MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-4

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017407	TTTAAT	2	12	4511	4522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017407	CGCAAT	2	12	5555	5566	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387826825
3	NC_017407	ATAAAA	2	12	6605	6616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826826
4	NC_017407	GAAAAA	2	12	6910	6921	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017407	AATCAT	2	12	7226	7237	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017407	ATTAAT	2	12	7323	7334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017407	ATTAAA	2	12	8217	8228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017407	GAAAAA	2	12	12401	12412	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017407	ATTGGT	2	12	17761	17772	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017407	TAAAAT	2	12	19233	19244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017407	GCTTCA	2	12	21593	21604	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387826834
12	NC_017407	GTTGAA	2	12	24830	24841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826836
13	NC_017407	AATATC	2	12	26580	26591	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017407	AATTAA	2	12	26792	26803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017407	TAAAGA	2	12	27138	27149	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017407	TATTAA	2	12	27726	27737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017407	AAAGAA	2	12	28947	28958	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387826838
18	NC_017407	CAAAAA	2	12	29042	29053	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387826838

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.