MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-3

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017405	T	6	6	6	11	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017405	T	8	8	160	167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017405	T	8	8	909	916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017405	A	8	8	935	942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017405	A	7	7	945	951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017405	A	6	6	969	974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017405	A	6	6	1379	1384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017405	T	6	6	1927	1932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017405	T	6	6	2069	2074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017405	T	6	6	2103	2108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017405	T	6	6	3061	3066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017405	T	6	6	3084	3089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017405	A	7	7	3090	3096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017405	T	8	8	3160	3167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017405	T	7	7	3177	3183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017405	A	6	6	3212	3217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017405	A	7	7	3306	3312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017405	A	6	6	3424	3429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017405	A	6	6	3433	3438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017405	T	6	6	3478	3483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017405	A	6	6	3489	3494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017405	T	6	6	3789	3794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017405	A	7	7	3808	3814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017405	T	7	7	7793	7799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017405	A	7	7	7806	7812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017405	T	6	6	7941	7946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017405	A	6	6	7975	7980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017405	T	6	6	7984	7989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017405	T	6	6	8454	8459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017405	T	6	6	8688	8693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017405	T	8	8	8768	8775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017405	A	6	6	8782	8787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017405	T	7	7	8890	8896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017405	T	6	6	8904	8909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017405	T	6	6	8985	8990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017405	T	6	6	9328	9333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017405	A	6	6	9373	9378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017405	A	8	8	9727	9734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017405	T	7	7	9810	9816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017405	A	6	6	9834	9839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017405	A	7	7	10711	10717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017405	T	10	10	11030	11039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017405	A	6	6	11040	11045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017405	T	7	7	11089	11095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017405	T	7	7	11104	11110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017405	A	7	7	11254	11260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017405	T	7	7	11368	11374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017405	A	6	6	11444	11449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017405	T	6	6	11648	11653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017405	T	6	6	11747	11752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017405	T	6	6	12146	12151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017405	A	7	7	12822	12828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017405	A	6	6	12990	12995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017405	A	7	7	13193	13199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017405	T	6	6	13324	13329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017405	T	6	6	13366	13371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017405	A	6	6	13374	13379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017405	T	6	6	13803	13808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017405	T	7	7	13938	13944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017405	T	7	7	14093	14099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017405	T	6	6	14506	14511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017405	A	7	7	14703	14709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017405	T	6	6	15017	15022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017405	A	6	6	15371	15376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017405	A	6	6	15423	15428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017405	A	6	6	15515	15520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017405	A	9	9	15944	15952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017405	A	8	8	16034	16041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017405	T	8	8	16168	16175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017405	T	7	7	19526	19532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017405	A	9	9	19549	19557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017405	T	6	6	19856	19861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017405	A	6	6	20086	20091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017405	T	7	7	20117	20123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017405	T	6	6	20173	20178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017405	A	7	7	20200	20206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017405	T	6	6	20580	20585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017405	T	7	7	20634	20640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017405	A	6	6	20643	20648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017405	T	6	6	20669	20674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017405	A	6	6	20724	20729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017405	T	6	6	20761	20766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017405	A	6	6	20954	20959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017405	T	6	6	21141	21146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017405	A	6	6	22520	22525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017405	T	6	6	23024	23029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017405	A	6	6	23179	23184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017405	T	6	6	23494	23499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017405	T	6	6	23565	23570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017405	T	7	7	23687	23693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017405	T	8	8	23728	23735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017405	T	6	6	23803	23808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017405	T	6	6	23833	23838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017405	A	6	6	24004	24009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017405	T	6	6	24560	24565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017405	T	6	6	24585	24590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017405	T	7	7	24783	24789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017405	T	6	6	25031	25036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017405	A	6	6	25053	25058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017405	A	6	6	25075	25080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017405	T	6	6	25081	25086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017405	A	6	6	25093	25098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017405	A	6	6	25259	25264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017405	T	7	7	25331	25337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017405	T	9	9	25430	25438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017405	T	6	6	26495	26500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017405	T	7	7	26607	26613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017405	A	7	7	26676	26682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017405	A	6	6	26752	26757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017405	A	7	7	26795	26801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017405	A	6	6	26803	26808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017405	A	7	7	26822	26828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017405	T	6	6	27459	27464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017405	T	6	6	28445	28450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017405	T	6	6	28581	28586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017405	A	6	6	28636	28641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017405	T	6	6	28677	28682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.