MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-9

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017402	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017402	AAATGG	2	12	2391	2402	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387827869
3	NC_017402	CTGATA	2	12	2987	2998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387827870
4	NC_017402	GAATTT	2	12	5209	5220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387827872
5	NC_017402	TGAACT	2	12	5247	5258	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387827872
6	NC_017402	ACAGAA	2	12	13724	13735	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387827883
7	NC_017402	TAAAAA	2	12	15143	15154	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017402	AATTTA	2	12	16837	16848	50 %	50 %	0 %	0 %	387827889
9	NC_017402	TAATGA	2	12	17172	17183	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387827890
10	NC_017402	CAAAAA	2	12	17422	17433	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387827890
11	NC_017402	ATATGT	2	12	23021	23032	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017402	TAGTGT	2	12	24517	24528	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387827897
13	NC_017402	AAGTAA	2	12	25851	25862	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017402	AAAACA	2	12	27263	27274	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387827901
15	NC_017402	AGAAAA	2	12	27320	27331	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387827901
16	NC_017402	AAAACA	2	12	27347	27358	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387827901
17	NC_017402	AAGATA	2	12	27766	27777	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387827901

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.