MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-1

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017404	AATT	2	8	167	174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017404	ATCA	2	8	214	221	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017404	AGAT	2	8	227	234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017404	AACA	2	8	349	356	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017404	AATT	2	8	736	743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017404	TTTA	2	8	1253	1260	25 %	75 %	0 %	0 %	387826784
7	NC_017404	ATAA	2	8	2009	2016	75 %	25 %	0 %	0 %	387826784
8	NC_017404	TTGT	2	8	2137	2144	0 %	75 %	25 %	0 %	387826784
9	NC_017404	AAAT	2	8	2281	2288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017404	TAAA	2	8	2595	2602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017404	TTGC	2	8	2921	2928	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017404	GATA	2	8	3070	3077	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017404	ATAA	2	8	3427	3434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017404	TTTA	2	8	3652	3659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017404	ATTT	2	8	4395	4402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017404	TACT	2	8	4406	4413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017404	TAAA	2	8	4659	4666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017404	TTTA	2	8	5259	5266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017404	AATT	2	8	5267	5274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017404	TCAA	2	8	5285	5292	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017404	AATC	2	8	5295	5302	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017404	TAAA	2	8	5675	5682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017404	TTTA	2	8	5751	5758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017404	CAAA	2	8	6060	6067	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017404	TAAA	2	8	6076	6083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017404	AACT	2	8	6159	6166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017404	ACAA	2	8	6617	6624	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017404	TAAT	2	8	7063	7070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017404	ATAA	2	8	7077	7084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017404	ATTT	2	8	7167	7174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017404	TGAT	2	8	7217	7224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017404	CCAG	2	8	7254	7261	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017404	CATT	2	8	7304	7311	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017404	TCAG	2	8	7315	7322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017404	ATAA	2	8	7331	7338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017404	TAAA	2	8	7351	7358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017404	TTAA	2	8	7469	7476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017404	AATA	2	8	7735	7742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017404	CTTT	2	8	8078	8085	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017404	TTGT	2	8	8156	8163	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017404	TTAA	2	8	8228	8235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017404	ATAA	2	8	8382	8389	75 %	25 %	0 %	0 %	387826785
43	NC_017404	ATTT	2	8	8595	8602	25 %	75 %	0 %	0 %	387826785
44	NC_017404	ATAA	2	8	8718	8725	75 %	25 %	0 %	0 %	387826786
45	NC_017404	AAAT	2	8	8827	8834	75 %	25 %	0 %	0 %	387826786
46	NC_017404	TAAA	2	8	8925	8932	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017404	ACTA	2	8	9011	9018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017404	CTAT	2	8	9263	9270	25 %	50 %	0 %	25 %	387826787
49	NC_017404	ATTA	2	8	9763	9770	50 %	50 %	0 %	0 %	387826788
50	NC_017404	ATCA	2	8	10054	10061	50 %	25 %	0 %	25 %	387826788
51	NC_017404	ATTT	2	8	10209	10216	25 %	75 %	0 %	0 %	387826788
52	NC_017404	AAAT	2	8	10755	10762	75 %	25 %	0 %	0 %	387826789
53	NC_017404	TTAA	2	8	10992	10999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017404	TATT	2	8	11229	11236	25 %	75 %	0 %	0 %	387826790
55	NC_017404	ATTT	2	8	11250	11257	25 %	75 %	0 %	0 %	387826790
56	NC_017404	ATTA	2	8	11797	11804	50 %	50 %	0 %	0 %	387826790
57	NC_017404	TATT	2	8	12074	12081	25 %	75 %	0 %	0 %	387826790
58	NC_017404	TTTG	2	8	12461	12468	0 %	75 %	25 %	0 %	387826791
59	NC_017404	AAGT	2	8	12490	12497	50 %	25 %	25 %	0 %	387826791
60	NC_017404	GATC	2	8	13225	13232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017404	CTTT	2	8	13259	13266	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017404	TTTG	3	12	13283	13294	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017404	ATTT	2	8	13610	13617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017404	ATTT	2	8	13785	13792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017404	ATTT	2	8	13950	13957	25 %	75 %	0 %	0 %	387826793
66	NC_017404	GAAA	2	8	14771	14778	75 %	0 %	25 %	0 %	387826793
67	NC_017404	ATTG	2	8	22897	22904	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017404	TTTG	2	8	22911	22918	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017404	TTTA	2	8	23061	23068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017404	GATT	2	8	23184	23191	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017404	CAAT	2	8	23419	23426	50 %	25 %	0 %	25 %	387826794
72	NC_017404	GTGG	2	8	23696	23703	0 %	25 %	75 %	0 %	387826794

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.