MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-3

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017405	AACTA	2	10	1349	1358	60 %	20 %	0 %	20 %	387826797
2	NC_017405	TAAAC	2	10	1650	1659	60 %	20 %	0 %	20 %	387826798
3	NC_017405	TAAAC	2	10	1764	1773	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017405	TAATT	2	10	4841	4850	40 %	60 %	0 %	0 %	387826800
5	NC_017405	TTTAT	2	10	5316	5325	20 %	80 %	0 %	0 %	387826800
6	NC_017405	TAAAA	2	10	6857	6866	80 %	20 %	0 %	0 %	387826800
7	NC_017405	ATATT	2	10	7057	7066	40 %	60 %	0 %	0 %	387826800
8	NC_017405	ATTTT	2	10	7584	7593	20 %	80 %	0 %	0 %	387826800
9	NC_017405	AGATT	2	10	9610	9619	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017405	TAAAT	2	10	10072	10081	60 %	40 %	0 %	0 %	387826803
11	NC_017405	TAAAT	2	10	10126	10135	60 %	40 %	0 %	0 %	387826803
12	NC_017405	TAAAT	2	10	10180	10189	60 %	40 %	0 %	0 %	387826803
13	NC_017405	TAAAT	2	10	10234	10243	60 %	40 %	0 %	0 %	387826803
14	NC_017405	TAAAT	2	10	10288	10297	60 %	40 %	0 %	0 %	387826803
15	NC_017405	TTTAT	2	10	10718	10727	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017405	GCTTT	2	10	11019	11028	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017405	ATTTT	2	10	11205	11214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017405	ATAGA	2	10	12266	12275	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017405	GATAT	2	10	15986	15995	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017405	TATTT	2	10	16372	16381	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017405	CTAAG	2	10	17216	17225	40 %	20 %	20 %	20 %	387826807
22	NC_017405	TATAC	2	10	17529	17538	40 %	40 %	0 %	20 %	387826808
23	NC_017405	AAAGT	2	10	17898	17907	60 %	20 %	20 %	0 %	387826808
24	NC_017405	AAATT	2	10	18939	18948	60 %	40 %	0 %	0 %	387826810
25	NC_017405	CAAAA	2	10	19611	19620	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017405	AAATA	2	10	20018	20027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017405	TTAAT	2	10	20128	20137	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017405	TAATT	2	10	20604	20613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017405	ATATT	2	10	21373	21382	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017405	AAGAA	2	10	21556	21565	80 %	0 %	20 %	0 %	387826811
31	NC_017405	TATTT	2	10	22584	22593	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017405	TATTT	2	10	23822	23831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017405	TTTGG	2	10	23989	23998	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017405	AATTA	2	10	24107	24116	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017405	CTATA	2	10	24534	24543	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017405	AAAAT	2	10	25060	25069	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017405	TTATT	2	10	25773	25782	20 %	80 %	0 %	0 %	387826814
38	NC_017405	ATCAA	2	10	26687	26696	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017405	TAAAA	2	10	28517	28526	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017405	TAAAC	2	10	28559	28568	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.