MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 chromosome

Total Repeats: 13260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017403	TAT	2	6	48	53	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017403	ACT	2	6	72	77	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017403	TTA	2	6	105	110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017403	ACT	2	6	150	155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017403	CAA	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017403	ACT	2	6	477	482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017403	AAC	2	6	497	502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017403	TTC	2	6	523	528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017403	TAA	2	6	566	571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017403	CTT	2	6	598	603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017403	GTT	2	6	686	691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017403	ATT	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017403	CTT	2	6	836	841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825663
14	NC_017403	TCA	2	6	870	875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825663
15	NC_017403	ATA	2	6	977	982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825663
16	NC_017403	AGC	2	6	988	993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825663
17	NC_017403	ATT	2	6	1018	1023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825663
18	NC_017403	GTT	2	6	1082	1087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825663
19	NC_017403	ATT	2	6	1129	1134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825663
20	NC_017403	TCC	2	6	1189	1194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387825663
21	NC_017403	TAA	2	6	1207	1212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825663
22	NC_017403	TCA	2	6	1415	1420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825663
23	NC_017403	ATC	2	6	1552	1557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825663
24	NC_017403	ACA	2	6	1884	1889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825664
25	NC_017403	TAA	2	6	1931	1936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825664
26	NC_017403	TCT	2	6	1956	1961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825664
27	NC_017403	TAT	2	6	2088	2093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825664
28	NC_017403	TCA	2	6	2095	2100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825664
29	NC_017403	CAG	2	6	2151	2156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825664
30	NC_017403	GAA	2	6	2194	2199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825664
31	NC_017403	AGA	2	6	2301	2306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825664
32	NC_017403	TAT	2	6	2486	2491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825664
33	NC_017403	TCT	2	6	2572	2577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825664
34	NC_017403	TTG	2	6	2918	2923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825664
35	NC_017403	ACC	2	6	2928	2933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825664
36	NC_017403	AAG	2	6	2993	2998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825664
37	NC_017403	TAA	2	6	3007	3012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825664
38	NC_017403	CTT	2	6	3017	3022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825664
39	NC_017403	TTG	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825664
40	NC_017403	TTA	2	6	3279	3284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017403	TAA	2	6	3314	3319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017403	ATT	2	6	3340	3345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017403	AAT	2	6	3357	3362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017403	GAA	2	6	3382	3387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017403	TGA	2	6	3441	3446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825665
46	NC_017403	GAT	2	6	3447	3452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825665
47	NC_017403	TAA	2	6	3551	3556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
48	NC_017403	ATT	2	6	3572	3577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825665
49	NC_017403	ATT	2	6	3637	3642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825665
50	NC_017403	TAA	2	6	3665	3670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
51	NC_017403	TGG	2	6	3822	3827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825665
52	NC_017403	ATA	2	6	3856	3861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
53	NC_017403	TAA	2	6	3896	3901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
54	NC_017403	TGA	2	6	3930	3935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825665
55	NC_017403	TAA	2	6	3960	3965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
56	NC_017403	AAT	2	6	3966	3971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
57	NC_017403	AAT	2	6	4107	4112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
58	NC_017403	TAT	2	6	4224	4229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825665
59	NC_017403	ATC	2	6	4378	4383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825665
60	NC_017403	TAT	2	6	4435	4440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825665
61	NC_017403	ATG	2	6	4475	4480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825665
62	NC_017403	GAT	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825665
63	NC_017403	TAC	2	6	4668	4673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825665
64	NC_017403	ATT	2	6	4692	4697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825665
65	NC_017403	ACA	2	6	4783	4788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825665
66	NC_017403	ATC	2	6	4812	4817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825665
67	NC_017403	TAA	2	6	4908	4913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
68	NC_017403	AGT	2	6	4932	4937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825665
69	NC_017403	TTC	2	6	4995	5000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825665
70	NC_017403	GGA	2	6	5002	5007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825665
71	NC_017403	TAA	2	6	5028	5033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
72	NC_017403	TTG	2	6	5039	5044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825665
73	NC_017403	CTA	2	6	5134	5139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825665
74	NC_017403	TAA	2	6	5156	5161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
75	NC_017403	TAA	2	6	5178	5183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
76	NC_017403	ATA	2	6	5203	5208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017403	AAT	2	6	5242	5247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017403	TTC	2	6	5253	5258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825666
79	NC_017403	TAC	2	6	5337	5342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825666
80	NC_017403	TCA	2	6	5389	5394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825666
81	NC_017403	CTT	2	6	5425	5430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825666
82	NC_017403	CTT	2	6	5508	5513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825666
83	NC_017403	CTT	2	6	5537	5542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825666
84	NC_017403	TAA	2	6	5658	5663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825666
85	NC_017403	TCG	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825666
86	NC_017403	ATT	2	6	5691	5696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825666
87	NC_017403	CCA	2	6	5732	5737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825666
88	NC_017403	TAA	2	6	6185	6190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825666
89	NC_017403	CTT	2	6	6206	6211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825666
90	NC_017403	TAC	2	6	6228	6233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825666
91	NC_017403	ACC	2	6	6362	6367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825667
92	NC_017403	TAT	2	6	6577	6582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825667
93	NC_017403	TTA	2	6	6637	6642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825667
94	NC_017403	ATT	2	6	6815	6820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825667
95	NC_017403	TAG	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825667
96	NC_017403	ACA	2	6	6919	6924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825667
97	NC_017403	CTA	2	6	6934	6939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825667
98	NC_017403	AAT	2	6	6959	6964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825667
99	NC_017403	CAT	2	6	7015	7020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825667
100	NC_017403	TAA	2	6	7021	7026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825667
101	NC_017403	TAA	2	6	7125	7130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825667
102	NC_017403	ATA	2	6	7162	7167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825667
103	NC_017403	TAA	2	6	7177	7182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825667
104	NC_017403	ATT	2	6	7622	7627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825668
105	NC_017403	TCT	2	6	7726	7731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825668
106	NC_017403	ATC	2	6	7829	7834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825668
107	NC_017403	CTT	2	6	7985	7990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825668
108	NC_017403	TCA	2	6	8007	8012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825668
109	NC_017403	AAT	2	6	8061	8066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825668
110	NC_017403	TAT	2	6	8071	8076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825668
111	NC_017403	TCA	2	6	8226	8231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825668
112	NC_017403	TGC	2	6	8241	8246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825668
113	NC_017403	TAT	2	6	8266	8271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825668
114	NC_017403	AAT	2	6	8337	8342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017403	TAT	2	6	8371	8376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017403	TAA	2	6	8389	8394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017403	TAC	2	6	8507	8512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825669
118	NC_017403	ATT	2	6	8595	8600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825669
119	NC_017403	TAA	2	6	8694	8699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825669
120	NC_017403	GAA	2	6	8747	8752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825669
121	NC_017403	ATA	2	6	8855	8860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825669
122	NC_017403	CTC	2	6	8928	8933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387825669
123	NC_017403	TAA	2	6	8949	8954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825669
124	NC_017403	AAT	2	6	9197	9202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825670
125	NC_017403	TAA	2	6	9220	9225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825670
126	NC_017403	ATA	2	6	9228	9233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825670
127	NC_017403	TGA	2	6	9245	9250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825670
128	NC_017403	AAC	2	6	9329	9334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825670
129	NC_017403	CAA	2	6	9422	9427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825670
130	NC_017403	TAA	2	6	9452	9457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825670
131	NC_017403	AAT	2	6	9458	9463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825670
132	NC_017403	TTA	2	6	9699	9704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825670
133	NC_017403	AGT	2	6	9803	9808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825670
134	NC_017403	CCA	2	6	9810	9815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825670
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256	NC_017403	AAT	2	6	18652	18657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825681
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258	NC_017403	ATC	2	6	18774	18779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825681
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260	NC_017403	ACT	2	6	19056	19061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825681
261	NC_017403	TCT	2	6	19132	19137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825681
262	NC_017403	AGC	2	6	19430	19435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825681
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265	NC_017403	ATA	3	9	19461	19469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825681
266	NC_017403	CAA	2	6	19495	19500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825681
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268	NC_017403	TTC	2	6	19540	19545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825681
269	NC_017403	AGA	2	6	19547	19552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825681
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272	NC_017403	ATT	2	6	19898	19903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825681
273	NC_017403	TCC	2	6	19985	19990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
274	NC_017403	AAT	2	6	20031	20036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_017403	CTT	2	6	20115	20120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825682
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282	NC_017403	AAC	2	6	20553	20558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825682
283	NC_017403	ACT	2	6	20562	20567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825682
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306	NC_017403	CCT	2	6	22010	22015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387825684
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