MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-4

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017407	TTCT	2	8	559	566	0 %	75 %	0 %	25 %	387826818
2	NC_017407	TCAA	2	8	1641	1648	50 %	25 %	0 %	25 %	387826819
3	NC_017407	AATC	2	8	2366	2373	50 %	25 %	0 %	25 %	387826820
4	NC_017407	ATTA	2	8	2942	2949	50 %	50 %	0 %	0 %	387826821
5	NC_017407	CAAT	2	8	3451	3458	50 %	25 %	0 %	25 %	387826822
6	NC_017407	AAAT	2	8	5008	5015	75 %	25 %	0 %	0 %	387826825
7	NC_017407	AAAT	2	8	5203	5210	75 %	25 %	0 %	0 %	387826825
8	NC_017407	AAAT	2	8	5300	5307	75 %	25 %	0 %	0 %	387826825
9	NC_017407	TTAA	2	8	5730	5737	50 %	50 %	0 %	0 %	387826825
10	NC_017407	TGTT	2	8	6690	6697	0 %	75 %	25 %	0 %	387826826
11	NC_017407	AAAT	2	8	7706	7713	75 %	25 %	0 %	0 %	387826827
12	NC_017407	GAAG	2	8	10419	10426	50 %	0 %	50 %	0 %	387826829
13	NC_017407	ATAA	2	8	10705	10712	75 %	25 %	0 %	0 %	387826829
14	NC_017407	CAAC	2	8	13471	13478	50 %	0 %	0 %	50 %	387826830
15	NC_017407	ATCA	2	8	13627	13634	50 %	25 %	0 %	25 %	387826830
16	NC_017407	CAAG	2	8	13666	13673	50 %	0 %	25 %	25 %	387826830
17	NC_017407	GTTT	2	8	13942	13949	0 %	75 %	25 %	0 %	387826830
18	NC_017407	GAAA	2	8	13971	13978	75 %	0 %	25 %	0 %	387826830
19	NC_017407	CAAA	2	8	14380	14387	75 %	0 %	0 %	25 %	387826830
20	NC_017407	AATG	2	8	14565	14572	50 %	25 %	25 %	0 %	387826831
21	NC_017407	TAAA	2	8	15594	15601	75 %	25 %	0 %	0 %	387826832
22	NC_017407	ATTA	2	8	15860	15867	50 %	50 %	0 %	0 %	387826833
23	NC_017407	AAAT	2	8	15934	15941	75 %	25 %	0 %	0 %	387826833
24	NC_017407	GCTT	2	8	21235	21242	0 %	50 %	25 %	25 %	387826834
25	NC_017407	ATTA	2	8	21274	21281	50 %	50 %	0 %	0 %	387826834
26	NC_017407	TATC	2	8	21423	21430	25 %	50 %	0 %	25 %	387826834
27	NC_017407	TTGT	2	8	21446	21453	0 %	75 %	25 %	0 %	387826834
28	NC_017407	TTTA	2	8	22096	22103	25 %	75 %	0 %	0 %	387826835
29	NC_017407	AAAT	2	8	22437	22444	75 %	25 %	0 %	0 %	387826835
30	NC_017407	TGTT	2	8	25235	25242	0 %	75 %	25 %	0 %	387826836
31	NC_017407	AAAG	2	8	28443	28450	75 %	0 %	25 %	0 %	387826838
32	NC_017407	GATA	2	8	28466	28473	50 %	25 %	25 %	0 %	387826838
33	NC_017407	TTAT	2	8	28659	28666	25 %	75 %	0 %	0 %	387826838
34	NC_017407	CTTT	2	8	29463	29470	0 %	75 %	0 %	25 %	387826839
35	NC_017407	ATCA	2	8	29531	29538	50 %	25 %	0 %	25 %	387826839
36	NC_017407	CTAT	2	8	29562	29569	25 %	50 %	0 %	25 %	387826839
37	NC_017407	ATTT	2	8	29599	29606	25 %	75 %	0 %	0 %	387826839
38	NC_017407	TAAT	2	8	29731	29738	50 %	50 %	0 %	0 %	387826839
39	NC_017407	ATTA	2	8	29930	29937	50 %	50 %	0 %	0 %	387826839

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.