MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-4

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017407	GTTTT	2	10	7	16	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017407	ATTTA	2	10	228	237	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017407	AAGAA	2	10	3883	3892	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017407	AAACA	2	10	4106	4115	80 %	0 %	0 %	20 %	387826824
5	NC_017407	CAAAA	2	10	5097	5106	80 %	0 %	0 %	20 %	387826825
6	NC_017407	TATAT	2	10	5229	5238	40 %	60 %	0 %	0 %	387826825
7	NC_017407	TAAAA	2	10	5450	5459	80 %	20 %	0 %	0 %	387826825
8	NC_017407	AAAAG	2	10	6196	6205	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017407	TAAAA	2	10	6660	6669	80 %	20 %	0 %	0 %	387826826
10	NC_017407	TAATT	2	10	7052	7061	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017407	CATTG	2	10	7801	7810	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017407	TTTAC	2	10	7939	7948	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017407	TTAAA	2	10	8190	8199	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017407	TAATA	2	10	8510	8519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017407	ATAAA	2	10	8652	8661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017407	AATTA	2	10	9529	9538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017407	TTACT	2	10	11880	11889	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017407	TTTCT	2	10	12561	12570	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017407	ATATT	2	10	12659	12668	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017407	AAATT	2	10	12750	12759	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017407	AAATT	2	10	15299	15308	60 %	40 %	0 %	0 %	387826832
22	NC_017407	ATTAT	2	10	15327	15336	40 %	60 %	0 %	0 %	387826832
23	NC_017407	AAAGA	2	10	15838	15847	80 %	0 %	20 %	0 %	387826833
24	NC_017407	CAAAA	2	10	16150	16159	80 %	0 %	0 %	20 %	387826833
25	NC_017407	TTTGT	2	10	17046	17055	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017407	AAAAT	2	10	17226	17235	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017407	TAAAA	2	10	17398	17407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017407	TTAAA	2	10	17607	17616	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017407	TATCG	2	10	21076	21085	20 %	40 %	20 %	20 %	387826834
30	NC_017407	TGCTA	2	10	21307	21316	20 %	40 %	20 %	20 %	387826834
31	NC_017407	TTAAT	2	10	24333	24342	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017407	AATTT	2	10	24466	24475	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017407	GTTTT	2	10	24720	24729	0 %	80 %	20 %	0 %	387826836
34	NC_017407	TTTGA	2	10	25154	25163	20 %	60 %	20 %	0 %	387826836
35	NC_017407	ATTTA	2	10	25398	25407	40 %	60 %	0 %	0 %	387826836
36	NC_017407	AATTT	2	10	25530	25539	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017407	GTTTT	2	10	25784	25793	0 %	80 %	20 %	0 %	387826837
38	NC_017407	TTTGA	2	10	26224	26233	20 %	60 %	20 %	0 %	387826837
39	NC_017407	GTTTT	2	10	26365	26374	0 %	80 %	20 %	0 %	387826837
40	NC_017407	ATTTA	2	10	26492	26501	40 %	60 %	0 %	0 %	387826837
41	NC_017407	AATTT	2	10	26621	26630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017407	TTTTA	2	10	27189	27198	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017407	TAAAA	2	10	27318	27327	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017407	TAATA	2	10	27774	27783	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017407	TCAAA	2	10	28190	28199	60 %	20 %	0 %	20 %	387826838

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.