MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp25

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017409	A	6	6	128	133	100 %	0 %	0 %	0 %	387826518
2	NC_017409	T	6	6	242	247	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
3	NC_017409	T	7	7	795	801	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
4	NC_017409	T	6	6	937	942	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
5	NC_017409	T	6	6	1051	1056	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
6	NC_017409	T	6	6	1285	1290	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
7	NC_017409	T	6	6	1365	1370	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
8	NC_017409	A	6	6	1379	1384	100 %	0 %	0 %	0 %	387826518
9	NC_017409	T	7	7	1640	1646	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
10	NC_017409	A	6	6	1710	1715	100 %	0 %	0 %	0 %	387826518
11	NC_017409	T	7	7	1840	1846	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
12	NC_017409	T	7	7	2082	2088	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
13	NC_017409	A	6	6	2093	2098	100 %	0 %	0 %	0 %	387826518
14	NC_017409	T	7	7	2254	2260	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
15	NC_017409	T	6	6	2274	2279	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
16	NC_017409	A	8	8	2293	2300	100 %	0 %	0 %	0 %	387826518
17	NC_017409	A	6	6	2384	2389	100 %	0 %	0 %	0 %	387826518
18	NC_017409	T	6	6	2487	2492	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
19	NC_017409	T	6	6	2548	2553	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
20	NC_017409	T	6	6	2719	2724	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
21	NC_017409	T	8	8	2925	2932	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
22	NC_017409	T	6	6	3129	3134	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
23	NC_017409	A	7	7	3135	3141	100 %	0 %	0 %	0 %	387826518
24	NC_017409	A	6	6	3143	3148	100 %	0 %	0 %	0 %	387826518
25	NC_017409	T	6	6	3150	3155	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
26	NC_017409	T	7	7	3173	3179	0 %	100 %	0 %	0 %	387826518
27	NC_017409	T	6	6	5495	5500	0 %	100 %	0 %	0 %	387826519
28	NC_017409	T	6	6	5639	5644	0 %	100 %	0 %	0 %	387826519
29	NC_017409	A	7	7	5749	5755	100 %	0 %	0 %	0 %	387826519
30	NC_017409	A	6	6	6634	6639	100 %	0 %	0 %	0 %	387826520
31	NC_017409	T	6	6	6689	6694	0 %	100 %	0 %	0 %	387826520
32	NC_017409	A	6	6	8004	8009	100 %	0 %	0 %	0 %	387826521
33	NC_017409	T	6	6	8075	8080	0 %	100 %	0 %	0 %	387826521
34	NC_017409	A	6	6	8090	8095	100 %	0 %	0 %	0 %	387826521
35	NC_017409	T	6	6	8124	8129	0 %	100 %	0 %	0 %	387826521
36	NC_017409	A	6	6	8153	8158	100 %	0 %	0 %	0 %	387826521
37	NC_017409	A	7	7	8545	8551	100 %	0 %	0 %	0 %	387826521
38	NC_017409	A	7	7	8559	8565	100 %	0 %	0 %	0 %	387826521
39	NC_017409	A	6	6	8585	8590	100 %	0 %	0 %	0 %	387826521
40	NC_017409	T	9	9	8690	8698	0 %	100 %	0 %	0 %	387826522
41	NC_017409	T	6	6	8776	8781	0 %	100 %	0 %	0 %	387826522
42	NC_017409	A	6	6	9070	9075	100 %	0 %	0 %	0 %	387826522
43	NC_017409	A	6	6	9096	9101	100 %	0 %	0 %	0 %	387826522
44	NC_017409	T	6	6	9672	9677	0 %	100 %	0 %	0 %	387826523
45	NC_017409	A	6	6	9745	9750	100 %	0 %	0 %	0 %	387826523
46	NC_017409	T	6	6	9840	9845	0 %	100 %	0 %	0 %	387826523
47	NC_017409	C	6	6	9852	9857	0 %	0 %	0 %	100 %	387826523
48	NC_017409	A	8	8	9871	9878	100 %	0 %	0 %	0 %	387826523
49	NC_017409	T	7	7	10276	10282	0 %	100 %	0 %	0 %	387826524
50	NC_017409	A	6	6	10291	10296	100 %	0 %	0 %	0 %	387826524
51	NC_017409	A	6	6	10403	10408	100 %	0 %	0 %	0 %	387826524
52	NC_017409	A	6	6	10716	10721	100 %	0 %	0 %	0 %	387826524
53	NC_017409	T	8	8	10790	10797	0 %	100 %	0 %	0 %	387826524
54	NC_017409	T	6	6	10918	10923	0 %	100 %	0 %	0 %	387826524
55	NC_017409	T	8	8	11070	11077	0 %	100 %	0 %	0 %	387826525
56	NC_017409	T	6	6	11126	11131	0 %	100 %	0 %	0 %	387826525
57	NC_017409	T	6	6	11133	11138	0 %	100 %	0 %	0 %	387826525
58	NC_017409	T	6	6	11181	11186	0 %	100 %	0 %	0 %	387826525
59	NC_017409	T	6	6	11266	11271	0 %	100 %	0 %	0 %	387826525
60	NC_017409	T	8	8	11392	11399	0 %	100 %	0 %	0 %	387826525
61	NC_017409	T	8	8	11504	11511	0 %	100 %	0 %	0 %	387826525
62	NC_017409	T	9	9	11520	11528	0 %	100 %	0 %	0 %	387826525
63	NC_017409	T	7	7	11660	11666	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
64	NC_017409	T	6	6	11830	11835	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
65	NC_017409	T	8	8	11932	11939	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
66	NC_017409	T	7	7	11962	11968	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
67	NC_017409	T	7	7	11999	12005	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
68	NC_017409	T	6	6	12042	12047	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
69	NC_017409	T	7	7	12099	12105	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
70	NC_017409	T	7	7	12165	12171	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
71	NC_017409	T	9	9	12190	12198	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
72	NC_017409	T	6	6	12219	12224	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
73	NC_017409	T	6	6	12250	12255	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
74	NC_017409	T	7	7	12320	12326	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
75	NC_017409	T	6	6	12363	12368	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
76	NC_017409	T	9	9	12555	12563	0 %	100 %	0 %	0 %	387826526
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78	NC_017409	A	7	7	13541	13547	100 %	0 %	0 %	0 %	387826527
79	NC_017409	T	7	7	13549	13555	0 %	100 %	0 %	0 %	387826527
80	NC_017409	T	8	8	13557	13564	0 %	100 %	0 %	0 %	387826527
81	NC_017409	T	6	6	13601	13606	0 %	100 %	0 %	0 %	387826527
82	NC_017409	T	8	8	18017	18024	0 %	100 %	0 %	0 %	387826528
83	NC_017409	T	6	6	18181	18186	0 %	100 %	0 %	0 %	387826528
84	NC_017409	T	6	6	18219	18224	0 %	100 %	0 %	0 %	387826528
85	NC_017409	T	6	6	18293	18298	0 %	100 %	0 %	0 %	387826528
86	NC_017409	T	8	8	18489	18496	0 %	100 %	0 %	0 %	387826528
87	NC_017409	T	7	7	18501	18507	0 %	100 %	0 %	0 %	387826528
88	NC_017409	T	6	6	18535	18540	0 %	100 %	0 %	0 %	387826528
89	NC_017409	T	6	6	18581	18586	0 %	100 %	0 %	0 %	387826528
90	NC_017409	T	6	6	18600	18605	0 %	100 %	0 %	0 %	387826528
91	NC_017409	T	7	7	21168	21174	0 %	100 %	0 %	0 %	387826530
92	NC_017409	T	8	8	21356	21363	0 %	100 %	0 %	0 %	387826531
93	NC_017409	T	6	6	21557	21562	0 %	100 %	0 %	0 %	387826531
94	NC_017409	A	6	6	21565	21570	100 %	0 %	0 %	0 %	387826531
95	NC_017409	T	6	6	21836	21841	0 %	100 %	0 %	0 %	387826531
96	NC_017409	T	6	6	21890	21895	0 %	100 %	0 %	0 %	387826531
97	NC_017409	C	6	6	22099	22104	0 %	0 %	0 %	100 %	387826531
98	NC_017409	A	8	8	22175	22182	100 %	0 %	0 %	0 %	387826531

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.