MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-5

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017406	T	6	6	565	570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017406	T	8	8	803	810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017406	T	8	8	1070	1077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017406	A	8	8	1078	1085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017406	T	6	6	1180	1185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017406	A	7	7	1354	1360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017406	T	6	6	2763	2768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017406	T	7	7	2842	2848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017406	A	7	7	4382	4388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017406	A	6	6	4482	4487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017406	A	7	7	4554	4560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017406	A	6	6	4667	4672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017406	A	7	7	4687	4693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017406	A	6	6	4907	4912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017406	A	6	6	5107	5112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017406	A	7	7	5124	5130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017406	T	6	6	5246	5251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017406	A	6	6	6266	6271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017406	A	6	6	6574	6579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017406	A	6	6	6696	6701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017406	T	6	6	7026	7031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017406	A	7	7	7045	7051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017406	A	6	6	7104	7109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017406	T	6	6	11032	11037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017406	A	6	6	11287	11292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017406	A	8	8	11300	11307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017406	T	8	8	11312	11319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017406	T	7	7	11437	11443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017406	C	6	6	11460	11465	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_017406	A	6	6	11683	11688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017406	T	7	7	11783	11789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017406	A	6	6	11876	11881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017406	A	6	6	11883	11888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017406	A	6	6	11957	11962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017406	A	7	7	12035	12041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017406	A	6	6	12085	12090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017406	A	6	6	12151	12156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017406	A	6	6	12218	12223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017406	A	6	6	12284	12289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017406	A	6	6	12351	12356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017406	A	6	6	12417	12422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017406	A	6	6	12484	12489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017406	A	6	6	12550	12555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017406	A	6	6	12617	12622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017406	A	6	6	12683	12688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017406	A	6	6	12750	12755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017406	A	6	6	12816	12821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017406	A	6	6	12883	12888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017406	A	6	6	12949	12954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017406	A	6	6	13016	13021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017406	A	6	6	13082	13087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017406	A	6	6	13149	13154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017406	A	6	6	13215	13220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017406	A	6	6	13282	13287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017406	A	6	6	13348	13353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017406	A	6	6	13415	13420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017406	A	6	6	13480	13485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017406	A	6	6	13547	13552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017406	A	6	6	13613	13618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017406	A	6	6	13680	13685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017406	A	6	6	13744	13749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017406	A	6	6	13810	13815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017406	A	6	6	13876	13881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017406	A	6	6	13943	13948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017406	A	6	6	14009	14014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017406	A	6	6	14076	14081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017406	A	6	6	14142	14147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017406	A	6	6	14209	14214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017406	A	6	6	14275	14280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017406	A	6	6	14342	14347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017406	A	6	6	14408	14413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017406	A	6	6	14475	14480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017406	A	6	6	14541	14546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017406	A	6	6	14608	14613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017406	A	6	6	14674	14679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017406	A	6	6	14741	14746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017406	A	6	6	14807	14812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017406	A	6	6	14874	14879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017406	A	6	6	14940	14945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017406	A	6	6	15007	15012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017406	A	6	6	15073	15078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017406	A	6	6	15140	15145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017406	A	6	6	15206	15211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017406	A	6	6	15273	15278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017406	A	6	6	15339	15344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017406	A	6	6	15406	15411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017406	T	9	9	15611	15619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017406	A	6	6	15682	15687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017406	A	6	6	18833	18838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017406	T	7	7	19028	19034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017406	A	6	6	19046	19051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017406	T	6	6	19240	19245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017406	T	6	6	20234	20239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017406	A	6	6	20240	20245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017406	A	6	6	20393	20398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017406	T	6	6	20484	20489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017406	A	6	6	20637	20642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017406	T	7	7	20739	20745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017406	G	6	6	20915	20920	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017406	A	6	6	21132	21137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017406	T	6	6	21299	21304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017406	T	7	7	21412	21418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017406	T	7	7	22489	22495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017406	T	6	6	22567	22572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017406	T	6	6	22661	22666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017406	T	6	6	22703	22708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017406	T	8	8	23064	23071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017406	T	6	6	23106	23111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017406	T	9	9	23251	23259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017406	T	6	6	23288	23293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017406	T	6	6	23730	23735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017406	T	6	6	24240	24245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017406	T	7	7	24249	24255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017406	T	6	6	24386	24391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017406	T	6	6	24489	24494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017406	T	6	6	24563	24568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.