MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-3

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017405	AACTA	2	10	1349	1358	60 %	20 %	0 %	20 %	387826797
2	NC_017405	TAAAC	2	10	1650	1659	60 %	20 %	0 %	20 %	387826798
3	NC_017405	TAATT	2	10	4841	4850	40 %	60 %	0 %	0 %	387826800
4	NC_017405	TTTAT	2	10	5316	5325	20 %	80 %	0 %	0 %	387826800
5	NC_017405	TAAAA	2	10	6857	6866	80 %	20 %	0 %	0 %	387826800
6	NC_017405	ATATT	2	10	7057	7066	40 %	60 %	0 %	0 %	387826800
7	NC_017405	ATTTT	2	10	7584	7593	20 %	80 %	0 %	0 %	387826800
8	NC_017405	TAAAT	2	10	10072	10081	60 %	40 %	0 %	0 %	387826803
9	NC_017405	TAAAT	2	10	10126	10135	60 %	40 %	0 %	0 %	387826803
10	NC_017405	TAAAT	2	10	10180	10189	60 %	40 %	0 %	0 %	387826803
11	NC_017405	TAAAT	2	10	10234	10243	60 %	40 %	0 %	0 %	387826803
12	NC_017405	TAAAT	2	10	10288	10297	60 %	40 %	0 %	0 %	387826803
13	NC_017405	CTAAG	2	10	17216	17225	40 %	20 %	20 %	20 %	387826807
14	NC_017405	TATAC	2	10	17529	17538	40 %	40 %	0 %	20 %	387826808
15	NC_017405	AAAGT	2	10	17898	17907	60 %	20 %	20 %	0 %	387826808
16	NC_017405	AAATT	2	10	18939	18948	60 %	40 %	0 %	0 %	387826810
17	NC_017405	AAGAA	2	10	21556	21565	80 %	0 %	20 %	0 %	387826811
18	NC_017405	TTATT	2	10	25773	25782	20 %	80 %	0 %	0 %	387826814

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.