MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-3

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017405	AT	3	6	1193	1198	50 %	50 %	0 %	0 %	387826797
2	NC_017405	AT	3	6	1248	1253	50 %	50 %	0 %	0 %	387826797
3	NC_017405	AT	3	6	1430	1435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017405	AC	3	6	1550	1555	50 %	0 %	0 %	50 %	387826798
5	NC_017405	TA	3	6	1701	1706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017405	TA	4	8	1849	1856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017405	GA	3	6	1874	1879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017405	AG	3	6	1992	1997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017405	TA	3	6	2053	2058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017405	CT	3	6	2221	2226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017405	TA	3	6	3078	3083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017405	TC	3	6	3136	3141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017405	TA	3	6	3204	3209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017405	TA	3	6	3627	3632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017405	TA	4	8	4400	4407	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
16	NC_017405	TA	3	6	4486	4491	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
17	NC_017405	AT	3	6	4716	4721	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
18	NC_017405	AT	4	8	5065	5072	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
19	NC_017405	TA	3	6	5663	5668	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
20	NC_017405	AG	3	6	5866	5871	50 %	0 %	50 %	0 %	387826800
21	NC_017405	AT	3	6	6834	6839	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
22	NC_017405	AT	4	8	6941	6948	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
23	NC_017405	TC	3	6	6983	6988	0 %	50 %	0 %	50 %	387826800
24	NC_017405	TC	3	6	6997	7002	0 %	50 %	0 %	50 %	387826800
25	NC_017405	AT	3	6	7173	7178	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
26	NC_017405	CT	3	6	8216	8221	0 %	50 %	0 %	50 %	387826801
27	NC_017405	TA	4	8	8631	8638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017405	TA	3	6	9253	9258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017405	AT	3	6	9323	9328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017405	TA	3	6	9359	9364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017405	CT	3	6	10468	10473	0 %	50 %	0 %	50 %	387826803
32	NC_017405	AT	3	6	10474	10479	50 %	50 %	0 %	0 %	387826803
33	NC_017405	TA	5	10	10537	10546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017405	CA	3	6	10613	10618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017405	AT	3	6	10625	10630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017405	TA	3	6	10748	10753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017405	CT	3	6	12946	12951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017405	TA	3	6	13318	13323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017405	AG	3	6	13656	13661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017405	AT	3	6	13852	13857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017405	TC	3	6	14147	14152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017405	CT	3	6	14312	14317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017405	CT	3	6	14436	14441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017405	CT	3	6	16042	16047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017405	TA	4	8	16887	16894	50 %	50 %	0 %	0 %	387826807
46	NC_017405	TA	3	6	17021	17026	50 %	50 %	0 %	0 %	387826807
47	NC_017405	AT	3	6	17034	17039	50 %	50 %	0 %	0 %	387826807
48	NC_017405	AT	4	8	17042	17049	50 %	50 %	0 %	0 %	387826807
49	NC_017405	AT	3	6	18120	18125	50 %	50 %	0 %	0 %	387826809
50	NC_017405	TA	3	6	18208	18213	50 %	50 %	0 %	0 %	387826809
51	NC_017405	AT	3	6	18490	18495	50 %	50 %	0 %	0 %	387826809
52	NC_017405	AT	3	6	18582	18587	50 %	50 %	0 %	0 %	387826809
53	NC_017405	TA	3	6	18841	18846	50 %	50 %	0 %	0 %	387826810
54	NC_017405	TA	3	6	19062	19067	50 %	50 %	0 %	0 %	387826810
55	NC_017405	AT	3	6	19203	19208	50 %	50 %	0 %	0 %	387826810
56	NC_017405	AT	3	6	19450	19455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017405	AG	3	6	19473	19478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017405	TC	4	8	19483	19490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017405	TA	3	6	19541	19546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017405	TA	3	6	20831	20836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017405	TG	3	6	21193	21198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017405	AT	3	6	21395	21400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017405	AT	3	6	21410	21415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017405	GA	3	6	21793	21798	50 %	0 %	50 %	0 %	387826811
65	NC_017405	AT	3	6	22216	22221	50 %	50 %	0 %	0 %	387826811
66	NC_017405	TA	4	8	22235	22242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017405	TC	3	6	22273	22278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017405	TA	3	6	22815	22820	50 %	50 %	0 %	0 %	387826812
69	NC_017405	TA	4	8	23399	23406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017405	AT	3	6	23601	23606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017405	TC	3	6	23652	23657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017405	TA	3	6	23722	23727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017405	AT	3	6	23974	23979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017405	CT	3	6	24268	24273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017405	AT	3	6	24429	24434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017405	AG	3	6	25376	25381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017405	AT	3	6	25417	25422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017405	TA	3	6	25424	25429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017405	CA	3	6	25889	25894	50 %	0 %	0 %	50 %	387826814
80	NC_017405	TA	3	6	26331	26336	50 %	50 %	0 %	0 %	387826814
81	NC_017405	AT	4	8	26385	26392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017405	TA	3	6	26436	26441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017405	AT	3	6	26521	26526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017405	AT	3	6	26769	26774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017405	TA	3	6	27076	27081	50 %	50 %	0 %	0 %	387826815
86	NC_017405	AT	3	6	27421	27426	50 %	50 %	0 %	0 %	387826815
87	NC_017405	AT	3	6	27776	27781	50 %	50 %	0 %	0 %	387826816

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.