MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-1

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017404	AT	4	8	401	408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017404	AT	3	6	1188	1193	50 %	50 %	0 %	0 %	387826784
3	NC_017404	TA	3	6	1384	1389	50 %	50 %	0 %	0 %	387826784
4	NC_017404	CT	3	6	1879	1884	0 %	50 %	0 %	50 %	387826784
5	NC_017404	AT	3	6	3455	3460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017404	AT	3	6	3779	3784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017404	AT	3	6	3981	3986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017404	AT	3	6	4534	4539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017404	AT	3	6	4585	4590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017404	TA	3	6	7692	7697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017404	TA	3	6	7710	7715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017404	CT	3	6	7887	7892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017404	AT	3	6	8474	8479	50 %	50 %	0 %	0 %	387826785
14	NC_017404	CT	3	6	8646	8651	0 %	50 %	0 %	50 %	387826785
15	NC_017404	TA	3	6	9069	9074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017404	TA	3	6	9468	9473	50 %	50 %	0 %	0 %	387826787
17	NC_017404	TA	3	6	10490	10495	50 %	50 %	0 %	0 %	387826789
18	NC_017404	TA	3	6	10720	10725	50 %	50 %	0 %	0 %	387826789
19	NC_017404	AT	3	6	10875	10880	50 %	50 %	0 %	0 %	387826789
20	NC_017404	AT	4	8	11338	11345	50 %	50 %	0 %	0 %	387826790
21	NC_017404	AG	3	6	11579	11584	50 %	0 %	50 %	0 %	387826790
22	NC_017404	AT	3	6	11586	11591	50 %	50 %	0 %	0 %	387826790
23	NC_017404	AT	3	6	11682	11687	50 %	50 %	0 %	0 %	387826790
24	NC_017404	TA	3	6	12380	12385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017404	AC	3	6	12389	12394	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017404	AT	6	12	12445	12456	50 %	50 %	0 %	0 %	387826791
27	NC_017404	TA	3	6	13096	13101	50 %	50 %	0 %	0 %	387826792
28	NC_017404	CT	3	6	13139	13144	0 %	50 %	0 %	50 %	387826792
29	NC_017404	TC	3	6	13418	13423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017404	TG	3	6	13453	13458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017404	TA	3	6	14153	14158	50 %	50 %	0 %	0 %	387826793
32	NC_017404	TG	3	6	14659	14664	0 %	50 %	50 %	0 %	387826793
33	NC_017404	AT	3	6	14733	14738	50 %	50 %	0 %	0 %	387826793
34	NC_017404	GA	3	6	24083	24088	50 %	0 %	50 %	0 %	387826794

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.