MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-4

Total Repeats: 497

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017407	GGA	2	6	238	243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017407	ATT	2	6	254	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826818
3	NC_017407	GAT	2	6	342	347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826818
4	NC_017407	CTT	2	6	369	374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826818
5	NC_017407	AGA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
6	NC_017407	GAA	2	6	633	638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
7	NC_017407	GAA	2	6	675	680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
8	NC_017407	AGT	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826818
9	NC_017407	TAA	2	6	815	820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826818
10	NC_017407	ATA	2	6	859	864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826818
11	NC_017407	GAA	2	6	921	926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
12	NC_017407	TAA	2	6	968	973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826818
13	NC_017407	TGG	2	6	1022	1027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826818
14	NC_017407	AGA	2	6	1052	1057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
15	NC_017407	AAG	2	6	1061	1066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
16	NC_017407	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
17	NC_017407	AAT	2	6	1203	1208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826818
18	NC_017407	GAA	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
19	NC_017407	ATT	2	6	1354	1359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017407	TAG	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017407	CAT	2	6	1372	1377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017407	TAC	2	6	1471	1476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017407	AAC	2	6	1479	1484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017407	ATT	2	6	1490	1495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017407	CTT	2	6	1561	1566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826819
26	NC_017407	AAT	2	6	1649	1654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826819
27	NC_017407	ATT	2	6	1659	1664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826819
28	NC_017407	CTA	2	6	1692	1697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826819
29	NC_017407	AAT	2	6	1889	1894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017407	TAT	2	6	1916	1921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017407	ATT	2	6	1975	1980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017407	ATT	2	6	1988	1993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017407	TTA	2	6	1994	1999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017407	AAT	2	6	2033	2038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017407	TTA	2	6	2235	2240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826820
36	NC_017407	AGA	2	6	2296	2301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826820
37	NC_017407	ATC	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826820
38	NC_017407	TAG	3	9	2461	2469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826820
39	NC_017407	TAC	2	6	2477	2482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826820
40	NC_017407	ATA	2	6	2660	2665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826821
41	NC_017407	AAC	2	6	2688	2693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826821
42	NC_017407	ATT	2	6	2748	2753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826821
43	NC_017407	AAT	2	6	2768	2773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826821
44	NC_017407	CAA	2	6	2847	2852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826821
45	NC_017407	ATA	2	6	2891	2896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826821
46	NC_017407	TAT	2	6	2933	2938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826821
47	NC_017407	ACT	2	6	2982	2987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826821
48	NC_017407	ACA	2	6	3013	3018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826821
49	NC_017407	CTA	2	6	3036	3041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826821
50	NC_017407	GAA	2	6	3141	3146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017407	TAA	2	6	3211	3216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826822
52	NC_017407	ACA	2	6	3235	3240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826822
53	NC_017407	TAG	2	6	3272	3277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826822
54	NC_017407	ACA	2	6	3322	3327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826822
55	NC_017407	TTA	2	6	3357	3362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826822
56	NC_017407	AAC	2	6	3387	3392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826822
57	NC_017407	TAA	2	6	3407	3412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826822
58	NC_017407	TAC	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826822
59	NC_017407	ACT	2	6	3490	3495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826822
60	NC_017407	TAT	2	6	3595	3600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017407	AAT	2	6	3631	3636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017407	TTA	3	9	3798	3806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826823
63	NC_017407	TAA	2	6	3877	3882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017407	TTA	2	6	3982	3987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826824
65	NC_017407	ACA	2	6	4026	4031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826824
66	NC_017407	AAC	2	6	4035	4040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826824
67	NC_017407	TAA	2	6	4055	4060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826824
68	NC_017407	CAA	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826824
69	NC_017407	CTA	2	6	4252	4257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017407	ATC	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017407	ATA	2	6	4695	4700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017407	ATT	2	6	4760	4765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017407	ATT	2	6	4860	4865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017407	ATA	2	6	4886	4891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017407	TAA	2	6	4902	4907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017407	TAA	2	6	5047	5052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826825
77	NC_017407	AGA	2	6	5075	5080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826825
78	NC_017407	ATT	2	6	5091	5096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826825
79	NC_017407	AGA	2	6	5120	5125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826825
80	NC_017407	AGA	2	6	5130	5135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826825
81	NC_017407	ATA	2	6	5170	5175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826825
82	NC_017407	ACA	2	6	5343	5348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826825
83	NC_017407	TAA	2	6	5488	5493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826825
84	NC_017407	ATC	2	6	5515	5520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826825
85	NC_017407	AGA	2	6	5540	5545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826825
86	NC_017407	ATC	2	6	5625	5630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826825
87	NC_017407	CAA	2	6	5651	5656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826825
88	NC_017407	AAT	2	6	5661	5666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826825
89	NC_017407	GAT	2	6	5670	5675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826825
90	NC_017407	CTT	2	6	5698	5703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826825
91	NC_017407	TAG	2	6	5719	5724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826825
92	NC_017407	TCT	2	6	5797	5802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017407	TAG	2	6	5826	5831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017407	TAA	2	6	5891	5896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017407	TTA	2	6	5897	5902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017407	TTA	2	6	5910	5915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017407	TTC	2	6	5925	5930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017407	TAA	2	6	5947	5952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017407	TCT	2	6	5955	5960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017407	TTA	2	6	6018	6023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017407	ATT	2	6	6055	6060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017407	TAA	2	6	6088	6093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017407	TAA	2	6	6176	6181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017407	TCA	2	6	6327	6332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826826
105	NC_017407	GAT	2	6	6366	6371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826826
106	NC_017407	AGC	2	6	6399	6404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826826
107	NC_017407	GTA	2	6	6454	6459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826826
108	NC_017407	AAT	2	6	6469	6474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826826
109	NC_017407	TAA	2	6	6485	6490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826826
110	NC_017407	TGA	2	6	6591	6596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826826
111	NC_017407	AAC	2	6	6636	6641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826826
112	NC_017407	TAT	2	6	7247	7252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017407	CCA	2	6	7338	7343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017407	AAT	2	6	7356	7361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017407	TAA	2	6	7493	7498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017407	ATT	2	6	7613	7618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826827
117	NC_017407	AGA	2	6	7676	7681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826827
118	NC_017407	AGA	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017407	AAT	2	6	8099	8104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017407	AAT	2	6	8134	8139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017407	ATA	2	6	8145	8150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017407	TAT	2	6	8173	8178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017407	AGA	2	6	8262	8267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017407	ATT	2	6	8312	8317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017407	ATT	2	6	8448	8453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017407	ATT	2	6	8489	8494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017407	TGT	2	6	8496	8501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017407	ATG	2	6	8619	8624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017407	AGC	2	6	8629	8634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017407	ACT	2	6	8728	8733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017407	ACA	2	6	8766	8771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017407	ACA	2	6	8783	8788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017407	GAT	2	6	8854	8859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017407	ATT	2	6	9045	9050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826828
135	NC_017407	CAA	2	6	9071	9076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826828
136	NC_017407	AGA	2	6	9144	9149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826828
137	NC_017407	GAA	2	6	9207	9212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826828
138	NC_017407	TAT	2	6	9218	9223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826828
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