MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-3

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017405	AT	3	6	1193	1198	50 %	50 %	0 %	0 %	387826797
2	NC_017405	AT	3	6	1248	1253	50 %	50 %	0 %	0 %	387826797
3	NC_017405	AC	3	6	1550	1555	50 %	0 %	0 %	50 %	387826798
4	NC_017405	TA	4	8	4400	4407	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
5	NC_017405	TA	3	6	4486	4491	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
6	NC_017405	AT	3	6	4716	4721	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
7	NC_017405	AT	4	8	5065	5072	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
8	NC_017405	TA	3	6	5663	5668	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
9	NC_017405	AG	3	6	5866	5871	50 %	0 %	50 %	0 %	387826800
10	NC_017405	AT	3	6	6834	6839	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
11	NC_017405	AT	4	8	6941	6948	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
12	NC_017405	TC	3	6	6983	6988	0 %	50 %	0 %	50 %	387826800
13	NC_017405	TC	3	6	6997	7002	0 %	50 %	0 %	50 %	387826800
14	NC_017405	AT	3	6	7173	7178	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
15	NC_017405	CT	3	6	8216	8221	0 %	50 %	0 %	50 %	387826801
16	NC_017405	CT	3	6	10468	10473	0 %	50 %	0 %	50 %	387826803
17	NC_017405	AT	3	6	10474	10479	50 %	50 %	0 %	0 %	387826803
18	NC_017405	TA	4	8	16887	16894	50 %	50 %	0 %	0 %	387826807
19	NC_017405	TA	3	6	17021	17026	50 %	50 %	0 %	0 %	387826807
20	NC_017405	AT	3	6	17034	17039	50 %	50 %	0 %	0 %	387826807
21	NC_017405	AT	4	8	17042	17049	50 %	50 %	0 %	0 %	387826807
22	NC_017405	AT	3	6	18120	18125	50 %	50 %	0 %	0 %	387826809
23	NC_017405	TA	3	6	18208	18213	50 %	50 %	0 %	0 %	387826809
24	NC_017405	AT	3	6	18490	18495	50 %	50 %	0 %	0 %	387826809
25	NC_017405	AT	3	6	18582	18587	50 %	50 %	0 %	0 %	387826809
26	NC_017405	TA	3	6	18841	18846	50 %	50 %	0 %	0 %	387826810
27	NC_017405	TA	3	6	19062	19067	50 %	50 %	0 %	0 %	387826810
28	NC_017405	AT	3	6	19203	19208	50 %	50 %	0 %	0 %	387826810
29	NC_017405	GA	3	6	21793	21798	50 %	0 %	50 %	0 %	387826811
30	NC_017405	AT	3	6	22216	22221	50 %	50 %	0 %	0 %	387826811
31	NC_017405	TA	3	6	22815	22820	50 %	50 %	0 %	0 %	387826812
32	NC_017405	CA	3	6	25889	25894	50 %	0 %	0 %	50 %	387826814
33	NC_017405	TA	3	6	26331	26336	50 %	50 %	0 %	0 %	387826814
34	NC_017405	TA	3	6	27076	27081	50 %	50 %	0 %	0 %	387826815
35	NC_017405	AT	3	6	27421	27426	50 %	50 %	0 %	0 %	387826815
36	NC_017405	AT	3	6	27776	27781	50 %	50 %	0 %	0 %	387826816

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.