MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-1

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017404	TTTA	2	8	1253	1260	25 %	75 %	0 %	0 %	387826784
2	NC_017404	ATAA	2	8	2009	2016	75 %	25 %	0 %	0 %	387826784
3	NC_017404	TTGT	2	8	2137	2144	0 %	75 %	25 %	0 %	387826784
4	NC_017404	ATAA	2	8	8382	8389	75 %	25 %	0 %	0 %	387826785
5	NC_017404	ATTT	2	8	8595	8602	25 %	75 %	0 %	0 %	387826785
6	NC_017404	ATAA	2	8	8718	8725	75 %	25 %	0 %	0 %	387826786
7	NC_017404	AAAT	2	8	8827	8834	75 %	25 %	0 %	0 %	387826786
8	NC_017404	CTAT	2	8	9263	9270	25 %	50 %	0 %	25 %	387826787
9	NC_017404	ATTA	2	8	9763	9770	50 %	50 %	0 %	0 %	387826788
10	NC_017404	ATCA	2	8	10054	10061	50 %	25 %	0 %	25 %	387826788
11	NC_017404	ATTT	2	8	10209	10216	25 %	75 %	0 %	0 %	387826788
12	NC_017404	AAAT	2	8	10755	10762	75 %	25 %	0 %	0 %	387826789
13	NC_017404	TATT	2	8	11229	11236	25 %	75 %	0 %	0 %	387826790
14	NC_017404	ATTT	2	8	11250	11257	25 %	75 %	0 %	0 %	387826790
15	NC_017404	ATTA	2	8	11797	11804	50 %	50 %	0 %	0 %	387826790
16	NC_017404	TATT	2	8	12074	12081	25 %	75 %	0 %	0 %	387826790
17	NC_017404	TTTG	2	8	12461	12468	0 %	75 %	25 %	0 %	387826791
18	NC_017404	AAGT	2	8	12490	12497	50 %	25 %	25 %	0 %	387826791
19	NC_017404	ATTT	2	8	13950	13957	25 %	75 %	0 %	0 %	387826793
20	NC_017404	GAAA	2	8	14771	14778	75 %	0 %	25 %	0 %	387826793
21	NC_017404	CAAT	2	8	23419	23426	50 %	25 %	0 %	25 %	387826794
22	NC_017404	GTGG	2	8	23696	23703	0 %	25 %	75 %	0 %	387826794

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.