MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-6

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017408	A	6	6	308	313	100 %	0 %	0 %	0 %	387826487
2	NC_017408	T	7	7	614	620	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
3	NC_017408	A	7	7	621	627	100 %	0 %	0 %	0 %	387826487
4	NC_017408	T	7	7	970	976	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
5	NC_017408	T	7	7	991	997	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
6	NC_017408	T	6	6	1146	1151	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
7	NC_017408	T	7	7	1225	1231	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
8	NC_017408	T	6	6	1288	1293	0 %	100 %	0 %	0 %	387826488
9	NC_017408	A	8	8	1663	1670	100 %	0 %	0 %	0 %	387826488
10	NC_017408	T	6	6	1745	1750	0 %	100 %	0 %	0 %	387826488
11	NC_017408	T	8	8	2309	2316	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
12	NC_017408	T	6	6	2328	2333	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
13	NC_017408	T	6	6	2362	2367	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
14	NC_017408	T	7	7	2508	2514	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
15	NC_017408	T	6	6	2649	2654	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
16	NC_017408	A	6	6	2972	2977	100 %	0 %	0 %	0 %	387826490
17	NC_017408	T	6	6	2992	2997	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
18	NC_017408	T	6	6	3102	3107	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
19	NC_017408	T	6	6	3145	3150	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
20	NC_017408	T	6	6	3609	3614	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
21	NC_017408	T	6	6	3705	3710	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
22	NC_017408	T	7	7	3719	3725	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
23	NC_017408	T	6	6	3746	3751	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
24	NC_017408	T	6	6	3781	3786	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
25	NC_017408	T	6	6	3833	3838	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
26	NC_017408	T	6	6	3884	3889	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
27	NC_017408	T	6	6	3962	3967	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
28	NC_017408	T	7	7	4010	4016	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
29	NC_017408	T	8	8	4043	4050	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
30	NC_017408	T	8	8	4093	4100	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
31	NC_017408	T	6	6	4148	4153	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
32	NC_017408	T	6	6	4187	4192	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
33	NC_017408	T	8	8	4223	4230	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
34	NC_017408	T	8	8	4269	4276	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
35	NC_017408	T	6	6	4340	4345	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
36	NC_017408	T	6	6	4541	4546	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
37	NC_017408	T	6	6	4561	4566	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
38	NC_017408	T	6	6	4860	4865	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
39	NC_017408	T	6	6	4927	4932	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
40	NC_017408	T	8	8	5047	5054	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
41	NC_017408	T	7	7	5091	5097	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
42	NC_017408	T	7	7	5169	5175	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
43	NC_017408	T	6	6	5540	5545	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
44	NC_017408	T	6	6	5786	5791	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
45	NC_017408	T	6	6	5922	5927	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
46	NC_017408	T	7	7	5967	5973	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
47	NC_017408	T	6	6	6005	6010	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
48	NC_017408	T	8	8	6198	6205	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
49	NC_017408	A	6	6	6306	6311	100 %	0 %	0 %	0 %	387826493
50	NC_017408	T	6	6	6368	6373	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
51	NC_017408	T	6	6	6618	6623	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
52	NC_017408	T	7	7	6652	6658	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
53	NC_017408	T	6	6	6767	6772	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
54	NC_017408	T	7	7	7114	7120	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
55	NC_017408	T	6	6	7130	7135	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
56	NC_017408	T	6	6	7326	7331	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
57	NC_017408	T	8	8	8612	8619	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
58	NC_017408	T	6	6	8987	8992	0 %	100 %	0 %	0 %	387826494
59	NC_017408	T	8	8	9159	9166	0 %	100 %	0 %	0 %	387826494
60	NC_017408	T	6	6	9238	9243	0 %	100 %	0 %	0 %	387826494
61	NC_017408	T	6	6	9510	9515	0 %	100 %	0 %	0 %	387826495
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63	NC_017408	T	6	6	11043	11048	0 %	100 %	0 %	0 %	387826497
64	NC_017408	T	8	8	11885	11892	0 %	100 %	0 %	0 %	387826499
65	NC_017408	T	6	6	12118	12123	0 %	100 %	0 %	0 %	387826499
66	NC_017408	T	6	6	12580	12585	0 %	100 %	0 %	0 %	387826500
67	NC_017408	C	7	7	12813	12819	0 %	0 %	0 %	100 %	387826501
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69	NC_017408	T	7	7	13233	13239	0 %	100 %	0 %	0 %	387826501
70	NC_017408	T	6	6	13297	13302	0 %	100 %	0 %	0 %	387826501
71	NC_017408	A	6	6	13635	13640	100 %	0 %	0 %	0 %	387826502
72	NC_017408	T	8	8	13844	13851	0 %	100 %	0 %	0 %	387826502
73	NC_017408	T	8	8	13980	13987	0 %	100 %	0 %	0 %	387826502
74	NC_017408	T	6	6	14045	14050	0 %	100 %	0 %	0 %	387826502
75	NC_017408	T	7	7	14110	14116	0 %	100 %	0 %	0 %	387826502
76	NC_017408	T	7	7	14196	14202	0 %	100 %	0 %	0 %	387826502
77	NC_017408	T	6	6	14377	14382	0 %	100 %	0 %	0 %	387826502
78	NC_017408	T	7	7	14628	14634	0 %	100 %	0 %	0 %	387826503
79	NC_017408	A	6	6	14824	14829	100 %	0 %	0 %	0 %	387826503
80	NC_017408	T	6	6	14913	14918	0 %	100 %	0 %	0 %	387826503
81	NC_017408	T	6	6	15306	15311	0 %	100 %	0 %	0 %	387826503
82	NC_017408	T	6	6	15433	15438	0 %	100 %	0 %	0 %	387826503
83	NC_017408	A	6	6	15758	15763	100 %	0 %	0 %	0 %	387826504
84	NC_017408	T	7	7	15905	15911	0 %	100 %	0 %	0 %	387826504
85	NC_017408	T	6	6	16478	16483	0 %	100 %	0 %	0 %	387826505
86	NC_017408	T	6	6	16714	16719	0 %	100 %	0 %	0 %	387826505
87	NC_017408	T	6	6	17175	17180	0 %	100 %	0 %	0 %	387826506
88	NC_017408	T	6	6	17443	17448	0 %	100 %	0 %	0 %	387826506
89	NC_017408	T	7	7	17504	17510	0 %	100 %	0 %	0 %	387826506
90	NC_017408	T	6	6	17644	17649	0 %	100 %	0 %	0 %	387826507
91	NC_017408	T	8	8	17999	18006	0 %	100 %	0 %	0 %	387826507
92	NC_017408	T	7	7	18008	18014	0 %	100 %	0 %	0 %	387826507
93	NC_017408	T	8	8	18653	18660	0 %	100 %	0 %	0 %	387826507
94	NC_017408	A	6	6	18673	18678	100 %	0 %	0 %	0 %	387826507
95	NC_017408	A	6	6	18821	18826	100 %	0 %	0 %	0 %	387826507
96	NC_017408	T	6	6	19293	19298	0 %	100 %	0 %	0 %	387826507
97	NC_017408	T	6	6	19622	19627	0 %	100 %	0 %	0 %	387826507
98	NC_017408	A	6	6	19693	19698	100 %	0 %	0 %	0 %	387826507
99	NC_017408	T	6	6	19967	19972	0 %	100 %	0 %	0 %	387826507
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102	NC_017408	T	6	6	20316	20321	0 %	100 %	0 %	0 %	387826508
103	NC_017408	A	6	6	20578	20583	100 %	0 %	0 %	0 %	387826508
104	NC_017408	T	8	8	20661	20668	0 %	100 %	0 %	0 %	387826509
105	NC_017408	T	6	6	20817	20822	0 %	100 %	0 %	0 %	387826509
106	NC_017408	A	8	8	20837	20844	100 %	0 %	0 %	0 %	387826509
107	NC_017408	T	6	6	20978	20983	0 %	100 %	0 %	0 %	387826509
108	NC_017408	T	6	6	21616	21621	0 %	100 %	0 %	0 %	387826510
109	NC_017408	A	6	6	21649	21654	100 %	0 %	0 %	0 %	387826510
110	NC_017408	A	7	7	22599	22605	100 %	0 %	0 %	0 %	387826512
111	NC_017408	A	6	6	22674	22679	100 %	0 %	0 %	0 %	387826512
112	NC_017408	A	7	7	22962	22968	100 %	0 %	0 %	0 %	387826512
113	NC_017408	A	7	7	23101	23107	100 %	0 %	0 %	0 %	387826512
114	NC_017408	A	6	6	23279	23284	100 %	0 %	0 %	0 %	387826512
115	NC_017408	A	8	8	23299	23306	100 %	0 %	0 %	0 %	387826512
116	NC_017408	A	6	6	23613	23618	100 %	0 %	0 %	0 %	387826512
117	NC_017408	A	6	6	23907	23912	100 %	0 %	0 %	0 %	387826512
118	NC_017408	A	7	7	24538	24544	100 %	0 %	0 %	0 %	387826514
119	NC_017408	T	6	6	24635	24640	0 %	100 %	0 %	0 %	387826514
120	NC_017408	A	7	7	24649	24655	100 %	0 %	0 %	0 %	387826514
121	NC_017408	A	8	8	24706	24713	100 %	0 %	0 %	0 %	387826514
122	NC_017408	A	6	6	24938	24943	100 %	0 %	0 %	0 %	387826514
123	NC_017408	A	6	6	26058	26063	100 %	0 %	0 %	0 %	387826516
124	NC_017408	T	7	7	26118	26124	0 %	100 %	0 %	0 %	387826516
125	NC_017408	A	7	7	26184	26190	100 %	0 %	0 %	0 %	387826516
126	NC_017408	T	6	6	26455	26460	0 %	100 %	0 %	0 %	387826516
127	NC_017408	T	6	6	26638	26643	0 %	100 %	0 %	0 %	387826516
128	NC_017408	A	7	7	26792	26798	100 %	0 %	0 %	0 %	387826516
129	NC_017408	A	8	8	26803	26810	100 %	0 %	0 %	0 %	387826516

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.