MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-3

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017405	AT	3	6	1430	1435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017405	TA	3	6	1701	1706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017405	TA	4	8	1849	1856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017405	GA	3	6	1874	1879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017405	AG	3	6	1992	1997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017405	TA	3	6	2053	2058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017405	CT	3	6	2221	2226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017405	TA	3	6	3078	3083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017405	TC	3	6	3136	3141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017405	TA	3	6	3204	3209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017405	TA	3	6	3627	3632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017405	TA	4	8	8631	8638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017405	TA	3	6	9253	9258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017405	AT	3	6	9323	9328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017405	TA	3	6	9359	9364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017405	TA	5	10	10537	10546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017405	CA	3	6	10613	10618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017405	AT	3	6	10625	10630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017405	TA	3	6	10748	10753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017405	CT	3	6	12946	12951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017405	TA	3	6	13318	13323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017405	AG	3	6	13656	13661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017405	AT	3	6	13852	13857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017405	TC	3	6	14147	14152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017405	CT	3	6	14312	14317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017405	CT	3	6	14436	14441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017405	CT	3	6	16042	16047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017405	AT	3	6	19450	19455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017405	AG	3	6	19473	19478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017405	TC	4	8	19483	19490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017405	TA	3	6	19541	19546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017405	TA	3	6	20831	20836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017405	TG	3	6	21193	21198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017405	AT	3	6	21395	21400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017405	AT	3	6	21410	21415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017405	TA	4	8	22235	22242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017405	TC	3	6	22273	22278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017405	TA	4	8	23399	23406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017405	AT	3	6	23601	23606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017405	TC	3	6	23652	23657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017405	TA	3	6	23722	23727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017405	AT	3	6	23974	23979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017405	CT	3	6	24268	24273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017405	AT	3	6	24429	24434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017405	AG	3	6	25376	25381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017405	AT	3	6	25417	25422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017405	TA	3	6	25424	25429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017405	AT	4	8	26385	26392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017405	TA	3	6	26436	26441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017405	AT	3	6	26521	26526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017405	AT	3	6	26769	26774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.