MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-4

Total Repeats: 253

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017407	T	6	6	278	283	0 %	100 %	0 %	0 %	387826818
2	NC_017407	A	6	6	808	813	100 %	0 %	0 %	0 %	387826818
3	NC_017407	A	6	6	925	930	100 %	0 %	0 %	0 %	387826818
4	NC_017407	A	6	6	1555	1560	100 %	0 %	0 %	0 %	387826819
5	NC_017407	T	7	7	1717	1723	0 %	100 %	0 %	0 %	387826819
6	NC_017407	A	7	7	1783	1789	100 %	0 %	0 %	0 %	387826819
7	NC_017407	T	6	6	1844	1849	0 %	100 %	0 %	0 %	387826819
8	NC_017407	A	6	6	1862	1867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017407	A	6	6	2061	2066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017407	A	7	7	2264	2270	100 %	0 %	0 %	0 %	387826820
11	NC_017407	G	7	7	2333	2339	0 %	0 %	100 %	0 %	387826820
12	NC_017407	A	6	6	2452	2457	100 %	0 %	0 %	0 %	387826820
13	NC_017407	A	6	6	2538	2543	100 %	0 %	0 %	0 %	387826820
14	NC_017407	T	8	8	2584	2591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017407	A	8	8	2609	2616	100 %	0 %	0 %	0 %	387826821
16	NC_017407	A	7	7	2619	2625	100 %	0 %	0 %	0 %	387826821
17	NC_017407	A	6	6	2643	2648	100 %	0 %	0 %	0 %	387826821
18	NC_017407	A	8	8	2781	2788	100 %	0 %	0 %	0 %	387826821
19	NC_017407	A	6	6	2816	2821	100 %	0 %	0 %	0 %	387826821
20	NC_017407	A	6	6	3054	3059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017407	A	8	8	3121	3128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017407	A	6	6	3130	3135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017407	A	7	7	3167	3173	100 %	0 %	0 %	0 %	387826822
24	NC_017407	A	6	6	3254	3259	100 %	0 %	0 %	0 %	387826822
25	NC_017407	A	7	7	3424	3430	100 %	0 %	0 %	0 %	387826822
26	NC_017407	A	6	6	3688	3693	100 %	0 %	0 %	0 %	387826823
27	NC_017407	A	6	6	4132	4137	100 %	0 %	0 %	0 %	387826824
28	NC_017407	A	8	8	4166	4173	100 %	0 %	0 %	0 %	387826824
29	NC_017407	A	6	6	4246	4251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017407	T	6	6	4459	4464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017407	A	6	6	4523	4528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017407	T	7	7	4593	4599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34	NC_017407	A	6	6	4906	4911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37	NC_017407	A	9	9	5135	5143	100 %	0 %	0 %	0 %	387826825
38	NC_017407	A	6	6	5409	5414	100 %	0 %	0 %	0 %	387826825
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41	NC_017407	T	8	8	5777	5784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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119	NC_017407	T	6	6	12472	12477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017407	C	9	9	12525	12533	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.