9172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017409	T	6	6	9260	9265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017409	T	6	6	9609	9614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017409	A	6	6	12734	12739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017409	T	6	6	12752	12757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017409	T	6	6	12921	12926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017409	A	6	6	13772	13777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017409	A	6	6	14040	14045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017409	T	6	6	14207	14212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017409	A	7	7	14320	14326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017409	A	6	6	14429	14434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017409	T	6	6	14469	14474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017409	T	6	6	14480	14485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017409	A	7	7	14582	14588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017409	A	6	6	14639	14644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017409	A	6	6	14658	14663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017409	A	7	7	14684	14690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017409	A	7	7	14696	14702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017409	T	6	6	14755	14760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017409	A	6	6	14948	14953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017409	T	8	8	15286	15293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017409	G	6	6	15307	15312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017409	A	6	6	15319	15324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017409	T	6	6	15413	15418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017409	A	6	6	15468	15473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017409	A	6	6	15486	15491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017409	A	7	7	15634	15640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017409	T	7	7	15793	15799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017409	A	7	7	15886	15892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017409	T	9	9	16279	16287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017409	A	8	8	16634	16641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017409	A	6	6	16715	16720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017409	T	6	6	16838	16843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017409	A	7	7	16929	16935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017409	A	6	6	17129	17134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017409	A	6	6	17218	17223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017409	A	6	6	17237	17242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017409	A	6	6	17260	17265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017409	T	6	6	17915	17920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017409	A	7	7	18962	18968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017409	A	8	8	18984	18991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017409	A	6	6	19069	19074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017409	A	6	6	19224	19229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017409	A	8	8	19281	19288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017409	T	6	6	19417	19422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017409	T	7	7	19486	19492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017409	A	6	6	19502	19507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017409	A	7	7	19578	19584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017409	A	6	6	19778	19783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017409	A	6	6	19867	19872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017409	A	6	6	19886	19891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017409	A	6	6	19909	19914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017409	T	6	6	20682	20687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017409	T	7	7	20759	20765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017409	T	6	6	22275	22280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017409	T	7	7	22328	22334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017409	A	6	6	22506	22511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017409	T	7	7	22658	22664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.