MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-6

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017408	TTATAC	2	12	1953	1964	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017408	CTTTTT	5	30	2829	2858	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387826489
3	NC_017408	TTTCTT	2	12	3823	3834	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387826491
4	NC_017408	TTGAGC	2	12	7755	7766	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387826493
5	NC_017408	GCTCTC	2	12	8708	8719	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017408	TGATCT	2	12	9584	9595	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387826495
7	NC_017408	GTTGCA	2	12	12619	12630	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387826500
8	NC_017408	CTCAGC	2	12	13179	13190	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387826501
9	NC_017408	TCTTTA	2	12	17398	17409	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387826506
10	NC_017408	CATTAA	2	12	17912	17923	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387826507
11	NC_017408	CTCGTA	2	12	18612	18623	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387826507
12	NC_017408	GCAAAC	2	12	23729	23740	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387826512
13	NC_017408	AATTTA	2	12	25401	25412	50 %	50 %	0 %	0 %	387826515
14	NC_017408	AATTTA	2	12	25455	25466	50 %	50 %	0 %	0 %	387826515
15	NC_017408	ATATTA	2	12	26812	26823	50 %	50 %	0 %	0 %	387826516

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.