MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-1

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017404	T	6	6	67	72	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017404	A	7	7	253	259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017404	A	6	6	463	468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017404	A	7	7	707	713	100 %	0 %	0 %	0 %	387826783
5	NC_017404	T	7	7	934	940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017404	T	7	7	1063	1069	0 %	100 %	0 %	0 %	387826784
7	NC_017404	T	7	7	1421	1427	0 %	100 %	0 %	0 %	387826784
8	NC_017404	T	9	9	1516	1524	0 %	100 %	0 %	0 %	387826784
9	NC_017404	A	6	6	1529	1534	100 %	0 %	0 %	0 %	387826784
10	NC_017404	T	7	7	1585	1591	0 %	100 %	0 %	0 %	387826784
11	NC_017404	A	7	7	1610	1616	100 %	0 %	0 %	0 %	387826784
12	NC_017404	T	6	6	1638	1643	0 %	100 %	0 %	0 %	387826784
13	NC_017404	T	6	6	1650	1655	0 %	100 %	0 %	0 %	387826784
14	NC_017404	T	8	8	1682	1689	0 %	100 %	0 %	0 %	387826784
15	NC_017404	T	6	6	1998	2003	0 %	100 %	0 %	0 %	387826784
16	NC_017404	T	6	6	2335	2340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017404	T	6	6	2349	2354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017404	T	6	6	2369	2374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017404	T	6	6	2474	2479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017404	T	6	6	2481	2486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017404	T	6	6	2653	2658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017404	T	6	6	2813	2818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017404	T	6	6	2982	2987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017404	A	7	7	3049	3055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017404	T	6	6	3164	3169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017404	T	7	7	3408	3414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017404	T	6	6	3866	3871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017404	T	6	6	3883	3888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017404	A	6	6	3892	3897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017404	A	7	7	4170	4176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017404	A	6	6	4203	4208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017404	T	7	7	4430	4436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017404	A	6	6	4629	4634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017404	A	6	6	4664	4669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017404	T	7	7	4755	4761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017404	C	6	6	4809	4814	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_017404	T	6	6	5029	5034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017404	A	7	7	5039	5045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017404	T	7	7	5249	5255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017404	A	6	6	5320	5325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017404	A	6	6	5388	5393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017404	A	6	6	5495	5500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017404	T	6	6	5660	5665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017404	A	7	7	5680	5686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017404	T	7	7	5739	5745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017404	A	6	6	5781	5786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017404	T	6	6	5789	5794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017404	A	6	6	5872	5877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017404	T	7	7	5963	5969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017404	A	6	6	6225	6230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017404	A	7	7	6392	6398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017404	A	6	6	6413	6418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017404	T	6	6	6693	6698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017404	A	7	7	6737	6743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017404	T	8	8	6990	6997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017404	A	6	6	7047	7052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017404	T	6	6	7289	7294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017404	T	6	6	7323	7328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017404	T	6	6	7415	7420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017404	T	6	6	7493	7498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017404	T	6	6	7517	7522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017404	T	6	6	7606	7611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017404	T	8	8	7624	7631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017404	T	6	6	7654	7659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017404	T	7	7	7814	7820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017404	T	6	6	7836	7841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017404	T	7	7	7865	7871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017404	T	8	8	8064	8071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017404	A	7	7	8587	8593	100 %	0 %	0 %	0 %	387826785
70	NC_017404	T	7	7	8687	8693	0 %	100 %	0 %	0 %	387826786
71	NC_017404	T	7	7	8856	8862	0 %	100 %	0 %	0 %	387826786
72	NC_017404	T	6	6	8996	9001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017404	T	6	6	9133	9138	0 %	100 %	0 %	0 %	387826787
74	NC_017404	T	6	6	9403	9408	0 %	100 %	0 %	0 %	387826787
75	NC_017404	T	6	6	9424	9429	0 %	100 %	0 %	0 %	387826787
76	NC_017404	T	6	6	9451	9456	0 %	100 %	0 %	0 %	387826787
77	NC_017404	T	6	6	9578	9583	0 %	100 %	0 %	0 %	387826787
78	NC_017404	A	6	6	9670	9675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017404	T	7	7	9823	9829	0 %	100 %	0 %	0 %	387826788
80	NC_017404	T	8	8	10092	10099	0 %	100 %	0 %	0 %	387826788
81	NC_017404	T	6	6	10336	10341	0 %	100 %	0 %	0 %	387826788
82	NC_017404	C	6	6	10397	10402	0 %	0 %	0 %	100 %	387826788
83	NC_017404	T	8	8	10431	10438	0 %	100 %	0 %	0 %	387826788
84	NC_017404	T	7	7	10446	10452	0 %	100 %	0 %	0 %	387826788
85	NC_017404	T	6	6	10775	10780	0 %	100 %	0 %	0 %	387826789
86	NC_017404	A	6	6	10809	10814	100 %	0 %	0 %	0 %	387826789
87	NC_017404	T	7	7	10920	10926	0 %	100 %	0 %	0 %	387826789
88	NC_017404	T	8	8	10931	10938	0 %	100 %	0 %	0 %	387826789
89	NC_017404	T	6	6	10947	10952	0 %	100 %	0 %	0 %	387826789
90	NC_017404	T	6	6	11106	11111	0 %	100 %	0 %	0 %	387826790
91	NC_017404	T	6	6	11235	11240	0 %	100 %	0 %	0 %	387826790
92	NC_017404	T	7	7	11263	11269	0 %	100 %	0 %	0 %	387826790
93	NC_017404	T	7	7	11297	11303	0 %	100 %	0 %	0 %	387826790
94	NC_017404	T	7	7	11495	11501	0 %	100 %	0 %	0 %	387826790
95	NC_017404	T	6	6	11519	11524	0 %	100 %	0 %	0 %	387826790
96	NC_017404	T	7	7	11554	11560	0 %	100 %	0 %	0 %	387826790
97	NC_017404	T	6	6	11661	11666	0 %	100 %	0 %	0 %	387826790
98	NC_017404	T	6	6	11767	11772	0 %	100 %	0 %	0 %	387826790
99	NC_017404	T	6	6	11774	11779	0 %	100 %	0 %	0 %	387826790
100	NC_017404	T	6	6	12180	12185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017404	A	7	7	12186	12192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017404	T	6	6	12364	12369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017404	T	6	6	12573	12578	0 %	100 %	0 %	0 %	387826791
104	NC_017404	T	7	7	12724	12730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017404	T	6	6	12762	12767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017404	A	6	6	12872	12877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017404	T	6	6	12925	12930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017404	T	6	6	13190	13195	0 %	100 %	0 %	0 %	387826792
109	NC_017404	T	6	6	13315	13320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017404	T	6	6	13646	13651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017404	A	6	6	13707	13712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017404	A	6	6	13716	13721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017404	T	6	6	13743	13748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017404	T	6	6	13790	13795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017404	T	6	6	13826	13831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017404	A	6	6	13837	13842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017404	T	6	6	14018	14023	0 %	100 %	0 %	0 %	387826793
118	NC_017404	A	6	6	14221	14226	100 %	0 %	0 %	0 %	387826793
119	NC_017404	A	6	6	14690	14695	100 %	0 %	0 %	0 %	387826793
120	NC_017404	T	6	6	14813	14818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017404	A	6	6	14835	14840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017404	A	7	7	14930	14936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017404	A	6	6	14952	14957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017404	T	7	7	22749	22755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017404	T	6	6	22767	22772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017404	T	7	7	22806	22812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017404	C	6	6	22848	22853	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_017404	T	6	6	23006	23011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017404	T	7	7	23120	23126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017404	A	7	7	23136	23142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017404	T	7	7	23223	23229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017404	A	7	7	23311	23317	100 %	0 %	0 %	0 %	387826794
133	NC_017404	G	6	6	23470	23475	0 %	0 %	100 %	0 %	387826794
134	NC_017404	A	7	7	23511	23517	100 %	0 %	0 %	0 %	387826794
135	NC_017404	A	6	6	23551	23556	100 %	0 %	0 %	0 %	387826794
136	NC_017404	A	7	7	23568	23574	100 %	0 %	0 %	0 %	387826794

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.