MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-3

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017405	A	6	6	368	373	100 %	0 %	0 %	0 %	387826796
2	NC_017405	A	6	6	863	868	100 %	0 %	0 %	0 %	387826796
3	NC_017405	A	8	8	1106	1113	100 %	0 %	0 %	0 %	387826797
4	NC_017405	A	6	6	1141	1146	100 %	0 %	0 %	0 %	387826797
5	NC_017405	A	6	6	1202	1207	100 %	0 %	0 %	0 %	387826797
6	NC_017405	A	6	6	1578	1583	100 %	0 %	0 %	0 %	387826798
7	NC_017405	A	6	6	2323	2328	100 %	0 %	0 %	0 %	387826799
8	NC_017405	T	6	6	2337	2342	0 %	100 %	0 %	0 %	387826799
9	NC_017405	T	6	6	2472	2477	0 %	100 %	0 %	0 %	387826799
10	NC_017405	T	6	6	2565	2570	0 %	100 %	0 %	0 %	387826799
11	NC_017405	T	6	6	2727	2732	0 %	100 %	0 %	0 %	387826799
12	NC_017405	A	6	6	2959	2964	100 %	0 %	0 %	0 %	387826799
13	NC_017405	T	7	7	2966	2972	0 %	100 %	0 %	0 %	387826799
14	NC_017405	T	6	6	3972	3977	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
15	NC_017405	T	6	6	4200	4205	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
16	NC_017405	T	6	6	4364	4369	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
17	NC_017405	T	6	6	4495	4500	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
18	NC_017405	A	6	6	4595	4600	100 %	0 %	0 %	0 %	387826800
19	NC_017405	T	6	6	4820	4825	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
20	NC_017405	T	6	6	5017	5022	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
21	NC_017405	T	7	7	5256	5262	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
22	NC_017405	T	6	6	5398	5403	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
23	NC_017405	T	6	6	5512	5517	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
24	NC_017405	T	6	6	5746	5751	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
25	NC_017405	T	7	7	5791	5797	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
26	NC_017405	T	6	6	5826	5831	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
27	NC_017405	A	6	6	5840	5845	100 %	0 %	0 %	0 %	387826800
28	NC_017405	T	7	7	6101	6107	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
29	NC_017405	A	6	6	6171	6176	100 %	0 %	0 %	0 %	387826800
30	NC_017405	T	6	6	6527	6532	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
31	NC_017405	T	7	7	6543	6549	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
32	NC_017405	T	7	7	6715	6721	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
33	NC_017405	T	6	6	6735	6740	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
34	NC_017405	A	8	8	6754	6761	100 %	0 %	0 %	0 %	387826800
35	NC_017405	A	6	6	6845	6850	100 %	0 %	0 %	0 %	387826800
36	NC_017405	T	6	6	6948	6953	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
37	NC_017405	T	6	6	7009	7014	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
38	NC_017405	T	6	6	7180	7185	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
39	NC_017405	T	8	8	7386	7393	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
40	NC_017405	T	6	6	7406	7411	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
41	NC_017405	T	6	6	7590	7595	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
42	NC_017405	A	7	7	7596	7602	100 %	0 %	0 %	0 %	387826800
43	NC_017405	A	6	6	7604	7609	100 %	0 %	0 %	0 %	387826800
44	NC_017405	T	6	6	7611	7616	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
45	NC_017405	T	7	7	7634	7640	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
46	NC_017405	A	7	7	8036	8042	100 %	0 %	0 %	0 %	387826801
47	NC_017405	A	6	6	8144	8149	100 %	0 %	0 %	0 %	387826801
48	NC_017405	A	6	6	8229	8234	100 %	0 %	0 %	0 %	387826801
49	NC_017405	T	6	6	8259	8264	0 %	100 %	0 %	0 %	387826801
50	NC_017405	A	6	6	8310	8315	100 %	0 %	0 %	0 %	387826801
51	NC_017405	T	6	6	8340	8345	0 %	100 %	0 %	0 %	387826801
52	NC_017405	A	7	7	8412	8418	100 %	0 %	0 %	0 %	387826801
53	NC_017405	A	6	6	9113	9118	100 %	0 %	0 %	0 %	387826802
54	NC_017405	A	6	6	9859	9864	100 %	0 %	0 %	0 %	387826803
55	NC_017405	T	6	6	10000	10005	0 %	100 %	0 %	0 %	387826803
56	NC_017405	A	6	6	10322	10327	100 %	0 %	0 %	0 %	387826803
57	NC_017405	A	6	6	11871	11876	100 %	0 %	0 %	0 %	387826804
58	NC_017405	T	6	6	11956	11961	0 %	100 %	0 %	0 %	387826804
59	NC_017405	T	6	6	12008	12013	0 %	100 %	0 %	0 %	387826804
60	NC_017405	T	6	6	15224	15229	0 %	100 %	0 %	0 %	387826805
61	NC_017405	A	7	7	15257	15263	100 %	0 %	0 %	0 %	387826805
62	NC_017405	A	7	7	15742	15748	100 %	0 %	0 %	0 %	387826806
63	NC_017405	A	7	7	16600	16606	100 %	0 %	0 %	0 %	387826807
64	NC_017405	A	9	9	16642	16650	100 %	0 %	0 %	0 %	387826807
65	NC_017405	A	6	6	16687	16692	100 %	0 %	0 %	0 %	387826807
66	NC_017405	A	6	6	16765	16770	100 %	0 %	0 %	0 %	387826807
67	NC_017405	A	6	6	16832	16837	100 %	0 %	0 %	0 %	387826807
68	NC_017405	A	6	6	16960	16965	100 %	0 %	0 %	0 %	387826807
69	NC_017405	A	6	6	17130	17135	100 %	0 %	0 %	0 %	387826807
70	NC_017405	A	7	7	17400	17406	100 %	0 %	0 %	0 %	387826807
71	NC_017405	A	9	9	17445	17453	100 %	0 %	0 %	0 %	387826808
72	NC_017405	A	6	6	17483	17488	100 %	0 %	0 %	0 %	387826808
73	NC_017405	A	7	7	17521	17527	100 %	0 %	0 %	0 %	387826808
74	NC_017405	T	7	7	17638	17644	0 %	100 %	0 %	0 %	387826808
75	NC_017405	T	6	6	17649	17654	0 %	100 %	0 %	0 %	387826808
76	NC_017405	A	6	6	17726	17731	100 %	0 %	0 %	0 %	387826808
77	NC_017405	A	6	6	17786	17791	100 %	0 %	0 %	0 %	387826808
78	NC_017405	A	6	6	17836	17841	100 %	0 %	0 %	0 %	387826808
79	NC_017405	A	6	6	17889	17894	100 %	0 %	0 %	0 %	387826808
80	NC_017405	A	6	6	17924	17929	100 %	0 %	0 %	0 %	387826808
81	NC_017405	A	7	7	17950	17956	100 %	0 %	0 %	0 %	387826808
82	NC_017405	A	6	6	17965	17970	100 %	0 %	0 %	0 %	387826808
83	NC_017405	T	6	6	18032	18037	0 %	100 %	0 %	0 %	387826809
84	NC_017405	A	7	7	18193	18199	100 %	0 %	0 %	0 %	387826809
85	NC_017405	A	6	6	18525	18530	100 %	0 %	0 %	0 %	387826809
86	NC_017405	A	6	6	18652	18657	100 %	0 %	0 %	0 %	387826809
87	NC_017405	A	6	6	18690	18695	100 %	0 %	0 %	0 %	387826809
88	NC_017405	T	6	6	18698	18703	0 %	100 %	0 %	0 %	387826809
89	NC_017405	A	6	6	18813	18818	100 %	0 %	0 %	0 %	387826810
90	NC_017405	A	6	6	19184	19189	100 %	0 %	0 %	0 %	387826810
91	NC_017405	A	6	6	19308	19313	100 %	0 %	0 %	0 %	387826810
92	NC_017405	A	8	8	19359	19366	100 %	0 %	0 %	0 %	387826810
93	NC_017405	A	6	6	19404	19409	100 %	0 %	0 %	0 %	387826810
94	NC_017405	A	6	6	21618	21623	100 %	0 %	0 %	0 %	387826811
95	NC_017405	A	8	8	21687	21694	100 %	0 %	0 %	0 %	387826811
96	NC_017405	A	6	6	21970	21975	100 %	0 %	0 %	0 %	387826811
97	NC_017405	T	7	7	22862	22868	0 %	100 %	0 %	0 %	387826812
98	NC_017405	T	7	7	22948	22954	0 %	100 %	0 %	0 %	387826812
99	NC_017405	A	6	6	22963	22968	100 %	0 %	0 %	0 %	387826812
100	NC_017405	T	6	6	25463	25468	0 %	100 %	0 %	0 %	387826814
101	NC_017405	T	6	6	25519	25524	0 %	100 %	0 %	0 %	387826814
102	NC_017405	T	6	6	25611	25616	0 %	100 %	0 %	0 %	387826814
103	NC_017405	A	6	6	25663	25668	100 %	0 %	0 %	0 %	387826814
104	NC_017405	T	7	7	25815	25821	0 %	100 %	0 %	0 %	387826814
105	NC_017405	A	6	6	25988	25993	100 %	0 %	0 %	0 %	387826814
106	NC_017405	T	8	8	26011	26018	0 %	100 %	0 %	0 %	387826814
107	NC_017405	T	8	8	26176	26183	0 %	100 %	0 %	0 %	387826814
108	NC_017405	T	6	6	26185	26190	0 %	100 %	0 %	0 %	387826814
109	NC_017405	T	7	7	26258	26264	0 %	100 %	0 %	0 %	387826814
110	NC_017405	T	10	10	26343	26352	0 %	100 %	0 %	0 %	387826814
111	NC_017405	T	7	7	27104	27110	0 %	100 %	0 %	0 %	387826815
112	NC_017405	T	6	6	27181	27186	0 %	100 %	0 %	0 %	387826815
113	NC_017405	A	7	7	27196	27202	100 %	0 %	0 %	0 %	387826815
114	NC_017405	A	6	6	27266	27271	100 %	0 %	0 %	0 %	387826815
115	NC_017405	T	8	8	27400	27407	0 %	100 %	0 %	0 %	387826815
116	NC_017405	T	7	7	27866	27872	0 %	100 %	0 %	0 %	387826816
117	NC_017405	A	6	6	27977	27982	100 %	0 %	0 %	0 %	387826816
118	NC_017405	A	6	6	28124	28129	100 %	0 %	0 %	0 %	387826816

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.