MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-4

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017407	TA	3	6	178	183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017407	TG	3	6	271	276	0 %	50 %	50 %	0 %	387826818
3	NC_017407	AC	3	6	933	938	50 %	0 %	0 %	50 %	387826818
4	NC_017407	AT	3	6	1285	1290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017407	AT	3	6	1612	1617	50 %	50 %	0 %	0 %	387826819
6	NC_017407	TA	3	6	2306	2311	50 %	50 %	0 %	0 %	387826820
7	NC_017407	TC	3	6	2393	2398	0 %	50 %	0 %	50 %	387826820
8	NC_017407	AT	3	6	2422	2427	50 %	50 %	0 %	0 %	387826820
9	NC_017407	TA	3	6	2598	2603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017407	AT	3	6	2868	2873	50 %	50 %	0 %	0 %	387826821
11	NC_017407	AT	3	6	2923	2928	50 %	50 %	0 %	0 %	387826821
12	NC_017407	AT	3	6	3107	3112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017407	TA	3	6	3116	3121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017407	AC	3	6	3226	3231	50 %	0 %	0 %	50 %	387826822
15	NC_017407	TA	3	6	3694	3699	50 %	50 %	0 %	0 %	387826823
16	NC_017407	TA	4	8	4714	4721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017407	AT	3	6	5477	5482	50 %	50 %	0 %	0 %	387826825
18	NC_017407	AT	3	6	7387	7392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017407	AT	3	6	7546	7551	50 %	50 %	0 %	0 %	387826827
20	NC_017407	TA	3	6	7780	7785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017407	TC	3	6	7835	7840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017407	TA	4	8	8010	8017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017407	TG	3	6	8580	8585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017407	AT	3	6	8668	8673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017407	AT	3	6	9448	9453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017407	AT	3	6	10595	10600	50 %	50 %	0 %	0 %	387826829
27	NC_017407	TA	4	8	10865	10872	50 %	50 %	0 %	0 %	387826829
28	NC_017407	TA	3	6	11230	11235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017407	TA	3	6	11257	11262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017407	TA	3	6	11378	11383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017407	CT	3	6	11384	11389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017407	TA	5	10	11815	11824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017407	TA	3	6	11913	11918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017407	AT	3	6	12125	12130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017407	TA	3	6	12481	12486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017407	AT	3	6	12515	12520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017407	TA	3	6	12696	12701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017407	AT	3	6	12731	12736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017407	TA	3	6	12839	12844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017407	TA	3	6	13019	13024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017407	TA	3	6	13045	13050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017407	AC	3	6	13334	13339	50 %	0 %	0 %	50 %	387826830
43	NC_017407	TA	3	6	13393	13398	50 %	50 %	0 %	0 %	387826830
44	NC_017407	TA	3	6	14179	14184	50 %	50 %	0 %	0 %	387826830
45	NC_017407	AT	3	6	15123	15128	50 %	50 %	0 %	0 %	387826832
46	NC_017407	TA	3	6	15221	15226	50 %	50 %	0 %	0 %	387826832
47	NC_017407	TA	3	6	15458	15463	50 %	50 %	0 %	0 %	387826832
48	NC_017407	AT	3	6	16028	16033	50 %	50 %	0 %	0 %	387826833
49	NC_017407	AT	3	6	16112	16117	50 %	50 %	0 %	0 %	387826833
50	NC_017407	AT	3	6	16414	16419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017407	TA	4	8	16734	16741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017407	TA	3	6	16883	16888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017407	TA	3	6	16920	16925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017407	TG	3	6	17109	17114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017407	AT	4	8	17138	17145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017407	TA	3	6	18138	18143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017407	AT	3	6	18196	18201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017407	AT	3	6	18340	18345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017407	AT	3	6	19197	19202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017407	AT	3	6	19504	19509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017407	TA	3	6	20495	20500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017407	AT	3	6	21551	21556	50 %	50 %	0 %	0 %	387826834
63	NC_017407	CA	3	6	21639	21644	50 %	0 %	0 %	50 %	387826834
64	NC_017407	TA	3	6	22014	22019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017407	AT	3	6	22918	22923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017407	TG	3	6	23090	23095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017407	AT	3	6	23249	23254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017407	GT	3	6	23334	23339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017407	AT	3	6	24022	24027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017407	TA	3	6	24035	24040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017407	TA	3	6	24321	24326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017407	AT	3	6	26561	26566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017407	TA	3	6	27062	27067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017407	AT	3	6	27264	27269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017407	TC	3	6	27460	27465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017407	TA	3	6	27557	27562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017407	AT	3	6	27831	27836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017407	AT	3	6	27970	27975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017407	AG	3	6	28314	28319	50 %	0 %	50 %	0 %	387826838
80	NC_017407	AT	4	8	28614	28621	50 %	50 %	0 %	0 %	387826838
81	NC_017407	AC	3	6	29175	29180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017407	CT	3	6	29442	29447	0 %	50 %	0 %	50 %	387826839

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.