MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-3

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017405	ATT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
2	NC_017405	ATT	2	6	295	300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
3	NC_017405	TTA	2	6	301	306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
4	NC_017405	AAT	2	6	340	345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826796
5	NC_017405	ATT	2	6	457	462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
6	NC_017405	ATA	2	6	476	481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826796
7	NC_017405	CTA	2	6	488	493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826796
8	NC_017405	ATT	3	9	553	561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
9	NC_017405	GGA	2	6	655	660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826796
10	NC_017405	ACA	2	6	707	712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826796
11	NC_017405	CGA	2	6	732	737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826796
12	NC_017405	AAT	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826796
13	NC_017405	TAG	4	12	789	800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826796
14	NC_017405	TTA	2	6	801	806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
15	NC_017405	ATA	2	6	820	825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826796
16	NC_017405	ATT	2	6	847	852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
17	NC_017405	ATT	2	6	1074	1079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826797
18	NC_017405	AAT	2	6	1093	1098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826797
19	NC_017405	ATA	2	6	1148	1153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826797
20	NC_017405	CAA	2	6	1172	1177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826797
21	NC_017405	TAT	2	6	1258	1263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826797
22	NC_017405	CAA	2	6	1295	1300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826797
23	NC_017405	ACT	2	6	1307	1312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826797
24	NC_017405	CTA	3	9	1361	1369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826797
25	NC_017405	TAA	2	6	1535	1540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826798
26	NC_017405	ACA	2	6	1559	1564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826798
27	NC_017405	TAG	2	6	1596	1601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826798
28	NC_017405	TAA	2	6	2268	2273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826799
29	NC_017405	CAG	2	6	2312	2317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826799
30	NC_017405	CTT	2	6	2333	2338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826799
31	NC_017405	CTT	2	6	2362	2367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826799
32	NC_017405	CAA	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826799
33	NC_017405	CAA	2	6	2501	2506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826799
34	NC_017405	AGA	2	6	2511	2516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826799
35	NC_017405	ACA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826799
36	NC_017405	CAT	2	6	2603	2608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826799
37	NC_017405	ATC	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826799
38	NC_017405	TTC	2	6	2676	2681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826799
39	NC_017405	TTA	2	6	2707	2712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826799
40	NC_017405	ATA	2	6	2794	2799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826799
41	NC_017405	AAT	2	6	2849	2854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826799
42	NC_017405	CAA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826799
43	NC_017405	CTA	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826799
44	NC_017405	ATA	2	6	2924	2929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826799
45	NC_017405	AAT	2	6	3919	3924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826800
46	NC_017405	TTA	2	6	3937	3942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
47	NC_017405	TTC	2	6	3956	3961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
48	NC_017405	TCT	2	6	4011	4016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
49	NC_017405	TTA	2	6	4107	4112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
50	NC_017405	TCT	3	9	4239	4247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
51	NC_017405	TCT	2	6	4310	4315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
52	NC_017405	ATA	2	6	4353	4358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826800
53	NC_017405	AAT	2	6	4359	4364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826800
54	NC_017405	TGA	2	6	4614	4619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
55	NC_017405	ATT	2	6	4655	4660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
56	NC_017405	AAT	2	6	4793	4798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826800
57	NC_017405	ATC	2	6	4862	4867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826800
58	NC_017405	TAT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
59	NC_017405	TTA	2	6	5146	5151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
60	NC_017405	CAC	3	9	5194	5202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826800
61	NC_017405	TTG	2	6	5235	5240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826800
62	NC_017405	GAT	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
63	NC_017405	GGA	2	6	5409	5414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826800
64	NC_017405	CTT	2	6	5437	5442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
65	NC_017405	ATT	2	6	5646	5651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
66	NC_017405	TTC	2	6	5675	5680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
67	NC_017405	TCT	2	6	5760	5765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
68	NC_017405	ATG	2	6	5888	5893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
69	NC_017405	AGC	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826800
70	NC_017405	CTC	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826800
71	NC_017405	AAT	2	6	6074	6079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826800
72	NC_017405	GCT	2	6	6235	6240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826800
73	NC_017405	TGA	2	6	6248	6253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
74	NC_017405	ATC	2	6	6275	6280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826800
75	NC_017405	CTT	2	6	6388	6393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
76	NC_017405	CAA	2	6	6421	6426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826800
77	NC_017405	AGT	2	6	6437	6442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
78	NC_017405	TTC	2	6	6578	6583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
79	NC_017405	ATT	2	6	6611	6616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
80	NC_017405	TCC	2	6	6647	6652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826800
81	NC_017405	TTA	2	6	6709	6714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
82	NC_017405	TCA	2	6	6747	6752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826800
83	NC_017405	AGA	2	6	6776	6781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826800
84	NC_017405	TCT	2	6	6798	6803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
85	NC_017405	ATC	2	6	6974	6979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826800
86	NC_017405	TTC	2	6	7136	7141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
87	NC_017405	TCT	2	6	7287	7292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
88	NC_017405	CTT	2	6	7294	7299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
89	NC_017405	ATG	2	6	7327	7332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
90	NC_017405	ATT	2	6	7382	7387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
91	NC_017405	CTT	2	6	7396	7401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
92	NC_017405	AGT	2	6	7446	7451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
93	NC_017405	TGT	2	6	7494	7499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826800
94	NC_017405	TTC	2	6	7517	7522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
95	NC_017405	TCT	2	6	8096	8101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826801
96	NC_017405	ACA	2	6	8177	8182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826801
97	NC_017405	ATA	2	6	8186	8191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826801
98	NC_017405	TAA	2	6	8328	8333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826801
99	NC_017405	ACA	2	6	8366	8371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826801
100	NC_017405	TTC	2	6	8377	8382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826801
101	NC_017405	TAG	2	6	8423	8428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826801
102	NC_017405	TAC	2	6	9093	9098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826802
103	NC_017405	TTA	2	6	9224	9229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826802
104	NC_017405	TAG	2	6	9874	9879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826803
105	NC_017405	TAT	2	6	9919	9924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826803
106	NC_017405	TAA	3	9	9930	9938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826803
107	NC_017405	TTA	2	6	9939	9944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826803
108	NC_017405	CTT	2	6	9996	10001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826803
109	NC_017405	ATA	2	6	10411	10416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826803
110	NC_017405	CCA	2	6	11852	11857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826804
111	NC_017405	AGT	2	6	11922	11927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826804
112	NC_017405	TAA	2	6	11939	11944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826804
113	NC_017405	ATT	2	6	11962	11967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826804
114	NC_017405	AAT	2	6	15158	15163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826805
115	NC_017405	GAT	2	6	15216	15221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826805
116	NC_017405	AGA	2	6	15323	15328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826805
117	NC_017405	GAT	2	6	15568	15573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826806
118	NC_017405	ACC	2	6	15628	15633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826806
119	NC_017405	AAG	2	6	15660	15665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826806
120	NC_017405	ATA	2	6	15711	15716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826806
121	NC_017405	ATT	2	6	15732	15737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826806
122	NC_017405	ACC	2	6	16553	16558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826807
123	NC_017405	TAA	2	6	16665	16670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826807
124	NC_017405	TCA	3	9	16710	16718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826807
125	NC_017405	TAA	2	6	16935	16940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826807
126	NC_017405	AAT	2	6	17094	17099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826807
127	NC_017405	TTA	2	6	17140	17145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826807
128	NC_017405	TAC	2	6	17316	17321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826807
129	NC_017405	ATA	2	6	17368	17373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826807
130	NC_017405	AAT	2	6	17377	17382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826807
131	NC_017405	AGA	2	6	17506	17511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826808
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.