MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-4

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017407	ATTT	2	8	218	225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017407	TTCT	2	8	559	566	0 %	75 %	0 %	25 %	387826818
3	NC_017407	TCAA	2	8	1641	1648	50 %	25 %	0 %	25 %	387826819
4	NC_017407	AATC	2	8	2366	2373	50 %	25 %	0 %	25 %	387826820
5	NC_017407	ATTA	2	8	2942	2949	50 %	50 %	0 %	0 %	387826821
6	NC_017407	CAAT	2	8	3451	3458	50 %	25 %	0 %	25 %	387826822
7	NC_017407	TAAA	2	8	3913	3920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017407	AGCC	2	8	4317	4324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017407	ACAA	2	8	4824	4831	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017407	AAAT	2	8	5008	5015	75 %	25 %	0 %	0 %	387826825
11	NC_017407	AAAT	2	8	5203	5210	75 %	25 %	0 %	0 %	387826825
12	NC_017407	AAAT	2	8	5300	5307	75 %	25 %	0 %	0 %	387826825
13	NC_017407	TTAA	2	8	5730	5737	50 %	50 %	0 %	0 %	387826825
14	NC_017407	TTAA	2	8	5749	5756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017407	GATT	2	8	6281	6288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017407	TGTT	2	8	6690	6697	0 %	75 %	25 %	0 %	387826826
17	NC_017407	AAAT	2	8	6780	6787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017407	AAAT	2	8	7706	7713	75 %	25 %	0 %	0 %	387826827
19	NC_017407	ATAA	2	8	7768	7775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017407	CAAA	2	8	7995	8002	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017407	TATG	2	8	8574	8581	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017407	GATA	2	8	8698	8705	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017407	ATAG	2	8	8812	8819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017407	ATAA	2	8	9394	9401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017407	ATCA	2	8	9437	9444	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017407	ATTT	4	16	9489	9504	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017407	TTAA	2	8	9508	9515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017407	ATAA	5	20	9559	9578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017407	GAAG	2	8	10419	10426	50 %	0 %	50 %	0 %	387826829
30	NC_017407	ATAA	2	8	10705	10712	75 %	25 %	0 %	0 %	387826829
31	NC_017407	GGTA	2	8	11120	11127	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017407	TATC	2	8	11242	11249	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017407	ATTG	2	8	11461	11468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017407	ATTT	2	8	12031	12038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017407	ATTA	2	8	12166	12173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017407	TAAA	2	8	12328	12335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017407	CAAA	2	8	12361	12368	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017407	CTAA	2	8	12595	12602	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017407	AAAT	2	8	13081	13088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017407	TTTA	2	8	13245	13252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017407	CAAC	2	8	13471	13478	50 %	0 %	0 %	50 %	387826830
42	NC_017407	ATCA	2	8	13627	13634	50 %	25 %	0 %	25 %	387826830
43	NC_017407	CAAG	2	8	13666	13673	50 %	0 %	25 %	25 %	387826830
44	NC_017407	GTTT	2	8	13942	13949	0 %	75 %	25 %	0 %	387826830
45	NC_017407	GAAA	2	8	13971	13978	75 %	0 %	25 %	0 %	387826830
46	NC_017407	CAAA	2	8	14380	14387	75 %	0 %	0 %	25 %	387826830
47	NC_017407	AATG	2	8	14565	14572	50 %	25 %	25 %	0 %	387826831
48	NC_017407	TAAA	2	8	15594	15601	75 %	25 %	0 %	0 %	387826832
49	NC_017407	ATTA	2	8	15860	15867	50 %	50 %	0 %	0 %	387826833
50	NC_017407	AAAT	2	8	15934	15941	75 %	25 %	0 %	0 %	387826833
51	NC_017407	TAAA	2	8	17128	17135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017407	TAAA	2	8	17328	17335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017407	TAAA	2	8	17750	17757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017407	TTTA	2	8	17789	17796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017407	ATAA	2	8	17812	17819	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017407	TTTA	2	8	18533	18540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017407	GCAA	2	8	18546	18553	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017407	TATT	2	8	18777	18784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017407	ATGA	2	8	19157	19164	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017407	TTTA	2	8	19175	19182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017407	ATTT	2	8	19393	19400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017407	ATTT	2	8	20387	20394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017407	ATTT	2	8	20487	20494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017407	TTTA	2	8	20645	20652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017407	TGTT	2	8	20793	20800	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017407	TATT	2	8	20858	20865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017407	ATTT	2	8	20883	20890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017407	TTAA	2	8	20921	20928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017407	GCTT	2	8	21235	21242	0 %	50 %	25 %	25 %	387826834
70	NC_017407	ATTA	2	8	21274	21281	50 %	50 %	0 %	0 %	387826834
71	NC_017407	TATC	2	8	21423	21430	25 %	50 %	0 %	25 %	387826834
72	NC_017407	TTGT	2	8	21446	21453	0 %	75 %	25 %	0 %	387826834
73	NC_017407	ATTT	2	8	21917	21924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017407	ATTA	2	8	22028	22035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017407	TTTA	2	8	22096	22103	25 %	75 %	0 %	0 %	387826835
76	NC_017407	AAAT	2	8	22437	22444	75 %	25 %	0 %	0 %	387826835
77	NC_017407	AAAT	2	8	22832	22839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017407	AATA	2	8	23146	23153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017407	TCTT	2	8	24076	24083	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017407	TAAT	2	8	24182	24189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017407	TTTC	2	8	24213	24220	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017407	TTAT	2	8	24303	24310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017407	TGTT	2	8	25235	25242	0 %	75 %	25 %	0 %	387826836
84	NC_017407	TTTG	2	8	26719	26726	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017407	AATT	2	8	27401	27408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017407	TATT	2	8	27739	27746	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017407	AAAT	2	8	27750	27757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017407	AAAG	2	8	28443	28450	75 %	0 %	25 %	0 %	387826838
89	NC_017407	GATA	2	8	28466	28473	50 %	25 %	25 %	0 %	387826838
90	NC_017407	TTAT	2	8	28659	28666	25 %	75 %	0 %	0 %	387826838
91	NC_017407	ATTT	2	8	29212	29219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017407	CTTT	2	8	29463	29470	0 %	75 %	0 %	25 %	387826839
93	NC_017407	ATCA	2	8	29531	29538	50 %	25 %	0 %	25 %	387826839
94	NC_017407	CTAT	2	8	29562	29569	25 %	50 %	0 %	25 %	387826839
95	NC_017407	ATTT	2	8	29599	29606	25 %	75 %	0 %	0 %	387826839
96	NC_017407	TAAT	2	8	29731	29738	50 %	50 %	0 %	0 %	387826839
97	NC_017407	ATTA	2	8	29930	29937	50 %	50 %	0 %	0 %	387826839

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.