MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-3

Total Repeats: 431

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017405	ATA	2	6	93	98	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017405	AAT	2	6	179	184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017405	TAA	2	6	224	229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017405	TAT	2	6	230	235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017405	ATT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
6	NC_017405	ATT	2	6	295	300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
7	NC_017405	TTA	2	6	301	306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
8	NC_017405	AAT	2	6	340	345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826796
9	NC_017405	ATT	2	6	457	462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
10	NC_017405	ATA	2	6	476	481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826796
11	NC_017405	CTA	2	6	488	493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826796
12	NC_017405	ATT	3	9	553	561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
13	NC_017405	GGA	2	6	655	660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826796
14	NC_017405	ACA	2	6	707	712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826796
15	NC_017405	CGA	2	6	732	737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826796
16	NC_017405	AAT	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826796
17	NC_017405	TAG	4	12	789	800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826796
18	NC_017405	TTA	2	6	801	806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
19	NC_017405	ATA	2	6	820	825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826796
20	NC_017405	ATT	2	6	847	852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
21	NC_017405	ATA	2	6	986	991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017405	AAC	2	6	1014	1019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017405	ATT	2	6	1074	1079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826797
24	NC_017405	AAT	2	6	1093	1098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826797
25	NC_017405	ATA	2	6	1148	1153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826797
26	NC_017405	CAA	2	6	1172	1177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826797
27	NC_017405	TAT	2	6	1258	1263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826797
28	NC_017405	CAA	2	6	1295	1300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826797
29	NC_017405	ACT	2	6	1307	1312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826797
30	NC_017405	CTA	3	9	1361	1369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826797
31	NC_017405	TAA	2	6	1535	1540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826798
32	NC_017405	ACA	2	6	1559	1564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826798
33	NC_017405	TAG	2	6	1596	1601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826798
34	NC_017405	TTC	3	9	1797	1805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017405	AAG	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017405	TAT	2	6	1914	1919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017405	AGT	2	6	1972	1977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017405	AAT	2	6	2062	2067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017405	TAA	2	6	2079	2084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017405	ATT	2	6	2099	2104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017405	TAG	2	6	2166	2171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017405	TAA	2	6	2268	2273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826799
43	NC_017405	CAG	2	6	2312	2317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826799
44	NC_017405	CTT	2	6	2333	2338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826799
45	NC_017405	CTT	2	6	2362	2367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826799
46	NC_017405	CAA	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826799
47	NC_017405	CAA	2	6	2501	2506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826799
48	NC_017405	AGA	2	6	2511	2516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826799
49	NC_017405	ACA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826799
50	NC_017405	CAT	2	6	2603	2608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826799
51	NC_017405	ATC	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826799
52	NC_017405	TTC	2	6	2676	2681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826799
53	NC_017405	TTA	2	6	2707	2712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826799
54	NC_017405	ATA	2	6	2794	2799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826799
55	NC_017405	AAT	2	6	2849	2854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826799
56	NC_017405	CAA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826799
57	NC_017405	CTA	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826799
58	NC_017405	ATA	2	6	2924	2929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826799
59	NC_017405	TAA	2	6	3287	3292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017405	TCA	2	6	3357	3362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017405	GAT	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017405	ATT	2	6	3445	3450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017405	AAT	2	6	3453	3458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017405	ATT	2	6	3504	3509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017405	ATC	2	6	3612	3617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017405	ATT	2	6	3765	3770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017405	TCA	2	6	3838	3843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017405	TAA	3	9	3846	3854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017405	AAT	2	6	3919	3924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826800
70	NC_017405	TTA	2	6	3937	3942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
71	NC_017405	TTC	2	6	3956	3961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
72	NC_017405	TCT	2	6	4011	4016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
73	NC_017405	TTA	2	6	4107	4112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
74	NC_017405	TCT	3	9	4239	4247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
75	NC_017405	TCT	2	6	4310	4315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
76	NC_017405	ATA	2	6	4353	4358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826800
77	NC_017405	AAT	2	6	4359	4364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826800
78	NC_017405	TGA	2	6	4614	4619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
79	NC_017405	ATT	2	6	4655	4660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
80	NC_017405	AAT	2	6	4793	4798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826800
81	NC_017405	ATC	2	6	4862	4867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826800
82	NC_017405	TAT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
83	NC_017405	TTA	2	6	5146	5151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
84	NC_017405	CAC	3	9	5194	5202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826800
85	NC_017405	TTG	2	6	5235	5240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826800
86	NC_017405	GAT	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
87	NC_017405	GGA	2	6	5409	5414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826800
88	NC_017405	CTT	2	6	5437	5442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
89	NC_017405	ATT	2	6	5646	5651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
90	NC_017405	TTC	2	6	5675	5680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
91	NC_017405	TCT	2	6	5760	5765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
92	NC_017405	ATG	2	6	5888	5893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
93	NC_017405	AGC	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826800
94	NC_017405	CTC	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826800
95	NC_017405	AAT	2	6	6074	6079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826800
96	NC_017405	GCT	2	6	6235	6240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826800
97	NC_017405	TGA	2	6	6248	6253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
98	NC_017405	ATC	2	6	6275	6280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826800
99	NC_017405	CTT	2	6	6388	6393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
100	NC_017405	CAA	2	6	6421	6426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826800
101	NC_017405	AGT	2	6	6437	6442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
102	NC_017405	TTC	2	6	6578	6583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
103	NC_017405	ATT	2	6	6611	6616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
104	NC_017405	TCC	2	6	6647	6652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826800
105	NC_017405	TTA	2	6	6709	6714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
106	NC_017405	TCA	2	6	6747	6752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826800
107	NC_017405	AGA	2	6	6776	6781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826800
108	NC_017405	TCT	2	6	6798	6803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
109	NC_017405	ATC	2	6	6974	6979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826800
110	NC_017405	TTC	2	6	7136	7141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
111	NC_017405	TCT	2	6	7287	7292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
112	NC_017405	CTT	2	6	7294	7299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
113	NC_017405	ATG	2	6	7327	7332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
114	NC_017405	ATT	2	6	7382	7387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
115	NC_017405	CTT	2	6	7396	7401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
116	NC_017405	AGT	2	6	7446	7451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
117	NC_017405	TGT	2	6	7494	7499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826800
118	NC_017405	TTC	2	6	7517	7522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
119	NC_017405	CTT	2	6	7760	7765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017405	ATT	2	6	7898	7903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017405	TTA	2	6	7930	7935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017405	TCT	2	6	8096	8101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826801
123	NC_017405	ACA	2	6	8177	8182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826801
124	NC_017405	ATA	2	6	8186	8191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826801
125	NC_017405	TAA	2	6	8328	8333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826801
126	NC_017405	ACA	2	6	8366	8371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826801
127	NC_017405	TTC	2	6	8377	8382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826801
128	NC_017405	TAG	2	6	8423	8428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826801
129	NC_017405	ATT	2	6	8588	8593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017405	TAT	2	6	8598	8603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017405	TCT	2	6	8657	8662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017405	AAT	2	6	8710	8715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017405	ATG	2	6	8830	8835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017405	CAA	2	6	8838	8843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017405	TAA	2	6	8875	8880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017405	ACT	2	6	9031	9036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.