MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-4

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017407	A	6	6	1862	1867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017407	A	6	6	2061	2066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017407	T	8	8	2584	2591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017407	A	6	6	3054	3059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017407	A	8	8	3121	3128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017407	A	6	6	3130	3135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017407	A	6	6	4246	4251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017407	T	6	6	4459	4464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017407	A	6	6	4523	4528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017407	T	7	7	4593	4599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017407	T	8	8	4729	4736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017407	A	6	6	4906	4911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017407	T	8	8	5777	5784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017407	T	6	6	5786	5791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017407	T	7	7	5983	5989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017407	T	6	6	6737	6742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017407	A	6	6	6771	6776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017407	A	6	6	6924	6929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017407	A	6	6	7021	7026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017407	T	6	6	7060	7065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017407	A	6	6	7257	7262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017407	A	6	6	7295	7300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017407	A	6	6	7468	7473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017407	A	6	6	7858	7863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017407	A	6	6	7919	7924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017407	A	6	6	7980	7985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017407	A	6	6	8017	8022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017407	A	6	6	8073	8078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017407	T	6	6	8086	8091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017407	A	6	6	8180	8185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017407	A	6	6	8324	8329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017407	A	7	7	8351	8357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017407	A	6	6	8400	8405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017407	T	6	6	8452	8457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017407	T	6	6	8586	8591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017407	A	7	7	8638	8644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017407	A	6	6	8659	8664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017407	A	6	6	8683	8688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017407	T	6	6	8844	8849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017407	A	6	6	8876	8881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017407	A	7	7	8979	8985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017407	A	6	6	9371	9376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017407	A	6	6	9467	9472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017407	A	6	6	11099	11104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017407	A	6	6	11197	11202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017407	T	7	7	11655	11661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017407	C	7	7	11733	11739	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_017407	A	7	7	11896	11902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017407	T	6	6	12036	12041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017407	A	6	6	12156	12161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017407	A	6	6	12308	12313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017407	A	6	6	12333	12338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017407	A	6	6	12420	12425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017407	A	6	6	12448	12453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017407	T	6	6	12472	12477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017407	C	9	9	12525	12533	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_017407	T	6	6	12538	12543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017407	T	7	7	12825	12831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017407	A	6	6	12992	12997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017407	T	7	7	13223	13229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017407	A	6	6	16422	16427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017407	A	8	8	16490	16497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017407	A	7	7	16813	16819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017407	A	7	7	16947	16953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017407	T	6	6	17081	17086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017407	A	6	6	17188	17193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017407	T	7	7	17451	17457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017407	T	8	8	17659	17666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017407	T	6	6	17710	17715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017407	A	6	6	17734	17739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017407	T	7	7	17799	17805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017407	A	6	6	18213	18218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017407	T	8	8	18368	18375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017407	T	7	7	18517	18523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017407	T	6	6	18801	18806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017407	A	6	6	18810	18815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017407	T	6	6	18956	18961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017407	T	6	6	19037	19042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017407	T	6	6	19093	19098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017407	A	6	6	19324	19329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017407	T	6	6	19821	19826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017407	T	7	7	20102	20108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017407	T	6	6	20146	20151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017407	T	6	6	20170	20175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017407	T	6	6	20184	20189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017407	T	6	6	20458	20463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017407	T	6	6	20478	20483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017407	T	6	6	20624	20629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017407	C	6	6	20637	20642	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_017407	T	7	7	21838	21844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017407	T	6	6	22064	22069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017407	C	6	6	22653	22658	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_017407	T	6	6	22846	22851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017407	T	8	8	23172	23179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017407	T	6	6	23286	23291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017407	T	8	8	23433	23440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017407	A	6	6	23447	23452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017407	T	6	6	23474	23479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017407	T	6	6	23512	23517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017407	A	6	6	23525	23530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017407	T	6	6	23540	23545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017407	T	6	6	23810	23815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017407	T	7	7	23863	23869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017407	T	8	8	24221	24228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017407	T	6	6	24249	24254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017407	T	6	6	24391	24396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017407	A	7	7	24515	24521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017407	T	7	7	24568	24574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017407	A	7	7	25579	25585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017407	T	7	7	25632	25638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017407	A	6	6	27166	27171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017407	G	6	6	27199	27204	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017407	T	7	7	27446	27452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017407	T	7	7	27531	27537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017407	T	6	6	27589	27594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017407	T	6	6	27676	27681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017407	T	6	6	27836	27841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017407	A	6	6	27884	27889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017407	T	6	6	28042	28047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.