MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-6

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017408	AAGAT	2	10	22	31	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017408	AAATA	2	10	51	60	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017408	ACAAA	2	10	1811	1820	80 %	0 %	0 %	20 %	387826488
4	NC_017408	TTTAG	2	10	4451	4460	20 %	60 %	20 %	0 %	387826492
5	NC_017408	AATTC	2	10	4583	4592	40 %	40 %	0 %	20 %	387826492
6	NC_017408	TTTTC	2	10	6100	6109	0 %	80 %	0 %	20 %	387826493
7	NC_017408	ACTTC	2	10	6157	6166	20 %	40 %	0 %	40 %	387826493
8	NC_017408	ATATC	2	10	7373	7382	40 %	40 %	0 %	20 %	387826493
9	NC_017408	CTGTA	2	10	12001	12010	20 %	40 %	20 %	20 %	387826499
10	NC_017408	AAATT	2	10	13366	13375	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017408	TTCAT	2	10	13397	13406	20 %	60 %	0 %	20 %	387826502
12	NC_017408	TGGTG	2	10	14330	14339	0 %	40 %	60 %	0 %	387826502
13	NC_017408	CAAGC	2	10	15011	15020	40 %	0 %	20 %	40 %	387826503
14	NC_017408	TTGAT	2	10	15093	15102	20 %	60 %	20 %	0 %	387826503
15	NC_017408	TGCTT	2	10	15342	15351	0 %	60 %	20 %	20 %	387826503
16	NC_017408	TATTT	2	10	16662	16671	20 %	80 %	0 %	0 %	387826505
17	NC_017408	TCAAG	2	10	16976	16985	40 %	20 %	20 %	20 %	387826506
18	NC_017408	CTTTT	2	10	17121	17130	0 %	80 %	0 %	20 %	387826506
19	NC_017408	AATGC	2	10	18017	18026	40 %	20 %	20 %	20 %	387826507
20	NC_017408	ACATA	2	10	19382	19391	60 %	20 %	0 %	20 %	387826507
21	NC_017408	TAGTT	2	10	19614	19623	20 %	60 %	20 %	0 %	387826507
22	NC_017408	CGATT	2	10	20308	20317	20 %	40 %	20 %	20 %	387826508
23	NC_017408	AAAGT	2	10	23445	23454	60 %	20 %	20 %	0 %	387826512
24	NC_017408	CCCCA	2	10	24983	24992	20 %	0 %	0 %	80 %	387826514
25	NC_017408	AAATT	2	10	26195	26204	60 %	40 %	0 %	0 %	387826516

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.